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Accuracy of genomic predictions in Bos indicus (Nellore) cattle. Repositório Alice
NEVES, H. H.; CARVALHEIRO, R.; O'BRIEN, A. M.; UTSUNOMIYA, Y. T.; CARMO, A. S. do; SCHENKEL, F. S.; SÖLKNER, J.; MCEWAN, J. C.; VAN TASSELL, C. P.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B.; QUEIROZ, S. A.; SONSTEGARD, T. S.; GARCIA, J. F..
2014
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Nellore cattle; Genomic selection.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/987574
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Bayesian inference on field data for genetic parameters for some reproductive and related traits of Nellore cattle (Bos indicus) Genet. Mol. Biol.
Faria,Carina Ubirajara de; Magnabosco,Cláudio de Ulhôa; Reyes,Arcadio de los; Lôbo,Raysildo Barbosa; Bezerra,Luiz Antônio Framartino; Sainz,Roberto Daniel.
We used Gibbs sampling in single and two-trait animal models to estimate genetic parameters for some reproductive and related traits of Nellore cattle (Bos indicus). Female traits were age at first calving (AFC), cumulative productivity (CP) and adult weight (AW). For males, scrotal circumferences at 365 and 450 days of age were analyzed. Gibbs sampling using the ‘Multiple Trait using Gibbs Sampling under Animal Model’ (MTGSAM) program of Van Tassel and Van Vleck was used to estimate the (co)variance components of the traits and conduct genetic analyses. Heritabilities were AFC = 0.26, AW = 0.36 and CP = 0.25 under the single-trait animal model. The mean, mode and median estimates for genetic parameters obtained from the marginal posterior distributions...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bayesian inference; Genetic parameters; Heritabilities; Nellore cattle; Reproductive traits.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000300008
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Copy number variations and genome-wide associations reveal putative genes and metabolic pathways involved with the feed conversion ratio in beef cattle. Repositório Alice
SANTANA, M. H. de A.; OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; CESAR, A. S. M.; FREUA, M. C.; GOMES, R. da C.; SILVA, S. da L.; LEME, P. R.; FUKUMASU, H.; CARVALHO, M. E.; VENTURA, R. V.; COUTINHO, L. L.; KADARMIDEEN, H. N.; FERRAZ, J. B. S..
The use of genome-wide association results combined with other genomic approaches may uncover genes and metabolic pathways related to complex traits. In this study, the phenotypic and genotypic data of 1475 Nellore (Bos indicus) cattle and 941,033 single nucleotide polymorphisms (SNPs) were used for genome-wide association study (GWAS) and copy number variations (CNVs) analysis in order to identify candidate genes and putative pathways involved with the feed conversion ratio (FCR). The GWAS was based on the Bayes B approach analyzing genomic windows with multiple regression models to estimate the proportion of genetic variance explained by each window. The CNVs were detected with PennCNV software using the log R ratio and B allele frequency data. CNV...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Nellore cattle; GWAS; Cattle; Feed conversion; Genomics; Cucumber necrosis virus; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066092
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Direct and maternal annual genetic changes for selected traits at weaning and yearling in beef cattle Animal Sciences
Boligon, Arione Augusti; Vicente, Isadora dos Santos; Roso, Vanerlei Mozaquatro; Souza, Fabio Pablos de.
Heritability and direct and maternal genetic changes were estimated in Nellore cattle for the following traits: birth to weaning weight gain (BWG), weaning to yearling weight gain (YWG), weaning conformation (WC), weaning precocity (WP), weaning muscling (WM), yearling conformation (YC), yearling precocity (YP), yearling muscling (YM) and yearling scrotal circumference (SC). Direct and maternal heritability for weaning traits were 0.21±0.03 and 0.13±0.01 (BWG); 0.19±0.03 and 0.07±0.01 (WC); 0.22±0.03 and 0.07±0.01 (WP); 0.20±0.03 and 0.07±0.01 (WM), respectively. For yearling traits, direct heritability were 0.19±0.04 (YWG); 0.32±0.05 (YC); 0.37±0.05 (YP); 0.38±0.05 (YM) and 0.41±0.04 (SC). Positive and significant direct genetic changes (p < 0.05) were...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genetic progress; Nellore cattle; Scrotal circumference; Visual scores; Weight gain..
Ano: 2018 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAnimSci/article/view/42572
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Estimativa do tamanho amostral em medidas repetidas de circunferência escrotal de bovinos Nelore. Repositório Alice
FREITAS, A.R.; SILVA, A. E. D. F. da; UNANIAN, M..
O objetivo deste trabalho foi estimar o tamanho amostral minino (n) de animais pra se detectar diferenca minima significativa entre avaliacoes mensais repetidas da circuferencia escrotal de animais da raca Nelore, dos 10 aos 30 meses de idade, consideradas como 21 condicoes de avaliacao ou medidas repetidas (tratamentos). O valor de n que permite detectar a entre as medias, quando cada individuo e avaliado para t. 2 tratamentos, foi obtido por meio de um programa desenvolvido no statistical Analysis System - SAS, considerando-se o modelo de distribuicao normal t-variada( t=21) com vetor de media zero e matriz de covariancia S, estatistica e distribuicao F com parametro de nao centralidade 2.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Gado de corte; Escrotal circuferencia; Tamanho amostral; Medidas repetidas; Gado Nelore; Beef cattle; Sample size; Scrotal circumference; Nellore cattle.
Ano: 1999 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/44460
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Genotypic and allelic frequencies of gene polymorphisms associated with meat tenderness in Nellore beef cattle. Repositório Alice
CARVALHO, M. E.; ELER, J. P.; BONIN, M. N.; REZENDE, F. M.; BIASE, F. H.; MEIRELLES, F. V.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L.; BALIEIRO, J. C. C.; FERRAZ, J. B. S..
The objectives of this study were to characterize the allelic and genotypic frequencies of polymorphisms in the &#956;-calpain and calpastatin genes, and to assess their association with meat tenderness and animal growth in Nellore cattle. We evaluated 605 Nellore animals at 24 months of age, on average, at slaughter. The polymorphisms were determined for the molecular markers CAPN316, CAPN530, CAPN4751, CAPN4753, and UOGACAST1. Analyses of meat tenderness at 7, 14, and 21 days of maturation were performed in samples of longissimus thoracis obtained between the 12th and 13th rib and sheared using a Warner Bratzler Shear Force. Significant effects were observed for meat tenderness at days 7, 14, and 21 of maturation for the marker CAPN4751, at day 21...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Nellore cattle; Bos Indicus; Polymorphism.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074518
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Temperatura superficial de bovinos considerando áreas com e sem a presença de pelos. Repositório Alice
CENTURION, S. R.; FRANÇA, A. F. de S.; BEZERRA, B. B.; FELIX, G. A.; PIOVEZAN, U..
Nos últimos anos um grande número de estudos utilizando a análise de imagens termográficas de animais na faixa do infravermelho vem sendo realizado. Além dos avanços tecnológicos que tornaram os sensores mais acessíveis, a preocupação com o bem estar e ambiência das instalações animais tem fomentado a utilização desse método não invasivo e de fácil execução. Neste trabalho foram utilizados 20 bovinos das raças Nelore e Pantaneiro. Após tricotomia de uma área sobre o músculo Longissimus dorsi próximo da 13ª costela, seguida de repouso por 24 horas, os animais foram avaliados por três dias consecutivos, seis vezes por dia. Foram aferidas as temperaturas em áreas com e sem pelos com uso de câmera termográfica. O experimento foi realizado em um Delineamento...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bem estar animal; Nelore; Pantaneiro; Tricotomia; Nellore cattle; Pantaneiro cattle; Trichotomy; Pelo; Sistema tegumentar; Bovinos; Animal welfare; Nellore; Hairs.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1050527
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Widespread modulation of gene expression by copy number variation in skeletal muscle. Repositório Alice
GEISTLINGER, L.; SILVA, V. H. da; CESAR, A. S. M.; TIZIOTO, P. C.; WALDRON, L.; ZIMMER, R.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L..
Copy number variation (CNV) is a frequently observed deviation from the diploid state due to duplication or deletion of genomic regions. Although intensively analyzed for association with diseases and production traits, the specific mechanisms and extent by which such variations affect the phenotype are incompletely understood. We present an integrative study on CNV and genome-wide gene expression in Brazilian Bos indicus cattle. We analyzed CNVs inferred from SNP-chip data for effects on gene expression measured with RNA-seq in skeletal muscle samples of 183 steers. Local effects, where expression changes coincided with CNVs in the respective genes, were restricted to immune genes. Distal effects were attributable to several high-impact CNVs that...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Agricultural genetics; Nellore cattle; Gene expression.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1086932
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