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A clonal theory of parasitic protozoa : the population structures of Entamoeba, Giardia, Leishmania, Naegleria, Plasmodium, Trichomonas, and Trypanosoma and their medical and taxonomical consequences IRD
Tibayrenc, Michel; Kjellberg, F.; Ayala, F.J..
We propose a general theory of clonal reproduction for parasitic protozoa, which has important medical and biological consequences. Many parasitic protozoa have been assumed to reproduce sexually, because of diploidy and occasional sexuality in the laboratory. However, a population genetic analysis of extensive data on biochemical polymorphisms indicates that the two fundamental consequences of sexual reproduction (i.e. segregation and recombination) are apparently rare or absent in natural populations of the parasitic protozoa. Moreover, the clones recorded appear to be stable over large geographical areas and long periods of time. A clonal population structure demands that the medical attributes of clones be separately characterized; ubiquitous clones...
Tipo: Text Palavras-chave: PARASITE; STRUCTURE DE POPULATION; REPRODUCTION ASEXUEE; CHIMIOTAXONOMIE; CLONE; MARQUEUR GENETIQUE; STABILITE GENETIQUE; PROTOZOAIRE.
Ano: 1990 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:31838
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A dynamic deterministic model to evaluate breeding strategies under mixed inheritance Inra
Manfredi, E.; Barbieri, M.; Fournet, F.; Elsen, J.M..
Un modèle déterministe et dynamique est proposé pour étudier l’utilisation conjointe des performances et des génotypes à un locus majeur pour la sélection des caractères exprimés dans un sexe. Le modèle prévoit la sélection des adultes au-delà de seuils de performances intra-génotype, des accouplements en fonction des génotypes et la présélection de jeunes mâles sur leur génotype. L’application présentée indique que la combinaison optimale des performances et des génotypes permet d’obtenir des meilleurs résultats, en terme de moyennes polygéniques, de fréquences génotypiques et du progrès génétique actualisé et cumulé, que la sélection classique ignorant l’informationgénotypique. Les avantages de la sélection combinée sont plus importants quand...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: SELECTION DYNAMIQUE; GENE MAJEUR; MARQUEUR GENETIQUE; MODELISATION.
Ano: 1998 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2007706b1da0&uri=/notices/prodinra1/2007/09/
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A genetic analysis of variable number of tandem repeats (VNTR) polymorphism in the horse Inra
Guerin, G.; Bertaud, M.; Billoud, B.; Meriaux, J.C..
Le polymorphisme de longueur de fragment de restriction détecté par la sonde minisatellite 33.6 (Jeffreys et al, 1985) a été analysé chez le cheval dans trois familles de demi-germains paternels et dans un échantillon d’étalons de quatre races. Parmi toutes les bandes révélées à partir d’ADN génomique digéré par Hae III, les fragments donnant un signal intense se comportent comme des allèles ségrégeant à deux locus différents. Ceux-ci, qui possèdent respectivement sept et trois allèles détectables, ne sont pas étroitement liés entre eux ni avec les locus informatifs des groupes sanguins et des protéines du sang. Aucune néo-mutation de longueur des allèles n’a été détectée dans les trois familles. Dans l’échantillon des étalons, huit allèles ont été...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: REPETITION EN TANDEM; MARQUEUR GENETIQUE; POLYMORPHISME; FRAGMENT DE RESTRICTION; GROUPE SANGUIN; LIAISON GENETIQUE; ALLELE.
Ano: 1993 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9400032129041624&uri=/notices/prodinra1/2007/11/
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Abnormal segregations in crosses between two cultivated rice species IRD
Pham, Jean-Louis; Bougerol, B..
Tipo: Text Palavras-chave: RIZ; PLANTE CULTIVEE; HYBRIDATION INTERSPECIFIQUE; HYBRIDE; SEGREGATION; GENOTYPE; GAMETE; MARQUEUR GENETIQUE; RESSOURCES GENETIQUES.
Ano: 1993 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010024386
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Allozyme variation and an estimate of the inbreeding coefficient in the coffee berry borer, Hypothenemus hampei (Coleoptera : Scolytidae) IRD
Borsa, Philippe; Gingerich, D.P..
Tipo: Text Palavras-chave: GENETIQUE DE POPULATION; POLYMORPHISME GENETIQUE; INSECTE NUISIBLE; CONSANGUINITE; STRUCTURE DE POPULATION; ENZYME; MARQUEUR GENETIQUE; ELECTROPHORESE; CAFEIERE.
Ano: 1995 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010005345
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Améliorer la sécurité alimentaire des agriculteurs des Andes équatoriennes grâce à la lutte intégrée contre les teignes de la pomme de terre = Incremento de la seguridad alimentaria de los agricultores de los Andes ecuatorianos gracias al manejo integrado de las polillas de la papa IRD
Zeddam, Jean-Louis; Barragán, A.; Pollet, André; Léry, X.; Gallegos, P.; Suquillo, J.; Onore, G..
Tipo: Text Palavras-chave: INSECTE NUISIBLE; LUTTE BIOLOGIQUE; LUTTE INTEGREE; POMME DE TERRE; DYNAMIQUE DE POPULATION; BIODIVERSITE VIRALE; MARQUEUR GENETIQUE.
Ano: 2007 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010041263
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Analyse des plantes de melon (Cucumis melo L) issues de croisements avec du pollen irradie a differentes doses Inra
Cuny, F.; Dumas de Vaulx, R.; Longhi, B.; Siadous, R..
Chez le melon, les conséquences de l’irradiation γ du pollen du génotype Védrantais sur le rendement en embryons et en plantules haploïdes sont évaluées après autopollinisation et après hybridation avec le génotype F1Gl. L’utilisation de marqueurs génétiques nucléaires permet de confirmer l’origine parthénogénétique des embryons obtenus. La perturbation du processus de double fécondation semble mieux acceptée par le génotype F1Gl (3,4 d’embryons pour 100 graines) que par Védrantais (2 d’embryons pour 100 graines). Quelles que soient les doses d’irradiation comprises entre 0,15 et 2,5 kGy, la réponse parthénogénétique est toujours présente. Pour le génotype Védrantais testé, l’induction d’embryons est plus élevée en été qu’en automne. Au maximum 70% de ces...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: POLLEN IRRADIE; PLOIDIE; CYTOMETRIE EN FLUX; PARTHENOGENESE; MARQUEUR GENETIQUE; NOUAISON.
Ano: 1992 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9200024185026619&uri=/notices/prodinra1/2009/10/
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Anomalie florale chez le palmier à huile : caractérisation de l'expression génique différentielle IRD
Morcillo, F.; Adam, H.; Richaud, R.; Hartmann, C.; Durand-Gasselin, T.; Konan, E.; Rival, A.; Duval, Yves; Tregear, J..
Tipo: Text Palavras-chave: PALMIER A HUILE; MICROPROPAGATION; EMBRYOGENESE SOMATIQUE; PHENOTYPE; ANOMALIE; FLEUR; STERILITE; ADN; MARQUEUR GENETIQUE; VARIATION SOMACLONALE; EXPRESSION DES GENES.
Ano: 2001 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010028498
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Breeding for robustness: the role of cortisol Inra
Mormède, P.; Foury, A.; Terenina, E.; Knap, P.W..
Robustness in farm animals was defined by Knap as ‘the ability to combine a high production potential with resilience to stressors, allowing for unproblematic expression of a high production potential in a wide variety of environmental conditions’. The importance of robustness-related traits in breeding objectives is progressively increasing towards the production of animals with a high production level in a wide range of climatic conditions and production systems, together with a high level of animal welfare. Current strategies to increase robustness include selection for ‘functional traits’, such as skeletal and cardiovascular integrity, disease resistance and mortality in various stages. It is also possible to use global evaluation of sensitivity to the...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: GENETIQUE; MARQUEUR GENETIQUE; SELECTION ASSISTEE PAR MARQUEUR; AMELIORATION GENETIQUE; ANIMAL; PRODUCTION; BIEN ETRE ANIMAL; SYSTEME DE PRODUCTION; SELECTION GENETIQUE; CORTICOSTERONE; EFFET DU STRESS; ADAPTATION; HORMONE; POLYMORPHISME GENETIQUE; VARIABILITE GENETIQUE; MODELISATION; HORMONE CORTICOSTEROIDE; CORTEX STRESS; ROBUSTNESS; CORTISOL; GENETICS; MARKER-ASSISTED SELECTION.
Ano: 2010 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2010d8a76487&uri=/notices/prodinra1/2010/12/
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Caractérisation de l'individualité génétique des taurins kapsiki : utilisation de quelques systèmes marqueurs de substances sanguines IRD
Thys, E.; Bouquet, Y.; Van der Weghe, A.; Van Zeveren, A..
Tipo: Text Palavras-chave: BOVIN; ZEBU; RACE BIOLOGIQUE; GENETIQUE; MARQUEUR GENETIQUE; ANTIGENE; ETUDE COMPARATIVE; GENETIQUE ANIMALE.
Ano: 1998 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010015336
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Cartographie génétique du mil IRD
Peigne, M.T.; Enjalbert, J.; Robert, T.; Ricroch, A.; Lespinasse, R.; Sandmeier, M.; Sarr, A..
Tipo: Text Palavras-chave: MIL; DOMESTICATION DES PLANTES; PLANTE CULTIVEE; PLANTE SAUVAGE; MORPHOLOGIE; POLYMORPHISME; DISTANCE GENETIQUE; METHODOLOGIE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; RFLP.RESTRICTION FRAGMENT LENGHT POLYMORPHISM; MARQUEUR ENZYMATIQUE; CARTOGRAPHIE GENETIQUE; MARQUEUR GENETIQUE.
Ano: 1993 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:38956
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Challenges of microsatellite isolation in fungi Inra
Dutech, C.; Enjalbert, J.; Fournier, E.; Delmotte, F.; Barrès, B.; Carlier, J.; Tharreau, D.; Giraud, T..
Although they represent powerful genetic markers in many fields of biology, microsatellites have been isolated in few fungal species. The aim of this study was to assess whether obtaining microsatellite markers with an acceptable level of polymorphism is generally harder from fungi than in other organisms. We therefore surveyed the number,nature and polymorphism level of published microsatellite markers in fungi from the literature and from our own data on seventeen fungal microsatellite-enriched libraries, and in five other phylogroups (angiosperms, insects, fishes, birds and mammals). Fungal microsatellites indeed appeared both harder to isolate and to exhibit lower polymorphism than in other organisms. This appeared to be due, at least in part, to...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: MARQUEUR GENETIQUE; MICROSATELLITE; CHAMPIGNON; ANALYSE DE DONNEES SSR; PLANT PATHOGEN; POLYMORPHIC; MARKERS; DEVELOPMENT; ISOLATION; FEATURES; AFFECTING POLYMORPHISM.
Ano: 2007 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD200780b37b09&uri=/notices/prodinra1/2008/04/
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Characteristics of random amplified polymorphic DNA markers discriminating Helianthus annuus inbred lines Inra
Teulat, B.; Zhang, Y.X..
Nous avons testé l’utilisation de marqueurs RAPD (random amplified polymorphic DNA) pour permettre la discrimination de lignées de tournesol cultivé Helianthus annuus. En testant 100 amorces décamères sur les ADN de 4 lignées, nous obtenons 40 amorces révélant un polymorphisme. Nous montrons qu’en sélectionnant les amorces donnant des signaux reproductibles on obtient 14 marqueurs RAPD permettant de caractériser des lignées de tournesol. L’étude moléculaire des fragments amplifiés montre que ces marqueurs sont de type «présence/absence» : un locus est caractérisé par une bande chez une lignée et l’absence de bande chez les autres lignées. Des expériences de Southern utilisant des fragments RAPD polymorphes comme sondes produisent des signaux d’hybridation...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: RAPD; RFLP; MARQUEUR GENETIQUE.
Ano: 1994 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9500019671048235&uri=/notices/prodinra1/2009/11/
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Comparison between maize inbred lines : genetic distances in the expert's eye Inra
Dillmann, C.; Guérin, D..
Pour être inscrite sur la liste nationale comme protégée, une nouvelle variété doit être distincte de toutes les variétés existantes, homogène et stable. En France, la distinction est fondée sur des caractères morphologiques, mais la décision finale est prise par un comité d’experts. Dans le futur, les marqueurs moléculaires pourraient aussi être utilisés pour gérer les collections de référence, ou pour instruire la dérivation essentielle. Dans le but d’étudier la relation entre ces différents modes d’appréciation de la distance entre variétés, nous avons demandé à des experts du maïs d’estimer visuellement l’apparentement entre des couples de lignées connues. Les résultats permettent de valider l’approche française de la distinction, qui consiste à...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: PHENOTYPE; ANATOMIE VEGETALE; MARQUEUR GENETIQUE; ENREGISTREMENT; DROIT DE L'OBTENTEUR.
Ano: 1998 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9900002168073320&uri=/notices/prodinra1/2010/01/
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Construction of nested genetic core collections to optimize the exploitation of natural diversity in Vitis vinifera L. subsp sativa Inra
Le Cunff, L.; Fournier-Level, A.; Laucou, V.; Vezzulli, S.; Lacombe, T.; Adam-Blondon, A.F.; Boursiquot, J.M.; This, P..
Background: The first high quality draft of the grape genome sequence has just been published. This is a critical step in accessing all the genes of this species and increases the chances of exploiting the natural genetic diversity through association genetics. However, our basic knowledge of the extent of allelic variation within the species is still not sufficient. Towards this goal, we constructed nested genetic core collections (G-cores) to capture the simple sequence repeat (SSR) diversity of the grape cultivated compartment (Vitis vinifera L. subsp. sativa) from the world's largest germplasm collection (Domaine de Vassal, INRA Herault, France), containing 2262 unique genotypes. Results: Sub-samples of 12, 24, 48 and 92 varieties of V. vinifera L....
Tipo: Journal Article Palavras-chave: RESISTANCE AUX MALADIES; VIGNE; DIVERSITE; POLYMORPHISME; SEQUENCE NUCLEOTIDIQUE; MARQUEUR GENETIQUE; EXPRESSION DES GENES; DIVERSITE GENETIQUE SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS; LINKAGE DISEQUILIBRIUM; CULTIVATED GRAPEVINE; MICROSATELLITE LOCI; CROHNS DISEASE; WINE GRAPES; EXPRESSION; MUTATION; GENOME; SUSCEPTIBILITY.
Ano: 2008 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20117dca1051&uri=/notices/prodinra1/2011/05/
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Contrasting patterns of genetic diversity in neutral markers and agromorphological traits in wild and cultivated populations of Medicago sativa L. from Spain Inra
Jenczewski, E.; Angevain, M.; Charrier, A.; Génier, G.; Ronfort, J.; Prospéri, J.M..
L’existence d’un flux génique entre des populations cultivées et sauvages joue souvent un rôle prépondérant dans l’évolution de la diversité génétique de ces dernières. Nous présentons ici une vue générale des niveaux, et de l’organisation de la diversité génétique mesurée sur la base de marqueurs neutres et de caractères agromorphologiques dans des populations sauvages et cultivées de luzerne (M. sativa L.)en Espagne. La plupart des populations sauvages maintiennent une claire originalité agronomique et morphologique bien qu’elles soient parapatriques de populations cultivées et qu’elles fassent parfois l’objet d’introgressions régulières de leur part. Néanmoins notre étude a permis de mettre en évidence un ensemble de populations sauvages moins...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: DIVERSTITE GENETIQUE; PLANTE CULTIVEE; MARQUEUR GENETIQUE; ALLOZYME; POLYMORPHISME; SELECTION NATURELLE.
Ano: 1998 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9900008585078467&uri=/notices/prodinra1/2007/07/
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Core collections : accomplishments and challenges IRD
Hamon, Serge; Dussert, Stéphane; Noirot, Michel; Anthony, François; Hodgkin, T..
Le problème majeur auquel doit faire face le gestionnaire de banque de gènes est l'accessibilité des collections à un large ensemble d'utilisateurs. Le concept de "core collection" (collection de noyaux) est une voie d'approche. Cette collection a été définie comme un ensemble qui comporte, avec un minimum de redondance, le plus possible de diversité génétique. Une telle collection n'est pas appelée à remplacer la collection de base mais à faciliter son accessibilité. La théorie a été développée sur la base de marqueurs neutres et l'objectif d'inclure 70% de la variabilité avec 10% des individus. Un grand nombre de procédures a été développé allant de la stratégie R (Random = hasard) à une stratégie hiérarchisée. Il est clair maintenant que cette dernière...
Tipo: Text Palavras-chave: RESSOURCES GENETIQUES; DIVERSITE SPECIFIQUE; POLYMORPHISME GENETIQUE; MARQUEUR GENETIQUE; COLLECTION NOYAU.
Ano: 1995 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:43191
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Cryptic forest refugia on the ‘Roof of the World’ Inra
Hampe, A.; Petit, R.J..
Tipo: Journal Article Palavras-chave: PHYLOGEOGRAPHIE; PLATEAU TIBÉTAIN; LIMITE FORESTIÈRE; GLACIATION; ALTITUDE; MARQUEUR GENETIQUE; REFUGE CRYPTIQUE JUNIPERUS.
Ano: 2009 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2009c97b64c7&uri=/notices/prodinra1/2010/03/
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Defective RNA packaging is responsible for low transduction efficiency of CAEV-based vectors Inra
Mselli-Laklal, L.; Favier, C.; da Silva Teixeira, M.F.; Chettab, K.; Legras, C.; Ronfort, C.; Verdier, G.; Mornex, J.F.; Chebloune, Y..
 Replication defective retroviral vectors are regularly used for transfer and expression of exogenous genes into dividing cells and in animals. Since lentiviruses are able to infect terminally differentiated and non-dividing cells, their use to produce replication defective vectors may overcome this limitation. We developed two replication-defective lentiviral vectors based on the genome of Caprine Arthritis Encephalitis Virus (CAEV). The first vector (pBNL2) carries the neo and lacZ marker genes. Neo gene is expressed from a genomic RNA and lacZ gene from a subgenomic RNA. The second vector (pCSHL) carries a single fusion gene encoding both phleomycin resistance and β-galactosidase activity. Replication-competent CAEV was used as helper virus to provide...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: VECTEUR GENETIQUE; EXPRESSION DES GENES; MARQUEUR GENETIQUE; TECHNIQUE ANALYTIQUE.
Ano: 1998 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB0100002455087262&uri=/notices/prodinra1/2010/11/
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Description de la diversite genetique chez Brassica oleracea a l'aide de marqueurs isoenzymatiques et moleculaires Inra
Margale, E.; Chevre, A.M.; Delourme, R.; Herve, Y..
Deux méthodes d’analyse de la diversité génétique sont comparées dans le but de constituer des pools génétiques homogènes en vue de la multiplication d’une collection de choux (Brassica oleracea). Il apparaît que la variabilité génétique intrapopulation est facilement accessible par la méthode isoenzymatique. Cependant, pour la structuration des populations, c’est la méthode RAPD (amplification aléatoire d’ADN) qui fournit les informations les mieux corrélées avec la diversité morpho-agronomique et pour un moindre coût. La méthode proposée repose sur l’analyse de la présence-absence d’une centaine de marqueurs RAPD par échantillon, lui-même constitué de l’ADN en mélange de 40 graines. L’estimation des distances inter-populations et...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: RAPD; DIVERSITE GENETIQUE; MARQUEUR GENETIQUE; ISOENZYME; METHODE D'ANALYSE; PHYLOGENESE.
Ano: 1994 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9400012890041314&uri=/notices/prodinra1/2007/11/
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