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A la recherche de l'huître portuguaise: identification de marqueurs moléculaires discriminant Crassostrea angulata et Crassostrea gigas ArchiMer
Cornette, Florence.
L'étude historique de l'ostréiculture française monte que cette activité est caractérisée par des périodes de prospérités et de pénurie. Des épizooties ont été à l'origine de ces alternances. A chacune de ces période, on a pu constater des changements d'espèces : Ostrea edulis fut remplacée par Crassostrea angulata, de même celle-ci fut remplacée par Crassostrea gigas dans les années 1970. L'étude de la bibliographie montre que les techniques utilisées pour distinguer des espèces Crassostrea angulata et Crassostrea gigas sont insuffisantes. L'évolution des technologies en matière d'analyses génétiques ouvrent de nouvelles perspectives. La recherche de marqueurs moléculaires réalisée sur Crassostrea angulata et Crassostrea gigas, par amplification par PCR...
Tipo: Text Palavras-chave: Crassostrea angulata; Crassostrea gigas; Marqueurs moléculaires; ADN mitochondrial; PCR; Enzymes de restrictions; Haplotypes.
Ano: 1996 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00049/15979/13421.pdf
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A molecular assay for the proactive detection of target site-based resistance to herbicides inhibiting acetolactate synthase in Alopecurus myosuroides. Inra
Délye, C.; Boucansaud, K..
Acetolactate synthase (ALS) inhibitors are the most resistance-prone herbicide group. Rapid resistance diagnosis is thus of importance for their optimal use. We formulate rules to use the derived cleaved amplified polymorphic sequence method to develop molecular tools detecting a change at a given codon, the nature of which is unknown. We applied them to Alopecurus myosuroides (black grass) to develop assays targeting ALS codons A122, P197, A205, W574 and S653 that are crucial for herbicide sensitivity. These assays detected W574L or P197T, or both substitutions, in most plants analysed from a field where ALS inhibitors failed after 3 years of use. Similar assays can easily be set up for any species. Given the rapidity of selection for resistance to ALS...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: ACETOLACTATE SYNTHASE; ALS; AHAS; DCAPS; HERBICIDE; PCR; PROACTIVE DIAGNOSIS; MUTATION; RESISTANCE; SULFONYLUERA; GRASS WEED.
Ano: 2008 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD200883179961&uri=/notices/prodinra1/2009/02/
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A rapid and cheap protocol for preparation of PCR templates in peanut Electron. J. Biotechnol.
Wang,Chuan Tang; Wang,Xiu Zhen; Tang,Yue Yi; Zhang,Jian Cheng; Yu,Shan Lin; Xu,Jian Zhi; Bao,Zhen Min.
This paper describes a simple, low cost and reliable DNA template preparation protocol for polymerase chain reaction (PCR) using immature leaves from peanut seeds or leaves from field-grown plants. The technique may find wide utility in studies involving PCR-based molecular markers, rapid screening for transformants and gene cloning.
Tipo: Journal article Palavras-chave: DNA extraction; Groundnut; PCR; Peanut.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582009000200009
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A simple and efficient method for extraction of Taq DNA polymerase Electron. J. Biotechnol.
Chen,Sique; Zheng,Xiujuan; Cao,Hongrui; Jiang,Linghui; Liu,Fangqian; Sun,Xinli.
Background Thermostable DNA polymerase (Taq Pol ?) from Thermus aquaticus has been widely used in PCR, which was usually extracted with Pluthero's method. The method used ammonium sulfate to precipitate the enzyme, and it saved effort and money but not time. Moreover, we found that 30-40% activity of Taq Pol I was lost at the ammonium sulfate precipitation step, and the product contained a small amount of DNA. Results We provided a novel, simplified and low-cost method to purify the Taq Pol ? after overproduction of the enzyme in Escherichia coli, which used ethanol instead of ammonium sulfate to precipitate the enzyme. The precipitate can be directly dissolved in the storage buffer without dialysis. In addition, DNA and RNA contamination was removed with...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Ethanol precipitation; PCR; Purification; Taq DNA polymerase.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582015000500005
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A simple ethanol wash of the tissue homogenates recovers high-quality genomic DNA from Corchorus species characterized by highly acidic and proteinaceous mucilages Electron. J. Biotechnol.
Kundu,Avijit; Sarkar,Debabrata; Bhattacharjee,Amit; Topdar,Niladri; Sinha,Mohit Kumar; Mahapatra,Bikash Sinha.
A simple miniprep based on early elimination of highly acidic and proteinaceous mucilages through ethanol washing of the tissue homogenates has been developed for the extraction of genomic DNA from mature leaves and seeds of Corchorus spp. As compared to high cetyltrimethylammonium bromide (CTAB)-NaCl DNA extraction followed by ethanol-based removal of remnant mucilages from the DNA pellet, this simple miniprep consistently and reproducibly recovers high amounts of DNA with good spectral qualities at A260/A280 and A260/A230. The purified DNA is efficiently digested by restriction endonucleases, and is suitable for PCR amplification of nuclear microsatellites with expected allele sizes.
Tipo: Journal article Palavras-chave: Corchorus; DNA extraction; Microsatellite; Mucilage; PCR; Restriction digestion.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582011000100010
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Action of phosphorylated mannanoligosaccharides on immune and hematological responses and fecal consistency of dogs experimentally infected with enteropathogenic Escherichia coli strains. Repositório Alice
GOUVEIA, E. M. F.; SILVA, I. S.; NAKAZATO, G.; ONSELEM, V. J. V.; CORRÊA, R. A. C.; ARAUJO, F. R.; CHANG, M.R..
2013
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Enteropathogenic E. coli; In vivo experiment; Dogs; Phosphorylated 31 mannanoligo - saccharides; PCR.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/980129
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Actividad in vitro del extracto acuoso del Bonellia flammea contra hongos fitopatógenos Agrociencia
Moo-Koh,F. Amalia; Cristóbal Alejo,J.; Reyes-Ramírez,Arturo; Tun-Suárez,J. María; Sandoval-Luna,Ruth; Ramírez-Pool,J. Abrahán.
Las enfermedades causadas por hongos en las plantas disminuyen la calidad y el rendimiento de los cultivos; el control de estas enfermedades demanda investigación enfocada a reducir el uso de los fungicidas sintéticos, los cuales generan resistencia de cepas y contaminación al medio ambiente. El extracto acuoso de Bonellia flammea es una alternativa natural de control ya que actúa como fungicida. El objetivo del presente estudio fue evaluar in vitro el efecto del extracto acuoso de B. flammea contra siete hongos fitopatógenos. El diseño experimental fue completamente al azar, los tratamientos fueron cada hongo expuesto al extracto y el hongo sin extracto, la unidad experimental fueron cuatro cajas petri, con cuatro repeticiones, los datos se analizaron...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Inhibición; Control; Fungosis; PCR.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-31952014000800006
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AISLAMIENTO E IDENTIFICACIÓN MORFOLÓGICA, BIOQUÍMICA Y MOLECULAR DE Leifsonia xyli subsp. xyli EN CUBA Rev. Protección Veg.
Iglesia,Aleika; González,Raiza; Martín,Dayamí; Díaz,Maricela; Álvarez,Elba.
En este trabajo se obtiene el cultivo puro de Leifsonia xyli subsp. xyli a partir de variedades cubanas de caña de azúcar y se logra disminuir las dificultades presentadas hasta el momento con el aislamiento de esta fitobacteria de naturaleza fastidiosa. Se evidencia el pleomorfismo típico de esta especie bacteriana y la total coincidencia de las características bioquímicas y moleculares que la identifican. Se cuenta por primera vez en Cuba con aislados caracterizados que pueden ser empleados en futuras investigaciones y servicios, así como en la obtención de antisueros para el diagnóstico serológico de esta importante enfermedad.
Tipo: Journal article Palavras-chave: Leifsonia xyli subp. xyli; Morfología; Bioquímica; PCR; Identificación.
Ano: 2007 URL: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1010-27522007000100004
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Ajuste no protocolo para reações de RAPD em mangueira sem quantificação prévia de DNA. Repositório Alice
LIMA, R. S. N.; SANTOS, C. A. F.; COELHO, A. K. N. S.; SANTOS, I. C. N.; RODRIGUES, M. A..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Manga; CTAB; PCR; Mangifera indica.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/157157
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Alteração da frequência alélica de dois lóci do gene codificante para o isotipo 1 da beta-tubulina de Haemonchus contortus frente a exposição a Ivermectina. Repositório Alice
FROTA, G. A.; SANTOS, J. M. L. dos; VASCONCELOS, J. F.; TEIXEIRA, M.; VIEIRA, L. da S.; MONTEIRO, J. P..
A ovinocaprinocultura no Brasil é uma atividade consolidada, sendo que o maior efetivo do país concentra-se na região Nordeste. As parasitoses gastrintestinais ocasionam perdas econômicas decorrentes do crescimento retardado, diminuição da produção de leite e redução do consumo de alimentos. O Haemonchus contortus é o principal parasita de ovinos e caprinos, seu ciclo evolutivo caracteriza-se por duas fases: a fase parasitária (ocorre no hospedeiro) e a fase de vida livre (no ambiente). O controle das parasitoses geralmente é feito com o uso de antihelminticos sintéticos levando à seleção de parasitas resistentes. O objetivo do estudo foi relacionar o processo de desenvolvimento da resistência antihelmintica para lactonas macrocíclicas (LM) em H. contortus...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Resistência antihelmíntica; Ovino; Caprino; Parasitose; Helminto gastrintestinal; Anti-Helmíntico; Goats; Sheep; Resistance to anthelmintics; PCR; Ivermectin.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1085185
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Alterações microbianas no solo durante o ciclo do milho nos sistemas plantio direto e convencional. Repositório Alice
VARGAS, L.K.; SELBACH, P.A.; SÁ, E.L.S. de.
A disponibilidade de resíduos de aveia-preta, com relação C:N elevada, resulta em imobilização microbiana de nitrogênio no solo, exigindo cuidados no manejo da adubação nitrogenada da cultura subseqüente. O objetivo deste trabalho foi avaliar as alterações na estrutura da comunidade microbiana ao longo do ciclo do milho, na presença de resíduos de aveia-preta e da aplicação de nitrogênio. Foram coletadas amostras de um Argissolo Vermelho distrófico no dia da semeadura do milho e 46, 62, 88 e 112 dias após a semeadura. O nitrogênio foi aplicado 25 dias e 49 dias após a semeadura. As alterações na comunidade microbiana foram avaliadas mediante relações entre carbono (C) e nitrogênio (N), nitrogênio reativo com ninidrina (N-Nin) e carboidratos (CHO) da...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Biomassa microbiana; PCR; Preparos de solo; Imobilização de nitrogênio; Zea mays; Microbial biomass; Soil tillage; Nitrogen immobilization.
Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/112508
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Amplification of 16S rRNA gene sequences to differentiate two highly related bradyrhizobia species Repositório Alice
GIONGO, A.; AMBROSINI, A.; FREIRE, J.R.J.; ZANETTINI, M.H.B.; PASSAGLIA, L.M.P..
A 16S rRNA gene PCR-based assay was developed aiming at a fast molecular diagnostic method to differentiate the two phylogenetically closely related species Bradyrhizobium japonicum and B. elkanii, isolated from soybean nodules, in order to identify those more competitive and comprising greater nitrogen fixation ability for use in the formulation of commercial inoculants. The assay used was able to discriminate ten reference strains belonging to these two Bradyrhizobium species, as well as to efficiently identify 37 strains isolated from fields cultivated with soybean.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: PCR; Rhizobial diversity; Commercial inoculants; Diversidade de rizóbios; Inoculantes comerciais.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/122817
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An effective method for cloning of partial MADS-box genes related to flower development in groundnut Open Agri
Yuan, M..
Palavras-chave: Genes; PCR; DNA; Cloning; Transcription factors; Genomes; Transcription; Genetic structures; Nucleotides; Molecular cloning.
Ano: 2005 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3213
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An improved method for genomic DNA extraction from strawberry leaves. Repositório Alice
NUNES, C. F.; FERREIRA, J. L.; FERNANDES, M. C. N.; BREVES, S. de S.; GENEROSO, A. L.; SOARES, B. D. F.; DIAS, M. S. C.; PASQUAL, M.; BOREM, A.; CANÇADO, G. M. de A..
2011
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fragaria ananassa; DNA; Liofilização; Morango; PCR.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/955705
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Análise comparativa da PCR e HA no diagnóstico de cães suspeitos de parvovirose MV&Z
Dantas, Liliane de Oliveira; Garcia, Rita de Cássia N. Cubel; Miranda, Suzana Carvalho de; Haanwinckel, Maria Cristina Santos; Menini, Rodrigo; Megid, Jane.
O presente estudo teve por objetivo diagnosticar a parvovirose em cães clinicamente suspeitos, utilizando-se a reação em cadeia pela polimerase (PCR) e hemaglutinação (HA) para identificação do agente. Foram examinadas 38 amostras fecais de cães SRD, de ambos os sexos, com idade entre três a sete meses, atendidos no hospital veterinário da FMVZ-UNESP/Botucatu, apresentando suspeita clínica de parvovirose, em presença de quadro de diarreia sanguinolenta, êmese, anorexia, apatia, hipertermia e leucopenia. As amostras fecais foram coletadas por meio de sonda, armazenadas em eppendorfs e congeladas até o processamento. Entre as amostras examinadas, 23 foram positivas para PCR e 21 positivas para HA, independente do animal ter ou não recebido pelo menos uma...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Cães; Parvovirose; PCR; HA.
Ano: 2013 URL: http://www.revistamvez-crmvsp.com.br/index.php/recmvz/article/view/18635
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Análise da expressão gênica pela técnica de PCR quantitativa em tempo real: princípios e fundamentos. Infoteca-e
MORGANTE, C. V.; BLAWID, R..
Neste trabalho são apresentados os conceitos fundamentos da análise da expressão gênica pela técnica de PCR e reúne informações importantes para aqueles que se dedicam ao estudo da genética vegetal. Sumário: Introdução; Rermos básicos utilizados na qPCR; Sistemas para a detecção da fluorescência; Etapas anteriores à reação de qPCR; Parâmetros para a padronização da qPCR; Métodos de quantificação gênica; Referências; Glossário.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: PCR; Metodologia de análise; Biologia molecular; Genética vegetal; Biotecnologia; Biotechnology.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066218
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Análise de polimorfismo do gene da somatotropina em vacas Nelore e seu efeito sobre o peso à desmama de suas progênies Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Faria,F.J.C.; Guimarães,S.E.F.; Lima,R.M.G.; Mourão,G.B.; Pinheiro,L.E.L..
Informações sobre peso à desmama de um rebanho Nelore foram utilizadas após ajuste para idade padrão de 205 dias, sexo da cria, idade da mãe, touro e mês de desmama, para separar as reprodutrizes em dois grupos, cujos filhos diferiam nesse peso. As médias ajustadas pelo método dos quadrados mínimos foram para os grupos pesado (P) e leve (L) de 163,21± 2,18kg e 134,44± 2,18kg, respectivamente, com 41 animais em cada grupo. Essas reprodutrizes foram submetidas à coleta de sangue para estudo de polimorfismos do gene da somatotropina bovina, pela técnica de PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism). A amplificação de uma região entre o éxon III e V do gene da somatotropina permitiu analisar dois sítios de restrição. Para o...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bovino; Somatotropina; PCR; RFLP; Polimorfismo genético.
Ano: 1999 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09351999000600011
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Análise de polimorfismos do gene da beta-lactoglobulina em vacas da raça Nelore e efeitos sobre o peso à desmama de suas progênies Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Faria,F.J.C.; Guimarães,S.E.F.; Mourão,G.B.; Lima,R.M.G.; Pinheiro,L.E.L..
Informações sobre peso à desmama de bezerros Nelore foram utilizadas após ajuste para idade padrão aos 205 dias, sexo, idade da mãe, touro e mês de desmama, para separar as reprodutrizes em dois grupos, segundo o peso de suas crias. As médias de peso dos bezerros ajustadas pelo método dos quadrados mínimos e erros-padrão (LSM± SE) foram para os grupos pesados (P) e leves (L) 163,21± 2,18kg e 134,44± 2,18kg, respectivamente, com 41 animais em cada grupo. Essas reprodutrizes foram submetidas a coleta de sangue para estudo de polimorfismos do gene da beta-lactoglobulina, por meio da técnica de PCR-RFLP. A amplificação e a digestão de um fragmento do gene da beta-lactoglobulina entre o éxon II e III identificou os genótipos 1AA, 24AB e 56BB, com as freqüências...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bovino; Nelore; Beta-lactoglobulina; PCR; RFLP; Polimorfismo genético.
Ano: 2000 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352000000300016
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Análise de RAPD na identificação de cultivares: uma metodologia útil? Rev. bras. sementes
Binneck,Eliseu; Nedel,Jorge Luiz; Dellagostin,Odir A.
Caracteres morfológicos têm sido utilizados tradicionalmente como assinaturas da identidade e pureza varietal e genética. Esses descritores se constituem em uma base pobre, por ser uma medida indireta da composição genética do material. Uma vez que caracteres moleculares revelam diferenças genéticas mais rapidamente, com maior precisão e sem o obscurecimento causado pelo efeito ambiental, oferecem vantagens significantes em termos de discriminação, confiabilidade, rapidez e custo reduzido. Um método molecular relativamente novo, DNA polimórfico amplificado ao acaso (RAPD), baseado na reação em cadeia da polimerase (PCR), tem sido adotado por alguns pesquisadores envolvidos no desenvolvimento de métodos de identificação de cultivares principalmente por ser...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: DNA polimórfico amplificado ao acaso (RAPD); Reprodutibilidade; Marcadores moleculares; PCR.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0101-31222002000100027
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Análise filogenética de Lentivirus de pequenos ruminantes isolados do Ceará. Repositório Alice
FEITOSA, A. L. V. L..
CAEV e MVV têm sido considerados geneticamente distintos, mas antigenicamente relacionados como patógenos de caprinos e ovinos. Além disso, foi demonstrado que estes vírus estão constantes e facilmente transgredindo a barreira entre caprinos e ovinos, com lentivirus CAEV infectando ovinos e lentiírus MVV infectando caprinos (Valas et al., 2000; Karr et al., 1996; Shah et al., 2004). Assim como todos os lentivírus, o genoma de CAEV tem uma alta taxa de mutação e o seu grau de heterogeneidade pode estar relacionado com a baixa fidelidade de transcriptase reversa, que carece da atividade de leitura da enzima exonuclease. A análise genética de Lentivírus de Pequenos Ruminantes (LVPRs) poderá ajudar a compreender a genética, proteínas e antigenicidade destes...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Caprino; Ovino; Genética animal; Filogenética; Lentivirus; Diagnostico; Maedi Visna; Lentivirose; PCR; CAEV.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/532817
Registros recuperados: 299
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