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A complementary strategy for the conservation of native forest tree species: retrieval and conservation of threatened ecotypes PFB - Pesquisa Florestal Brasileira
Shimizu, Jarbas Yukio.
Deforestation has become rampant in recent years in Brazil and has affected all biomes where manyspecies are threatened to extinction due to destruction natural habitats. Government initiatives to hinder thechain of destruction include two main lines of action: to establish conservation units (parks, reserves andothers); and programs to encourage plantation of native tree species for reclamation of degraded ecosystems, restoration of forests on permanent protection areas (riparian, and steep slope environments), and establishment of “legal reserves” (a mandatory forest reserve on at least 20% of the land area). Conservation units are effectivein conserving natural ecosystems. However, they are of limited value for the conservation of ecotypes, sincetheir...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Inbreeding; Outbreeding; Extinction; Gene conservation Endogamia; Exogamia; Extinção; Conservação; Germoplasma.
Ano: 2010 URL: http://pfb.cnpf.embrapa.br/pfb/index.php/pfb/article/view/125
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Applications and implications of phylogeography for canid conservation Mastozool. neotrop.
Martinez,Pablo A; Zurano,Juan P; Molina,Wagner F; Bidau,Claudio J.
Phylogeographic studies are currently used to infer historical demographic processes such as gene fow, determination of effective population sizes, colonisation dynamics, and population botlenecks, as well as for the determination of species boundaries and the identification of possible conservation units. We present a review of the main contributions of this approach, and its applications and implications for canid conservation. Studies performed in canids have shown that the number of named subspecies is often larger than that of phylogeographic units. In recent times, the fragmentation of habitats has increased and one of the major concerns of conservation biologists is the occurrence of inbreeding. Large-sized canids have demonstrated to have enough...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Canidae; Conservation units; Genetics; Hybridisation; Inbreeding.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0327-93832013000100005
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Avaliação da endogamia de uma população de aves de postura White Leghorn. Repositório Alice
ROSA, J. O.; VARGAS, G.; BERNARDES, P. A.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P..
2013
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Inbreeding; Layers; Mating; Galinha para postura; Endogamia; Acasalamento.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/968179
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Cipreste para madeira: alto incremento volumétrico com material genético apropriado. Repositório Alice
SHIMIZU, J. Y.; PINTO JUNIOR, J. E.; RIBATSKI, G..
Cupressus lusitanica Mill. é uma das espécies florestais de alto potencial como fonte de madeira para usos múltiplos no Brasil, principalmente em forma de madeira serrada para marcenaria. A espécie apresenta bom desenvolvimento na Serra da Mantiqueira, no sul de Minas Gerais, a mais de 1.000m de altitude, onde o clima é frio, com alta umidade. Visando aumentar a sua produtividade, foram introduzidas progênies de matrizes selecionadas de diversas procedências colombianas e produzidas em um pomar clonal instalado em Popayan, Colômbia. Esse material foi plantado na forma de teste de progênie, juntamente com uma testemunha comercial, além de progênies de várias matrizes selecionadas no local. Aos dez anos de idade, as progênies das matrizes selecionadas...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Cupressus lusitanica; Procedencia; Progenie; Endogamia; Base genetica; Progeny; Provenance; Inbreeding; Genetic base.
Ano: 1995 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/282151
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ClonEstiMate, a Bayesian method for quantifying rates of clonality of populations genotyped at two-time steps ArchiMer
Becheler, Ronan; Masson, Jean-pierre; Arnaud-haond, Sophie; Halkett, Fabien; Mariette, Stephanie; Guillemin, Marie-laure; Valero, Myriam; Destombe, Christophe; Stoeckel, Solenn.
Partial clonality is commonly used in Eukaryotes and has large consequences for their evolution and ecology. Assessing accurately the relative importance of clonal versus sexual reproduction matters for studying and managing such species. Here, we proposed a Bayesian approach, ClonEstiMate, to infer rates of clonality c from populations sampled twice over a short time interval, ideally one generation time. The method relies on the likelihood of the transitions between genotype frequencies of ancestral and descendent populations, using an extended Wright-Fisher model explicitly integrating reproductive modes. Our model provides posterior probability distribution of inferred c, given the assumed rates of mutation, as well as inbreeding and selfing when...
Tipo: Text Palavras-chave: Inbreeding; Instantaneous inference; Population genetics model; Rate of asexuality; Selfing.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00390/50187/50810.pdf
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Consangüinidade média, ate 1980, da população de suínos Duroc de pedigree do Brasil. Infoteca-e
SARALEGUI LARRAMBEBERE, W. H.; COSTA, C. N..
1982
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Suíno; Raça Duroc; Melhoramento genético; Consangüinidade; Swine; Genetics; Inbreeding.
Ano: 1982 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/435104
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Consanguinidade média, ate 1980, da população de suínos Hampshire de pedigree do Brasil. Infoteca-e
SARALEGUI LARRAMBEBERE, W. H.; COSTA, C. N..
1983
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Suíno; Raça Hampshire; Consanguinidade; Swine; Inbreeding.
Ano: 1983 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/435131
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Detailed insights into pan-European population structure and inbreeding in wild and hatchery Pacific oysters (Crassostrea gigas) revealed by genome-wide SNP data ArchiMer
Vendrami, David L. J.; Houston, Ross D.; Gharbi, Karim; Telesca, Luca; Gutierrez, Alejandro P.; Gurney-smith, Helen; Hasegawa, Natsuki; Boudry, Pierre; Hoffman, Joseph I..
Cultivated bivalves are important not only because of their economic value, but also due to their impacts on natural ecosystems. The Pacific oyster (Crassostrea gigas) is the world's most heavily cultivated shellfish species and has been introduced to all continents except Antarctica for aquaculture. We therefore used a medium-density single nucleotide polymorphism (SNP) array to investigate the genetic structure of this species in Europe, where it was introduced during the 1960s and has since become a prolific invader of coastal ecosystems across the continent. We analyzed 21,499 polymorphic SNPs in 232 individuals from 23 localities spanning a latitudinal cline from Portugal to Norway and including the source populations of Japan and Canada. We confirmed...
Tipo: Text Palavras-chave: Aquaculture; Crassostrea gigas; Genetic structure; High-density genotyping array; Inbreeding; Pacific oyster; Restriction site-associated DNA (RAD) sequencing; Single nucleotide polymorphism (SNP).
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00484/59561/62557.pdf
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Diversidad genética y patrón de cruzamiento en poblaciones naturales de Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco Colegio de Postgraduados
Cruz Nicolas, Jorge.
Se determinó la estructura de la diversidad genética y el patrón de cruzamiento en poblaciones naturales de Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco en México con base en información de isoenzimas. Para evaluar la diversidad genética se utilizó una muestra de 11 poblaciones naturales distribuidas en diferentes regiones geográficas (noroeste, noreste y centro) del país; el patrón de cruzamiento y su efecto sobre el nivel de endogamia sólo se evaluó en una muestra de tres poblaciones, representativas de cada región geográfica. Se encontró una amplia diversidad genética a nivel de especie (83.3% de loci polimórficos y un promedio de 2.9 alelos por locus), pero reducida a nivel de poblaciones (28.3 % de loci polimórficos y 1.52 alelos por locus), especialmente en...
Tipo: Tesis Palavras-chave: Abeto Douglas; Distancias genéticas; Diversidad genética; Endogamia; Isoenzimas; Polimorfismo; Polinización cruzada; Maestría; Genética; Cross-pollination; Douglas-fir; Genetic distances; Genetic diversity; Inbreeding; Isozymes; Polymorphism.
Ano: 2007 URL: http://hdl.handle.net/10521/1587
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Diversidade e estrutura genética de Swietenia macrophylla King em floresta manejada na Amazônia sul-ocidental. Repositório Alice
OLIVEIRA, S. S. de.
Swietenia macrophylla King é uma espécie monoica, alógama, e ameaçada de extinção com alto valor econômico para a indústria madeireira. O objetivo desse estudo foi conhecer a diversidade e estrutura genética de Swietenia macrophylla King em floresta manejada na Amazônia Sul-Ocidental. Foram coletados material vegetal de 83 indivíduos adultos e 187 juvenis. Foram testatos 12 marcadores microssatélites para a caracterização da diversidade e estruturação genética espacial. Foi realizada a análise de parentesco pela determinação dos padrões de fluxo de pólen e distância de dispersão. Foi estimada a taxa efetiva de autofecundação, a taxa de cruzamento de indivíduos aparentados e não aparentados. Foi avaliado o sistema reprodutivo da espécie com base no método...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Fitomejoramiento; Variación genética; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; Amazônia Sul-Ocidental; Melhoramento Genético Vegetal; Variação Genética; Endogamia; Mogno; Swietenia Macrophylla; Marcador Molecular; Plant breeding; Genetic variation; Inbreeding; Genetic markers; Microsatellite repeats.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110195
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Diversidade genética e estrutura populacional de duas espécies de bambu do gênero Guadua na região sul-ocidental da Amazônia. Repositório Alice
SILVA, S. M. M..
O conhecimento populacional é fundamental para que as espécies sejam conservadas, manejadas e protegidas. Estudos sobre diversidade genética e estrutura populacional de plantas como os bambus amazônicos (Guadua) dão subsídios para a conservação das espécies tanto in situ quanto ex situ. Plantas nativas como os bambus são um importante componente no contexto florestal, formando ecossistemas únicos, pouco estudados, que servem de abrigo para muitas espécies que vivem relacionadas a eles e também podem ser usados economicamente para diversos fins. Este trabalho teve como objetivo, estudar a diversidade genética e estrutura populacional de quatro populações (P1, P2, P3 e P4) de Guadua aff. chaparensis, localizadas nos municípios de Bujari e Sena Madureira, e...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Fitomejoramiento; Guadua aff chaparensis; Guadua aff lynnclarkiae; Variación genética; Similaridade genética; Similitud genética; Sondeo de la Población Actual; Heterozigozidade; Heterocigosidad; Programas de computadores; Análisis por computador; Structure; Bujari (AC); Sena Madureira (AC); Porto Acre (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental; Melhoramento Genético Vegetal; Bambu; Variação Genética; Levantamento Populacional; Endogamia; Programa de Computador; Análise Comparativa; Plant breeding; Bamboos; Guadua; Genetic variation; Current Population Survey; Inbreeding; Heterozygosity; Genetic similarity; Computer software; Computer analysis.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110082
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Efeito da endogamia sobre peso ao nascer em ovinos da raça Somalis. Repositório Alice
AGUIAR, A. L. de; FACO, O.; FACO, O.; SILVA, K. de M.; SHIOTSUKI, L.; COSTA, A. C.; GALVÃO, M. A. A.; ALBUQUERQUE, M. A. M. de.
Resumo: Objetivou-se descrever a estrutura populacional, endogamia e quantificar o seu efeito sobre o peso ao nascer de ovinos da raça Somalis Brasileira. Dados genealógicos de 1381 ovinos da raça Somalis nascidos entre 1997 a 2014pertencente a EMBRAPA Caprinos e Ovinos em Sobral?CE foram analisados usando o software Endog (v.4.6) para a obtenção da taxa de endogamia F e para aumento da endogamia. Não houve significância da endogamia sobre o peso ao nascer. [Inbreeding effects on birthweight in Somalis sheep breed]. Abstract: The aim of this study was to describe the population structure, inbreeding and to quantify their effect for birthweight in Somalis sheep breed. Genealogical data of 1381 of Somalis sheep breed born between 1997 to 2014 belonging to...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Somalis; Production losses; Ovino; Peso ao nascer; Endogamia; Perda; Produção animal; Sheep; Inbreeding; Brazil; Birth weight.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1025602
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Effective population size and genetic gain expected in a population of Coffea canephora. Repositório Alice
MISTRO, J. C.; RESENDE, M. D. V. de; FAZUOLI, L. C.; VENCOVSKY, R..
This work aimed to study the effective population size and genetic gain in a population of robusta coffee (Coffea canephora Pierre) and verify the possibility of using recurrent selection. The experiment comprised 25 treatments, consisting of 21 C. canephora progenies and four C. arabica (cultivars) grown in Brazil. The experimental design was a 5x5 quadruple balanced lattice, with 24 replications, with one plant per plot. Six harvests were performed in each plant. Statistical analysis was carried out using the mixed model methodology. The analysis showed high additive genetic variability, and the magnitude of the additive components prevailed over that of the dominance components. These facts revealed the plant population liability to undergo recurrent...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Robusta coffee; Additive components; Genética quantitativa; Café; Endogamia; Quantitative genetics; Inbreeding.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110351
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Estimates of genetic variability and inbreeding in experimentally selected populations of European sea bass ArchiMer
Hillen, J. E. J.; Coscia, I.; Vandeputte, Marc; Herten, K.; Hellemans, B.; Maroso, F.; Vergnet, Alain; Allal, Francois; Maes, G. E.; Volckaert, F. A. M..
The aquaculture industry has increasingly aimed at improving economically important traits like growth, feed efficiency and resistance to infections. Artificial selection represents an important window of opportunity to significantly improve production. However, the pitfall is that selection will reduce genetic diversity and increase inbreeding in the farmed stocks. Genetic tools are very useful in this context as they provide accurate measures of genetic diversity together with many additional insights in the stock status and the selection process. In this study we assessed the level of genetic variability and relatedness over several generations of two lines of experimentally selected European sea bass (Dicentrarchus labrax L.). The first line was...
Tipo: Text Palavras-chave: Artificial selection; DdRAD; Fish; Genetic diversity; Genomics; Inbreeding.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00392/50314/50993.pdf
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Estrutura populacional de ovinos da raça Morada Nova. Repositório Alice
ARANDAS, J. K. G.; RIBEIRO, M. N.; PIMENTA FILHO, E. C.; SILVA, R. C. B. da; FACO, O.; ESTEVES, S. N..
Resumo: O Presente estudo teve como objetivo avaliar a situação de risco de 36 rebanhos de ovinos da raça Morada Nova no estado de Pernambuco, Paraíba, Rio Grande do Norte, Ceará e São Paulo, Brasil. Com está finalidade foi feito um levantamento do número de animais machos e fêmeas em reprodução dos 36 rebanhos avaliados e estimou-se número efetivo (Ne), taxa de consanguinidade (?F) e os valores de panmixia (PAM). Todos os rebanhos estudados apresentaram o Ne abaixo do valor mínimo estabelecido pela FAO (50) e a taxa de consanguinidade acima da média recomendada pela FAO (1%). Os resultados sugerem a necessidade de estabelecer um plano de gestão genética para todos os rebanhos, como forma de manutenção da variabilidade genética remanescente. Population...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Consanguinidade; Genética populacional; Risco de extinção; Brasil; Ovino; Raça Morada Nova; Melhoramento genético animal; Sheep; Inbreeding; Animal breeding.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/939217
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Genealogical and molecular analysis of an Argentinean Angus seedstock herd JBAG
Corva,P.M; Colavita,M.I; Legaz,G; Martínez,M.
Introduced in Argentina from the British Isles in 1879, the Angus progressively became the most popular beef cattle breed in the country. In this article the analysis of genealogical and molecular information generated in the registration process of progenies from an Angus seedstock herd is presented. The objectives were to analyze the genetic structure of the herd, and to use the acquired information to get insight of the history of the Angus breed in Argentina. Pedigree information from 16,611 individuals born between 1954 and 2012 was analyzed, including Black and Red Angus. Also available were genotypes of 17 microsatellites from 470 individuals born between 2005 and 2012. Identification of the most influential ancestors showed a trend that is...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Population structure; Coancestry; Microsatellites; Inbreeding.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332015000300002
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Genetic characterization of Indubrasil cattle breed population. Repositório Alice
ZANELLA, R.; LAGO, L. V.; SILVA, A. N. da; PÉRTILLE, F.; CARVALHO, N. S. de; PANETTO, J. C. do C.; ZANELLA, G. C.; FACIOLI, F. L.; SILVA, M. V. G. B..
Abstract The Indubrasil breed was developed in the Brazilian region called Triângulo Mineiro as a result of a cross between zebu cattle. Initially, it was used as a terminal cross and currently it represents approximately 4.45% of all the Brazilian zebu cattle. Studies were conducted to estimate genetic parameters in the Indubrasil using pedigree information, however, until now, no study has been developed using large-scale genomic markers in this breed. Pedigree information are widely used to investigate population parameters; however, they can neglect some estimates when compared to the use of genomic markers. Therefore, the objective of this study was to investigate the population structure and the genetic diversity of Indubrasil cattle using a...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Indubrasil; SNPs; Genetic diversity; Inbreeding; Pedigree.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101944
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Genetic consequences of population subdivision: the marsupial Micoureus paraguayanus (Mammalia: Didelphimorphia) as a case study Rev. Bras. Zool.
Brito,Daniel.
Habitat fragmentation may cause population subdivision, affecting genetic variation, leading to heterozygosity loss and increased inbreeding, and contributing to population extinction. However, some genetic models have shown that under some conditions, population subdivision can favor heterozygosity and allelic diversity, and small populations may adapt to inbreeding. Here I investigate the relationship between population subdivision and genetic diversity for the marsupial Micoureus paraguayanus (Tate, 1931) using the program Vortex. Hypothetical populations of 100 and 2000 individuals were partitioned into 1, 2, 5 or 10 populations that were linked by varying rates of dispersal and also by sex-biased dispersal. Results suggested that heterozygosity and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genetic drift; Genetic load; Habitat fragmentation; Inbreeding; Metapopulation; Population viability analysis.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1984-46702009000400013
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Genetic improvement and population structure of the Nelore breed in Northern Brazi. Repositório Alice
MALHADO, C. H. M.; CARNEIRO, P. L. S.; MALHADO, A. C. M.; MARTINS FILHO, R.; BOZZI, R.; LADLE, R. J..
Abstract ? The objective of this work was to evaluate the population structure and the genetic and phenotypic progress of Nelore cattle in Northern Brazil. Pedigree information concerning animals born between 1942 and 2006 were analyzed. Population structure was performed using the Endog program. average relatedness coefficients were low: 0.2 and 0.13%, respectively. However,The effective number of founders was 370 and the genetic contribution of 10, 50 and 448 most influent ancestors explained 13.2, 28 and 50% of the genetic variability in the population, respectively. The genetic variability for growth traits and population structure demonstrates high probability of increasing productivity through selective breeding. Moreover, management strategies to...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Effective population size; Genetic parameters; Genetic trends; Inbreeding; Pedigree analysis; Bos taurus indicus.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/877575
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Genetic improvement and population structure of the Nelore breed in Northern Brazil. Repositório Alice
MALHADO, C. H. M.; CARNEIRO, P. L. S.; MALHADO, A. C. M.; MARTINS FILHO, R.; BOZZI, R.; LADLE, R. J..
Abstract ? The objective of this work was to evaluate the population structure and the genetic and phenotypic progress of Nelore cattle in Northern Brazil. Pedigree information concerning animals born between 1942 and 2006 were analyzed. Population structure was performed using the Endog program. average relatedness coefficients were low: 0.2 and 0.13%, respectively. However,The effective number of founders was 370 and the genetic contribution of 10, 50 and 448 most influent ancestors explained 13.2, 28 and 50% of the genetic variability in the population, respectively. The genetic variability for growth traits and population structure demonstrates high probability of increasing productivity through selective breeding. Moreover, management strategies to...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bos taurus indicus; Effective population size; Genetic parameters; Genetic trends; Pedigree analysis; Inbreeding.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/873351
Registros recuperados: 36
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