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Avaliação da capacidade preditiva de metodologias de seleção genômica ampla em diferentes cenários simulados de arquiteturas genômicas. Repositório Alice
FREITAS, M. S. de; GARCIA, D. A.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O.; TORRES, R. J. de A..
Foram simulados 35000 SNPs e 19996 animais, de acordo com duas arquiteturas genômicas distintas, com o objetivo de avaliar a apacidade preditiva de diversas metodologias de seleção genômica ampla. Em um cenário de arquitetura genômica homogênea, as acurácias variaram de 0.57 a 0.66. Em geral, as metodologias exibiram resultados semelhantes, indicando que, para características poligênicas, é possível escolher metodologias que são mais fáceis de implantar e são mais eficientes. Para a característica sob uma arquitetura genômica heterogênea, as acurácias variaram de 0.67 a 0.91. As metodologias bayesianas apresentaram as maiores acurácias nesse cenário heterogêneo e são, provavelmente, a melhor opção para a avaliação genômica de características controladas...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Acurácia; Polimorfismos de base única; Valor genético genômico.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1033031
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Bioinformática aplicada à agricultura. Repositório Alice
GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H..
Este capítulo tem por objetivo colocar o leitor a par do estado da arte das principais aplicações da bioinformática na agricultura, particularmente àquelas relacionadas ao melhoramento genético animal e vegetal, executadas no âmbito da Embrapa.
Tipo: Capítulo em livro científico (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Sequenciamento; Melhoramento genético; Estudos de associação genômica ampla; Genome-Wide Association Studies; Polimorfismos de base única; Agricultura; Agriculture; Bioinformatics; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1010705
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