SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

FERREIRA, C. N.; SIMÕES, M. da R. S.; MINHO, A. P.; CARDOSO, F. F.; YOKOO, M. J. I..

Resumo.

Biological processes related to ribosome and mitochondrial functions might be involved in the osteochondrosis latens manifestation in gilts.

Palavras-chave: Melhoramento Genético Animal; Gado de Corte; Resistência Genética; Seleção.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099429

IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; MORES, N.; MORES, M. A. Z.; CANTAO, M. E.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..

Abstract: The articular osteochondrosis (OC) is a disturbance of endochondral ossification occurring in humans and livestock animals. In pigs, OC is one of the major causes of leg weakness, leading to economic losses and reducing the animal welfare. The aim of this study was to evaluate the differential gene expression related to OC latens in femoral articular cartilage in swine. Thus, samples of MS115 5-months-old gilts, normal (control group) and affected with OC latens (affected group), were collected and submitted to histopathological and gene expression analysis. A total of 1,734 genes was differentially expressed (DE) between the two groups. Several biological processes (BP) were enriched including those already known as involved with OC, such as...

Biopsia Embrionária Manual.

Palavras-chave: Desenvolvimento ósseo; Características do fêmur; Osteocondrose articular; Problemas de locomoção; Locomotor problems; RNA-Seq; Melhoramento Genético Animal; Suíno; Gene; Osso; Fêmur; Animal genetic resources; Swine; Osteochondrosis; Gene expression; Lameness; Leg weakness.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1093227

CAMARGO, L. S. de A.; QUINTAO, C. C. R.; FREITAS, C. de; OLIVEIRA, C. S..

Este documento mostra um protocolo otimizado para biópsia manual, sem auxílio de micromanipuladores, em embriões fertilizados in vitro em estádio de blastocisto. Com a utilização deste protocolo obteve-se taxa de gestação e de nascimentos semelhantes à de embriões não biopsiados, demonstrando a viabilidade da biópsia embrionária em nossas condições experimentais e a possibilidade de sua aplicação em um sistema comercial, sugerindo seu uso para genotipagem objetivando a SGE (seleção genômica embrionária).

Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Genotipagem; Seleção genômica embrionária; SGE; Protocolo; Melhoramento Genético Animal.

Ano: 2018

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1101180

Canchim: passado, presente e futuro.

MARCONDES, C. R..

A partir da década de 1940, diversas raças foram desenvolvidas com o uso do cruzamento de raças zebuínas, comprovadamente adaptadas ao clima tropical, com raças europeias de maior produtividade. Nos EUA, por exemplo, foi desenvolvida a raça Santa Gertrudis (5/8 Shorthorn e 3/8 Zebu), por meio de cruzamento alternativo e posterior seleção massal. Em gado leiteiro, temos o exemplo das raças Jamaica Hope e, no Brasil, temos a raça Girolando. A raça Canchim (5/8 Charolês e 3/8 Zebu) foi desenvolvida na Fazenda de Criação de São Carlos, SP (atualmente Embrapa Pecuária Sudeste), nessa mesma época (MOTTA, 1977).

Comparação entre linhagens da raça Canchim quanto às características de carcaça.

Palavras-chave: Raça Canchim; Touros Canchim; Gado de Corte; Melhoramento Genético Animal; Gado Canchim; Beef cattle; Beef quality; Animal breeding.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101727

CHAVES, R.; MÉO FILHO, P. de; SAKAMOTO, L. S.; ANDRADE, A.; FUENTES, B.; MARCONDES, C. R.; BERNDT, A..

Atualmente o consumo de carne bovina é crescente e a intensificação da pecuária através do melhoramento genético de uma mesma raça é uma boa estratégia para suprir essa demanda. O experimento foi desenvolvido na Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Pecuária Sudeste, município de São Carlos/SP no ano de 2016. Utilizou-se 46 novilhos castrados da raça Canchim com peso inicial médio de 354 i41 kg, pertencentes a três linhagens diferentes: Antiga, Nova e Cruzada (resultante do cruzamento entre as linhagens Nova e Antiga).

CONSERVAÇÃO de caprinos e ovinos no Semiárido: programa 35: Nordeste.

Palavras-chave: Carcaça; Melhoramento Genético Animal; Carcass quality; Carcass characteristics.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1095837

Desempenho da linhagem de reprodutores suínos define Embrapa MS 115 como opção para os suinocultores.

O Prosa Rural desta semana conversa com o pesquisador da Embrapa, Kleibe Moraes, sobre a conservação de caprinos e ovinos no Semiárido. O uso de raças de animais localmente adaptados apresenta um grande potencial para os sistemas de produção. Por serem mais rústicas e de melhor adaptação, essas raças de caprinos e ovinos podem apresentar melhores respostas quanto à resistência a doenças e à eficiência alimentar, além da possibilidade de serem aproveitadas em programas de melhoramento genético voltados para a região.

Tipo: Prosa Rural (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Raça nativa; Sistema de Produção; Bovino; Caprino; Raça; Melhoramento Genético Animal; Caatinga; Conservação.

Ano: 2018

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1096515

LIMA, G. J. M. M. de; FIGUEIREDO, E. A. P. de; DALLA COSTA, O. A.; MIELE, M..

bitstream/item/188890/1/final8979.pdf

Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Embrapa MS115; Suíno; Melhoramento Genético Animal; Linhagem.

Ano: 2018

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1102051

Desempenho da linhagem de reprodutores suínos Embrapa MS115.

LIMA, G. J. M. M. de; FIGUEIREDO, E. A. P. de; DALLA COSTA, O. A.; MIELE, M..

bitstream/item/180941/1/final8926.pdf

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Linhagem comercial; Qualidade da carcaça; MS115; Reprodução Animal; Suíno; Melhoramento Genético Animal.

Ano: 2018

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1093919

Effect of long cooling periods of the ear skin at 5°C on the isolation and culture of bovine fibroblasts.

ARAUJO, J. M.; OLIVEIRA, R. A.; CUMPA, H. C. B.; MARTINS, C. F..

Viable somatic cell storage in cryogenic tanks is an essential step on bovine cloning achievement through nuclear transfer (NT). Cattle with high genetic potential have died suddenly without having their germplasm conserved in vitro. In such context, this research?s objective was to verify the maximum possible time for isolation of somatic cells to be used in NT after an animal?s death. For this purpose, ears of 6 Nelore females with an average age of 48 months, obtained in a local slaughterhouse, were conserved on the refrigerator at 5°C in clean ziplock bags during a 30 day period. On days 2, 4, 7, 14 and 21 after death, fibroblast isolation and culture were performed with DMEM medium supplemented with 10% bovine fetal serum. When cellular confluence was...

Epigenética: mecanismos, herança e implicações no melhoramento animal.

Palavras-chave: Armazenamento de célula; Transferência nuclear; Tempo máximo de isolamento; Bovino; Clonagem; Clone Nucelar; Citogenética Animal; Melhoramento Genético Animal.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1100290

Estimativas de parâmetros genéticos para seleção intrarrebanho de touros Nelore no Acre.

PAIVA, J. T.; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE, R. T.; OLIVEIRA, H. R.; SILVA, H. T.; CAETANO, G. C.; LOPES, P. S.; SILVA, F. F..

A epigenética é definida como mudanças na expressão gênica que podem ser herdadas e que não alteram a sequência do DNA. Existem dois mecanismos epigenéticos principais, a metilação do DNA e a modificação de histonas. Também se destaca o imprinting genômico, o qual está relacionado com a regulação gênica quando apenas um alelo (herdado do pai ou da mãe) se expressa. A herança epigenética transgeracional consiste da herança de marcas epigenéticas através de células germinativas, que controla os padrões de expressão gênica e são passados de uma geração para a outra. Dentro do programa de melhoramento animal é importante avaliar a extensão com que a herança epigenética transgeracional também afeta a eficiência da seleção. Uma melhor compreensão dos mecanismos...

Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE)

Palavras-chave: Epigenoma; Expressão gênica; Histona; Transgeracional; Epigenome; Transgenerational; Metilação; Melhoramento Genético Animal; Gene expression; Methylation; Histones.

Ano: 2019

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110162

Estratégias de imputação em gado Canchim utilizando população de referência da raça Nelore.

SILVA, M. S..

O Brasil se destaca como o maior exportador de carne, isso se deve principalmente as condições ambientais do país, além da qualidade genética do rebanho produzido. No Acre, a pecuária de corte representa grande parte de economia gerada pelo setor do agronegócio. No entanto, mesmo o rebanho apresentando índices produtivos dentro da média nacional, a adoção de ferramentas como a avaliação genética ainda é uma prática pouco comum entre os produtores. Isso faz com que não se conheça efetivamente as características de desempenho do rebanho a serem melhoradas. Nesse sentido, esse estudo teve por objetivo realizar uma avaliação genética intra rebanho para a obtenção de parâmetros genéticos para características produtivas, reprodutivas e morfológicas em uma...

Tipo: Tese/dissertação (ALICE)

Palavras-chave: Ganado de carne; Raza de bovinos Nelore; Tourinho; Toros; Cruce de animales; Cattle productivity; Productividad ganadera; Gado de Corte; Gado Nelore; Melhoramento Genético Animal; Parâmetro Genético; Produtividade; Beef cattle; Nellore; Beef bulls; Animal breeding.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1093829

MARCIANO, L. E. A.; MAIA, R. de O. G.; SANTOS; DUARTE, I. N. H.; BERNARDES, P. A.; CHUD, T. C. S.; REGITANO, L. C. de A.; BUZANSKAS, M. E..

The use of genomic tools in animal breeding has been widely applied to improve productivity. Imputation methods could be used to reduce genotyping costs and increase the amount of genomic information, which are needed for various studies. The aim of this study was to consider the Canchim cattle (a composite beef breed) as target population and the Nelore breed as reference population to evaluate the imputation accuracy. A total of 285 Canchim, 114 MA genetic group and 814 Nelore animals were used in this study. Imputation was carried out using the FImpute software and genotype imputation accuracy was measured by concordance rate (CR) and allelic R square (R2). Five imputation scenarios were tested and CR results varied from 64.71% to 89.69%. The R2 varied...

Genetic association between growth and maternal ability traits in Nelore cattle.

Palavras-chave: Marcadores moleculares; Raça composta; Melhoramento Genético Animal; Reprodução Animal; Gado de Corte; Bovino; Animal breeding; Beef cattle.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110873

BRUNES, L. C.; MAGNABOSCO, C. de U.; BALDI, F. S.; COSTA, M. F. O. e; LOBO, R. B.; CROZARA, A. S.; LOPES, F. B..

Although body weight traits have been widely used in animal breeding programs due to their importance to beef cattle systems, the use of maternal ability traits, which highly affect the profitability in livestock, is still incipient. As the knowledge of genetic parameters of economic important traits may aid genetic gains, this study was carried out to estimate genetic parameters for weight at 120 and 210 days of age (W120 and W210), pre-weaning average daily gain (PreDG), real fertility (RF), accumulated productivity (AP) and weaning rate (WR). The data set was obtained from Vera Cruz Ranch, a cattle ranch that participates in the Brazilian National Association of Breeders and Researchers (ANCP). Heritabilities and correlations were estimated using...

Genome-wide association study for femur-related traits in broilers.

Palavras-chave: Traços de maternidade; Gado Nelore; Genética Animal; Melhoramento Genético Animal; Taxa de Crescimento; Fator de Crescimento; Fertilidade Animal.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101498

ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; SOLLERO, B. P.; SUREK, D.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..

Abstract: Due to the intense selection for heavier and faster growing broilers, metabolic disorders such as skeletal problems became a worldwide concern. Advances in genome-wide association study (GWAS) methodologies increased the possibility of elucidating the genetic architecture controlling bone integrity traits. Therefore, the aim of this study was to perform a GWAS to identify potential genetic markers and candidate genes associated with femur traits in a paternal broiler line developed by Embrapa. To this, three femur bone-related traits were evaluated in 1,433 chickens: dry matter (FDM), ash content (FAC) and breaking strength (FBS). Chickens were genotyped using the 600K Affymetrix® Axiom® HD panel. A total of 16 regions associated to FAC, being a...

Genome-wide characterization of genetic variations and regions under selection in broilers and layer chickens.

Palavras-chave: Integridade óssea; Características do fêmur; Associação genômica; QTLs; Melhoramento Genético Animal; Frango de Corte; Formação Óssea; Fêmur; Animal genetic resources; Broiler chickens; Bone metabolism; Quantitative trait loci.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1093205

Genome-wide distribution of allele-specific expression in Nelore steers muscle.

BOSCHIERO, C.; MOREIRA, G. C. M.; GHEYAS, A.; GODOY, T. F.; GASPARIN, G.; MARIANI, P. D. S. C.; PADUAN, M..

Abstract: Background Meat and egg-type chickens have been selected for several generations for different traits. Artificial and natural selection for different phenotypes can change frequency of genetic variants, leaving particular genomic footprints throghtout the genome. Thus, the aims of this study were to sequence 28 chickens from two Brazilian lines (meat and white egg-type) and use this information to characterize genome-wide genetic variations, identify putative regions under selection using Fst method, and find putative pathways under selection.

Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE)

Palavras-chave: Fat deposition; Genetic variants; Next generation sequencing; Genoma; Frango de Corte; Linhagem; Ovo; Melhoramento Genético Animal; Polimorfismo Genético; Single nucleotide polymorphism; Egg industry; Broiler chickens; Genome; Poultry carcasses.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1091368

SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; NICIURA, S. C. M.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; AFONSO, J.; CESAR, A. S. M; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..

The difference between the allelic expression of a gene is known as allele-specific expression (ASE), and it is a common event in mammal?s transcriptome. ASE is named genomic imprinting when guided by epigenetics mechanisms regarding the allele parental origin.

Genome-wide survey of SNP variation uncovers the genetic structure of cattle breeds.

Palavras-chave: ASE; Allele-specific expression; Polimorfismo Genético; Melhoramento Genético Animal; Gene expression.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1100405

Genômica: rotina nas fazendas em 2018?

THE BOVINE CONSORTIUM.

The imprints of domestication and breed development on the genomes of livestock likely differ from those of companion animals. A deep draft sequence assembly of shotgun reads from a single Hereford female and comparative sequences sampled from six additional breeds were used to develop probes to interrogate 37,470 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in 497 cattle from 19 geographically and biologically diverse breeds. These data show that cattle have undergone a rapid recent decrease in effective population size from a very large ancestral population, possibly due to bottlenecks associated with domestication, selection, and breed formation. Domestication and artificial selection appear to have left detectable signatures of selection within the cattle...

Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE)

Palavras-chave: Bovino; Genoma; Melhoramento Genético Animal.

Ano: 2009

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/748483

Impacto da utilização de acasalamento genético otimizado na maximização do progresso genético em bovinos da raça Nelore.

CARDOSO, F. F..

Disponibilidade de populações de referência; Uso dos marcadores SNP para verificação de paternidade; Redução do custo de genotipagem; ; Uma das palavras de ordem em pesquisas genômicas é a cooperação.

Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Genética Animal; Melhoramento Genético Animal; Genoma; Produção de Carne.

Ano: 2018

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1097208

QUEIROZ, L. C. R. de; MAGNABOSCO, C. de U.; LOPES, F. B.; BRUNES, L. C.; CROZARA, A. S.; GUIMARAES, N. C.; CARVALHO, R. A.; LOBO, R. B..

Abstract: The aim of this research was to evaluate the genetic values obtained using genetic mating based on the means between the parent?s expected progeny differences (DEPs) (scenario I) and the optimized genetic mating (scenario II). Inbreeding coefficient (F), total genetic merit (MGT), farmer genetic merit (MGC) and the predictions of DEP for probability of precocious pregnancy (D3P), age at first calving (DIPP), accumulated productivity (DPAC), scrotal circumference at 365 and 450 days of age (DPE365 and DPE450), stayability (DSTAY), maternal ability at 120 and 210 days of age (DMP120 and MP210), weights at 120, 210, 365 and 450 days of age (DP120, DP210, DP365 and P450), rib eye area (DAOL) and backfat thickness (DACAB) were analyzed in this study....