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Análise in silico da expressão diferencial de genes em Arachis magna sob estresse hídrico. Infoteca-e
BRASILEIRO, A. C. M.; SANTOS, C. M. R.; MORGANTE, C. V.; MARTINS, A. da C. Q.; DA SILVA, F. R.; ARAÚJO, A. C. G. de; BERTIOLI, D. J.; LEAL-BERTIOLI, S. C. de M.; GUIMARÃES, P. M..
2008
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Arachis magna; Melhoramento genético; Análise; In silico; Estresse hídrico.
Ano: 2008 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/191229
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Análise in silico da expressão gênica diferencial de Arachis stenosperma inoculado com Meloidogyne arenaria. Infoteca-e
GUIMARÃES, P. M.; PROITE, K.; LAEL-BERTIOLI, S. C.; BERTIOLI, D..
2005
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Arachis stenosperma; Amendoim; Meloidogyne arenaria; Meloidoginose; Doença; Expressão gênica diferencial; Análise; In silico; Ground nut; Disease; Differential genic expression; Analysis.
Ano: 2005 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/187039
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Análise in silico e in vivo da via de isoprenóides em café. Repositório Alice
TISKI, I.; PEREIRA, L. F. P.; POT, D.; MARRACCINI, P. R.; VIEIRA, L. G. E..
Os diterpenos cafestol e caveol, presentes na fração lipídica em grãos de café, originam-se da via de síntese de isoprenóides. Estes compostos são sintetizados em todos os organismos, sendo abundantes em plantas com cerca de 10 mil componentes relatados. Apesar da diversidade de funções e estruturas todos os isoprenóides derivam de cinco comuns átomos de carbono, o isopentenil difosfato (IPP) e do isômero dimetilalil difosfato (DMAPP). Em vegetais superiores, duas vias localizadas em compartimentos intracelulares separados estão envolvidas na biossíntese de IPP e DMAPP. No citosol, IPP é derivado da via do ácido mevalônico (MVA) e no plastídeo, IPP é formado pela via do metileritritol fosfato (MEP ou não mevalonato). Com a disponibilidade das seqüências...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coffea; Coffee; Café; Análise; Analysis; In silico; In vivo; MEP; MVA..
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906049
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Categorização funcional de sequências expressas envolvidas na defesa do cafeeiro a doenças. Repositório Alice
ALVARENGA, S. M.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S..
O entendimento dos mecanismos de defesa e da interação do cafeeiro com patógenos pode ser útil no desenvolvimento de novas alternativas para um controle eficiente das doenças. Tem sido demonstrado, em diferentes espécies de plantas, que genes R, responsáveis pelo reconhecimento dos patógenos, apresentam domínios conservados, como NBS (Nucleotide Binding Site) e LRR (Leucine Rich Repeat). Dessa forma, nesse trabalho, seqüências do Projeto Brasileiro do Genoma Café, previamente identificadas como contendo domínios NBS e LRR, foram funcionalmente categorizadas. A categorização foi realizada em 140 EST-contigs, sendo que 99 foram classificados em pelo menos uma das categorias funcionais do Gene Ontology. Essa categorização permitiu associar os produtos...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genoma; In silico; Mineração de dados; ESTs; Classificação funcional; Doença de planta..
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/903148
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In silico, in vitro and in vivo toxicological assessment of BPP-BrachyNH2, A vasoactive proline-rich oligopeptide from Brachycephalus ephippium. Repositório Alice
ARCANJO, D. D. R.; MAFUD, A. C.; VASCONCELOS, A. G.; SILVA-FILHO, J. C. da; AMARAL, M. P. M.; BRITO, L. M.; BEMQUERER, M. P.; KÜCKELHAUS, S. A. S.; PLÁCIDO, A. P.; DELERUE-MATOS, C.; VALE, N.; MASCARENHAS, Y. P.; CARVALHO, F. A. A.; OLIVEIRA, A. P.; LEITE, J. R. S. A..
bitstream/item/181037/1/Arcanjo2017-Article-InSilicoInVitroAndInVivoToxico.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: MTT; In silico; PkCSM; Proline-rich oligopeptide; Toxicological; Cytotoxicity.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1081643
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Optimización de la amplificación por PCR del gen de la endoglucanasa de Ralstonia solanacearum Rev. Protección Veg.
Naranjo,Eber; Otero,Adriana; Martínez-Zubiaur,Yamila.
El esquema de clasificación actual del agente etiológico de la marchitez bacteriana (Ralstonia solanacearum) se basa en el análisis de la secuencia del gen de la endoglucanasa de esta bacteria. El objetivo de este estudio fue optimizar la amplificación por PCR de este gen. Las condiciones de PCR fueron predeterminadas in silico con el empleo del programa OLIGO versión 7.53. Se estimó el efecto de la concentración celular en la eficiencia de la amplificación con diluciones seriadas de suspensiones bacterianas de R. solanacearum. Se evaluó un protocolo de PCR de dos pasos con el empleo del kit comercial GoTaq® DNA Polimerasa para los ensayos in vitro. La concentración celular fue un factor crítico para la amplificación con un valor óptimo de 10(8) UFC.ml-1....
Tipo: Journal article Palavras-chave: Marchitez bacteriana; In silico; In vitro.
Ano: 2013 URL: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1010-27522013000300008
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Two LTR retrotransposon elements within the abscisic acid gene cluster in Botrytis cinerea B05.10, but not in SAS56 Electron. J. Biotechnol.
Zhao,Ming; Zhou,Jin yan; Tan,You jiu; Song,Wei wei; Li,Zhi dong; Tan,Hong.
The plant hormone abscisic acid has huge economic potential and can be applied in agriculture and forestry for it is considered to be involved in plant resistance to stresses such as cold, heat, salinity, drought, pathogens and wounding. Now overproducing strains of Botrytis cinerea are used for biotechnological production of abscisic acid. An LTR retrotransposon, Boty-aba, and a solo LTR were identified by in silico genomic sequence analysis, and both were detected within the abscisic acid gene cluster in B. cinerea B05.10, but not in B. cinerea SAS56. Boty-aba contains a pair of LTRs and two internal genes. The LTRs and the first gene have features characteristic of Ty3/gypsy LTR retrotransposons. The second gene is a novel gene, named brtn, which...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Botrytis cinerea; Genomic sequence analysis; In silico; LTR retrotransposon.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582009000100007
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