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Caractérisation de la contamination microbiologique d'origine fécale de l'estuaire de la Seudre en période sèche ArchiMer
Piquet, Jean-come; Fillon, Alain; Thomas, Gerard.
L’estuaire de la Seudre est situé dans le bassin de Marennes-Oléron, au cœur de l’écosystème des Pertuis Charentais. L’estuaire alimente la majorité des surfaces de claire de la région, qui elle même, assure plus de la moitié de la commercialisation nationale. La contamination microbiologique de l’estuaire de la Seudre est donc un enjeu majeur pour l’ostréiculture. L’estuaire possède un bassin versant de faible dimension et dont le fonctionnement hydrologique est particulier. Il est relié à un très important ensemble de zones humides, et les débits d’eau douce sont dépendants de la gestion d’ouvrages hydrauliques. Les périodes d’étiage sont sévères et longues, et les apports d’eau douce à l’estuaire sont quasiment nuls en fin d’été et en début...
Tipo: Text Palavras-chave: Microbiologie; Contamination microbiologique; Bactériologie; Estuaire; Seudre; Charente Maritime.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00129/24048/22011.pdf
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Dénombrement rapide des coliformes dans les coquillages. Efficacité des milieux A1 -M & MUG ArchiMer
Montfort, Patrick.
Le dénombrement des coliformes fécaux constitue la référence en matière d'évaluation de la salubrité des zones conchylicoles, de la qualité des bivalves destinés à la consommation humaine. Chacun jugera de l'intérêt et de l'efficacité que peut présenter une investigation diligente en ce domaine. Or, les techniques microbiologiques utilisées à l'heure actuelle se révèlent incompatibles avec ces objectifs voire avec les impératifs des laboratoires. Nous avons donc entrepris de tester deux nouveaux milieux (A1-M et MUG) afin de juger de leur fiabilité. L'étude statistique fait appraître une corrélation étroite entre le milieu A1-M et le bouillon BLBV, nous confortant  dans la poursuite de cette application à savoir l'évaluation de la fréquence du nombre de...
Tipo: Text Palavras-chave: Conchyliculture; Salubrité; Microbiologie; Coliformes; Technique.
Ano: 1989 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00430/54161/55493.pdf
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Diagnostic des contaminations microbiologiques des chenaux de Payré ArchiMer
Thomas, Gerard; Stanisiere, Jean-yves; Fillon, Alain; Paticat, Francois; Chabirand, Jean-michel; Derrien, Annick; Grizon, James.
De 2007 à 2010, deux études ont été menées sur le Havre du Payré pour recueillir des éléments permettant de mieux appréhender les épisodes de pollution microbiologique menaçant la zone ostréicole. L’objectif est de fournir aux collectivités des informations en vue d’appuyer la politique de reconquête de la qualité du milieu et d’aider la profession à optimiser la gestion de sa production. Ces études ont montré le caractère particulier de l’hydraulique de ce site avec une forte réactivité vis à vis des apports du bassin versant et un fonctionnement estuarien favorisant la rétention de l’eau selon certaines conditions de marée et lors de circonstances météorologiques particulières. Elles ont également permis de hiérarchiser les flux bactériens provenant des...
Tipo: Text Palavras-chave: Chenaux du Payré; Vendée; Bassins versants; Hydraulique; Microbiologie; Contamination; Huîtres.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00123/23421/21248.pdf
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Etat de la situation sanitaire des zones de production conchylicole dans les Pertuis Charentais. Volet 1 : Microbiologie et métaux lourds (Plomb, Mercure, Cadmium) ArchiMer
Thomas, Gerard; Piquet, Jean-come; Rouyer, Pascal; Audat, Cécile; Le Saux, Jean-claude; Ryckaert, Mireille; Fillon, Alain.
Le rapport se propose de dresser le bilan actuel de l’état sanitaire microbiologique des zones d’élevage ou de pêche professionnelle de coquillages dans les pertuis charentais. Bien qu’il soit principalement axé sur le volet microbiologique, les questions relatives aux teneurs des coquillages concernant trois métaux lourds (plomb, mercure, cadmium) sont également abordées, car le classement sanitaire des zones conchylicoles dépend aussi de ces paramètres. Les résultats du REMI* montrent que sur les dix dernières années, la situation des zones classées est restée globalement stable ou en légère amélioration, ce qui est à mettre au crédit des progrès en terme d’assainissement. Néanmoins, diverses études sanitaires révèlent la persistance d’un certain nombre...
Tipo: Text Palavras-chave: Zones conchylicoles; Etat sanitaire; Microbiologie; Métaux lourds.
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00123/23420/21247.pdf
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Etude de la diversité métabolique des micro-organismes des sources hydrothermales ArchiMer
Byrne, Nathalie.
Since the discovery of oceanic hydrothermal vents, microbial diversity of this extreme environment was studied using both cultivation and molecular approaches. In this study the microbial diversity of active chimney from both TAG and Lucky Strike sites (Mid Atlantic Ridge) was investigated using both molecular survey and continuous enrichment culture in a bioreactor. To reproduce as close as possible environmental conditions the cultures were performed in oligotrophic conditions, in the presence of hydrogen and carbondioxide in the gas sweeping mix or using in situ sampled fluid/sea water mix as culture medium. The effect of environmental changes such as temperature and the absence or presence of sulphur was also investigated. Archaeal and Bacterial...
Tipo: Text Palavras-chave: Culture; Molecular diversity; Metabolism; Hydrothermal vents; Microorganisms; Microbiology; Culture; Diversité moléculaire; Métabolisme; Sources hydrothermales; Micro organismes; Microbiologie.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/these-7295.pdf
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Etude de la salubrité de l'Anse de l'Aiguillon 1996-1997 ArchiMer
Leguay, Didier.
Les arrêtés préfectoraux n°96.979 du 09 avril 1996 pour la Charente-Maritime et n°96.019 du 23 mai 1996 pour la Vendée, portant classement de salubrité des zones de production conchylicoles, ont défini pour chaque département respectif des zones géographiques, et leur ont attribué un statut sanitaire. L'entité "Anse de l'Aiguillon" est séparée en deux par la Sèvre Niortaise qui constitue une limite naturelle et administrative, elle est de ce fait gérée par les deux Directions Départementales des Affaires Maritimes de Vendée et de Charente-Maritime. La partie Vendéenne a été numérotée 85-11 et la partie charentaise 17-01. L'Anse de l'Aiguillon, dans son ensemble, a fait l'objet d'un classement "A provisoire", en l'attente d'informations complémentaires...
Tipo: Text Palavras-chave: Zones conchylicoles; Salubrité; Etude de zone; Microbiologie; Anse Aiguillon.
Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00149/26028/24128.pdf
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Etude sur les risques de contamination microbiologique des oursins ArchiMer
Chavanon, Fabienne; Bouchoucha, Marc.
L’objet principal de cette étude est d’évaluer et suivre les niveaux de contamination des oursins dans un secteur identifié comme exposé aux sources de contamination microbiologique, afin de vérifier l’hypothèse selon laquelle les oursins, organismes brouteurs et non filtreurs, sont peu ou pas sensibles à la contamination microbiologique par rapport à des coquillages du groupe III.Les résultats des analyses montrent que pour cette zone classée A par arrêté préfectoral, les oursins, sont susceptibles d’être fortement contaminés lors de pollutions bactériologiques.La contamination peut être plus importante que dans les moules, organismes filtreurs.
Tipo: Text Palavras-chave: Microbiologie; Classement de zone; Oursin.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00170/28147/26378.pdf
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Impacts microbiologiques comparés des fleuves côtiers dans le Pertuis Breton 2002-2004. Rapport final ArchiMer
Ryckaert, Mireille; Thomas, Gerard; Derrien, Annick.
Les résultats du réseau REMI et de l’étude de salubrité 1998-2000 contractualisée entre la SRC Ré-Centre-Ouest et l’IFREMER, ont établi la responsabilité de la Sèvre, du Lay et du Curé dans les épisodes de contaminations microbiologiques du pertuis Breton. Toutefois, ces résultats ne permettent pas de préciser le rôle respectif de chaque cours d’eau. Des investigations complémentaires s’avèrent nécessaires pour répondre à cette question. Le présent rapport synthétise l’ensemble résultat acquis au cours de cette étude.
Tipo: Text Palavras-chave: Microbiologie; Surveillance; Réseau REMI; Contamination; Pertuis Charentais; Charente-Maritime.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00140/25081/23189.pdf
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Journées Rémi des 23 et 24 novembre 1998 - Réseau de contrôle microbiologique (Rémi) et surveillance microbiologique ArchiMer
Catherine, Martial.
Ce document est un rapport de synthèse des présentations faites lors des journées REMI, tenues à Nantes les 23 et 24 novembre 1998. Les exposés de la première journée sont principalement destinés aux actions visant à améliorer le fonctionnement du réseau REMI. Ils concernent les sujets suivants : bilan de la mise en oeuvre du réseau de contrôle REMI en 1998 (nouvelle version), bilan de l'état d'avancement du plan qualité surveillance microbiologique et du programme Malthus (méthodologie, normalisation), approches préliminaires pour la détermination des fréquences d'échantillonnage en vue de la surveillance régulière des zones de production classées. La seconde journée est dédiée aux études conduites par les laboratoires côtiers, dont les procédures sont...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; Réseau; Surveillance; Microbiologie; Quadrige; Assurance qualité; AFNOR; Impédancemétrie; Rejets agricoles; Station d'épuration; Bateaux de plaisance; Oiseaux; Huîtres; Moules; Tellines; Eaux littorales; Coliformes fécaux; E. coli; Streptocoques fécaux; Bactériophages.
Ano: 1999 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00040/15157/12493.pdf
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La qualité du milieu marin littoral normand du Tréport au Mont - Saint - Michel ArchiMer
Grouhel-pellouin, Anne; Etourneau, Claude; Lamort, Laure.
This report presents an evaluation of Normandy's coastal quality. Datas for this evaluation come from chemical, microbial and phytoplanktonic monitoring networks carried out by IFREMER in the marine environment, microbial survey of marine swimming and shellfish collecting areas carried out by DDASS (Health Office), analysis of local sewage treatment systems conduced by SATESE, and surveys of river's water quality carried out by DDE (Equipment Office). Among each area, pollution sources are identified and present or future actions to improve marine water quality are listed according to shellfishing or swimming vocation of these areas.
Tipo: Text Palavras-chave: Normandie; Qualité; Littoral; Réseaux de surveillance; Physico-chimie; Microbiologie; Phytoplancton; Radioactivité; Normandy; Quality; Coastal Area; Monitoring Network; Chemical; Microbiology; Phytoplankton; Radioactivity.
Ano: 1996 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00102/21347/18970.pdf
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Les facteurs écophysiologiques et génétiques ainsi que la ploïdie influencent-ils la réponse de l'huître creuse, Crassostrea gigas, à une infection par des Vibrio ? ArchiMer
Castagnet, Sophie.
Depuis une quinzaine d'années, des mortalités massives d'huîtres creuses Crassostrea gigas, sont observées sur le littoral français durant la période estivale. Des études ont démontré que les mortalités sont plurifactorielles et qu'elles sont la résultante d'interactions entre l'environnement, l'huître (physiologie et génétique) et certains agents infectieux. Durant ce stage, les interactions entre l'huître creuse et deux bactéries de genre Vibrio (Vibrio splendidus et Vibrio aestuarianus), fréquemment associées aux mortalités, ont été étudiées, afin de tenter de comprendre le lien entre les facteurs de l'hôte (origine génétique et physiologie de la reproduction) et les vibrions (production d'un facteur de virulence), pouvant impacter la sensibilité de...
Tipo: Text Palavras-chave: Ecophysiologie; Génétique; Huître creuse; Crassostrea gigas; Vibrio splendidus; Vibrio aestuarianus; Microbiologie.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14442/11741.pdf
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Les maladies parasitaires et microbiennes des crustacés ArchiMer
Leglise, Michel.
La présente conférence traite des maladies parasitaires et microbiennes des crustacés et essentiellement des crustacés commerciaux. Pour chacun des grands groupes de crustacés couramment commercialisés, nous passons en revue les maladies dues à des bactéries : bactéries chitinovores pour tous, Aeromonas pour le crabe Cancer pagurus, Gaffkya pour le homard ; à des protozoaires : ciliés (Ascophrys, Anophrys, par exemple), microsporidies et grégarines ; à des vers et enfin à d'autres crustacés. L'accent est mis sur la "Gaffkyose", maladie bactérienne du homard, qui a fait l'objet de nombreuses études tant sur le continent américain qu'en Europe.
Tipo: Text Palavras-chave: Parasitologie; Parasite; Microbes; Microbiologie; Crutacés; Crustacea.
Ano: 1976 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00013/12466/9302.pdf
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Les productions conchylicoles dans leur écosystème : les conditions de la réussite...les menaces à court et moyen terme ArchiMer
Prou, Jean; Piquet, Jean-come; Goulletquer, Philippe; Mongruel, Remi; Ryckaert, Mireille.
La conchyliculture charentaise est une filière enracinée dans les écosystèmes de la Gironde et des Pertuis Charentais. Les interdépendances de la conchyliculture avec les autres usages présents sur ces territoires sont connues, anciennes et doivent être vues dans une perspective historique. Les concepts de biodiversité développés entre autres dans le Millenium Ecosystem Assessment permettent une lecture nouvelle de la place de la conchyliculture dans son environnement. Les différentes composantes de la biodiversité offrent des services écosystémiques qui permettent à l’homme de profiter de la consommation de coquillages. De la pêche pour sa subsistance à la conchyliculture, la consommation de coquillages oblige à une intervention dans les écosystèmes. Dans...
Tipo: Text Palavras-chave: Conchyliculture; Ecosystème marin; Biodiversité; Nuisance; Cadmium; Algue toxique; Microbiologie.
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00014/12567/9435.pdf
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Organisation d'essais interlaboratoires sur coquillages vivants pour E. coli ArchiMer
Garry, Pascal; Dupont, Jacques; Kaelin, Gaelle; Kergaravat, Cedric; Menanteau, Chantal; Vallade, Emilie; Veron, Antoine; Catherine, Martial.
En microbiologie des aliments, le document LAB REF 02 du cofrac demande aux laboratoires de participer au moins deux fois par an aux comparaisons interlaboratoires organisés dans leur domaine analytique afin de démontrer leur compétence et garantir ainsi la qualité de leurs résultats. Par ailleurs, le règlement CE n°882/2004 du 29 avril 2004 relatif aux contrôles officiels précise dans son article 33 que les laboratoires nationaux de référence organisent « des essais comparatifs entre les différents laboratoires nationaux officiels et assurent un suivi adéquat de ces essais ». Dans ce cadre le Laboratoire National de Référence (LNR) microbiologie des coquillages a mis en place des essais d’intercomparaison destinés à l’ensemble des laboratoires réalisant...
Tipo: Text Palavras-chave: Microbiologie; Analyses microbiologiques; Coquillages; Essais interlaboratoires; Escherichia coli.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25473/23627.pdf
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Prévalence des norovirus dans les huîtres mises sur le marché dans le Département de la Vendée. Période février 2010-mai 2011 ArchiMer
Le Saux, Jean-claude; Lora, M.; Schaeffer, Julien; Poiraud, G.; Le Guyader, Soizick.
L’objet de cette étude est d’évaluer, par les méthodes de détection virale en cours de validation au niveau européen, le niveau de présence des norovirus dans les huîtres à l’expédition et sur les lieux de vente dans un département test, celui de la Vendée. En effet, aujourd’hui peu d’informations existent au niveau international et national sur la prévalence des norovirus dans les coquillages mis dans les circuits de consommation, alors que tous les ans des coquillages, répondant aux critères de mise en marché, sont incriminés ou suspectés dans des foyers de toxi-infections alimentaires collectives liés à la consommation de coquillages, majoritairement contaminés par des virus et plus particulièrement par les norovirus. Cette étude sur la période de...
Tipo: Text Palavras-chave: Microbiologie; Coquillages; Norovirus; Huître creuse; Détection; Santé publique; Département Vendée.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00185/29650/28019.pdf
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Profils de vulnérabilité des zones de production conchylicole de Charente-Maritime (17). Atlas cartographique de zones hydrographiques cohérentes en terme de risque microbiologique ArchiMer
Morin, Dimitri; Le Moine, Olivier; Geairon, Philippe.
. Profils de vulnérabilité des zones de production conchylicole Ce projet s'inscrit au titre de la préservation du littoral dans la démarche d'amélioration de la qualité des eaux de baignade et de la qualité sanitaire des zones et eaux conchylicoles, notamment inscrite dans les orientations fondamentales du Schéma Directeur d'Aménagement et de Gestion des Eaux (SDAGE) des Agences de l'Eau Loire-Bretagne (AELB) et Adour-Garonne (AEAG). L'élaboration des profils de vulnérabilité des zones de production conchylicole a pour objectif global de recenser, de quantifier et hiérarchiser les différentes sources de pollution susceptibles d'impacter les zones de production conchylicole. Ils permettent d'identifier l'origine de la contamination des zones de production...
Tipo: Text Palavras-chave: Profils de vulnérabilité; Zones de production conchylicole; Atlas cartographique; Zones hydrographiques cohérentes; Microbiologie; Charente-Maritime.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00511/62282/66490.pdf
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Qualité bactériologique des zones conchylicoles en Charente-Maritime. ArchiMer
Ifremer, Laboratoire Côtier DEL - La Rochelle; Ifremer, Laboratoire Côtier DEL - La Tremblade.
Le Réseau national de surveillance microbiologique mis en place par l'Ifremer en 1989 permet de porter une appréciation sur la salubrité des zones conchylicoles. Les indicateurs de contamination sont les coliformes fécaux. Les résultats sont exprimés en nombre le plus probable (NPP) de coliformes fécaux (CF) par 100 grammes de chair de coquillages et de liquide intervalvaire. La fréquence de prélèvement est mensuelle et l'effort d'échantillonnage (nombre de points de prélèvements par secteur) est proportionnel à un indice de risque qui tient compte à la fois de la qualité bactériologique estimée du secteur et de sa production coquillière. Le positionnement des points de prélèvement est de type systématique.
Tipo: Text Palavras-chave: Réseau Surveillance; Microbiologie; Bacteriologie; Zones conchylicoles; Département Charente-Maritime.
Ano: 1991 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00146/25742/23848.pdf
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Qualité du milieu marin littoral - Bulletin de la surveillance 2011 - Départements de la Charente-Maritime et de Vendée (Sud) ArchiMer
Ifremer.
L’Ifremer met en oeuvre, à l’échelle de l’ensemble du littoral métropolitain, une surveillance de la qualité du milieu marin côtier pour répondre aux objectifs environnementaux de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE), aux obligations des conventions régionales marines (OSPAR et Barcelone) et aux objectifs sanitaires réglementaires concernant le suivi de la salubrité des coquillages des zones de pêche et de production conchylicoles. Cette surveillance s’appuie sur plusieurs réseaux de surveillance : le réseau de contrôle microbiologique (REMI), le réseau de surveillance du phytoplancton et des phycotoxines (REPHY), le réseau d’observation de la contamination chimique (ROCCH) et le réseau de surveillance benthique (REBENT). Ces réseaux sont mis en oeuvre par...
Tipo: Text Palavras-chave: Réseau surveillance; Microbiologie; Phytoplancton; Phycotoxine; Contamination chimique; Charente Maritime; Sud Vendée.
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00109/22032/19666.pdf
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Qualité du Milieu Marin Littoral. Bulletin de la surveillance 2012. Départements de Charente-Maritime et de Vendée (sud) ArchiMer
Ifremer.
L’Ifremer met en oeuvre, à l’échelle de l’ensemble du littoral métropolitain, une surveillance de la qualité du milieu marin côtier pour répondre aux objectifs environnementaux de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE), aux obligations des conventions régionales marines (OSPAR et Barcelone) et aux objectifs sanitaires réglementaires concernant le suivi de la salubrité des coquillages des zones de pêche et de production conchylicoles. Cette surveillance s’appuie sur plusieurs réseaux de surveillance : le réseau de contrôle microbiologique (REMI), le réseau de surveillance du phytoplancton et des phycotoxines (REPHY), le réseau d’observation de la contamination chimique (ROCCH) et le réseau de surveillance benthique (REBENT). Ces réseaux sont mis en oeuvre par...
Tipo: Text Palavras-chave: Réseau Surveillance; Microbiologie; Phytoplancton; Phycotoxine; Contamination chimique; Charente-Maritime; Sud Vendée.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00142/25344/23427.pdf
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Qualité microbiologique des zones conchylicoles dans les Pertuis Charentais ArchiMer
Thomas, Gerard; Piquet, Jean-come; Ryckaert, Mireille; Masson, Daniel; Pepin, Jean-francois; Polsenaere, Pierre; Fillon, Alain.
Marine environment contamination can affect fishing and shellfish farming products (and shellfish in the first place), thus making them improper for human consumption, threatening public health and producer’s business. Analysis and health risk management are mandatory for consumer’s security and shellfish production survival. About microbial risk, monitoring shellfish production areas and several studies carried by LERPC laboratory give a good view of the microbial contamination impacting the Pertuis Charentais shellfish production area. On the other hand, State-Region Plan Contract (CPER) studies results from 2007 to 2013 are presented and discussed; additionally, the law-prescribed sanitary studies for professional on foot-fishing classification are...
Tipo: Text Palavras-chave: Microbiologie; E. coli; Norovirus; Étude sanitaire; Conchyliculture; Pêche à pied professionnelle; Pertuis Charentais; Microbiology; E.coli; Norovirus; Sanitary(health) studies; Shellfish farming; On foot]fishing; Pertuis Charentais..
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00302/41299/40472.pdf
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