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A Bayesian state-space model to estimate population biomass with catch and limited survey data: application to the thornback ray (Raja clavata) in the Bay of Biscay ArchiMer
Marandel, Florianne; Lorance, Pascal; Trenkel, Verena M..
The thornback ray (Raja clavata) in the Bay of Biscay is presumed to have declined during the 20th Century. To evaluate this decline and estimate biomass trajectories, a hypothetical catch time series was created for the period 1903-2013. A Bayesian state-space biomass production model with a Schaefer production function was fitted to the hypothetical catch time series and to a shorter research vessel Catch Per Unit Eeffort (CPUE) time series (1973-2013, with missing years). A censored likelihood made it possible to obtain biomass estimates without a CPUE time series or only with an estimate of biomass depletion. A simulation-estimation approach showed a high sensitivity of results to the prior for the intrinsic growth rate. The model provided biomass...
Tipo: Text Palavras-chave: Population dynamics; Stock assessment; Data poor; Censored data; Bayes; Thornback ray; State-space model.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00359/47032/46947.pdf
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A model of nematode dynamics in the Westerschelde Estuary OMA
Li, J.; Vincx, M.; Herman, P.M.J..
We developed a time dynamic model to investigate the temporal dynamics of nematode community in the brackish zone of the Westerschelde Estuary. The biomass of four nematode feeding groups observed from March 1991 to February 1992 is used to calibrate the model. Using environmental data as the input, the model predicts the temporal modification and interrelation of four nematode feeding groups. Nematodes achieve a dominant position in the community because of their lower loss rate (in respiration, excretion and natural death). Predators which are deposit-feeding macrobenthos control the variations of dominant nematodes, such as omnivores and non-selective deposit feeders. Food availability causes modification only for rare nematodes such as epigrowth...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diatoms; Ecology; Food; Light; Marine nematodes; Meiobenthos; Population dynamics; Predation; Respiration; Temperature; Nematoda [Nematodes].
Ano: 1996 URL: http://www.vliz.be/nl/open-marien-archief?module=ref&refid=7284
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A preliminary analysis of death cause, capture-related mortality, and survival of adult red deer in northwestern Patagonia Ecología austral
Flueck,Werner T; Smith-Flueck,Joanne M; Bonino,Never A.
The red deer (Cervus elaphus), among the world´s 14 most invasive exotic mammals, has recently arrived in Patagonia. Forty-seven deer were captured, marked with radio collars, and monitored in order to determine survival rates and identify causes of death. Net gunning from a helicopter allowed captures to be evenly distributed through the study area and in a timely manner. The absence of capture related mortality in our study agrees with previously reported low rates for this method. Animals were monitored for periods ranging from 5 to 2611 days. Ten animals provided censored values due to radio failures or being shot: they survived on average 811 days (SE = 221) after capture. Ten animals experienced natural deaths with an average time alive after capture...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Invasion; Cervus elaphus; Puma concolor; Predation; Disease; Radio telemetry; Population dynamics; Capture by net gunning.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1667-782X2005000100004
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Abeilles et Environnement National Institute of Agronomic Research
Leconte, Yves; Belzunces, Luc; Vaissière, Bernard; Vermandère, Jean-Paul; Carré, Gabriel.
Tipo: Working Paper Palavras-chave: Bee; Environment; Ecology; Population dynamics; Pollination; Toxicology; Abeille; Environnement; Ecologie; Dynamique des populations; Toxicologie; Ecologie.
Ano: 2008 URL: http://hdl.handle.net/2174/187
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Análisis de la distribución y dinámica poblacional de lenguados de la Provincia de Buenos Aires (Pisces, Bothidae) OceanDocs
Fabré, N.N..
Los lenguados constituyen un importante recurso pesquero en el Mar Argentino. Más que en los volúmenes desembarcados (9 .731 t en 1991), esta importancia se centra en su elevado valor de comercialización debido a la alta calidad de su carne. Atendiendo a los desembarques totales realizados en el Mercado de Concentración Pesquera de Mar del Plata, los lenguados ocupan el octavo lugar. Estos desembarques están compuestos principalmente por especies de porte mediano a grande pertenecientes al género Paralichthys, y por ejemplares de tamaño mediano o pequeño de las especies Xystreuris rasile, y en menor proporción, Paralichthys isosceles. Este recurso es explotado, en el sector bonaerense, por las flotas de rada o ría y costera, mientras que la flota de altura...
Tipo: Theses and Dissertations Palavras-chave: Geographical distribution; Population dynamics; Population structure; Growth; Reproduction; Mortality; Environmental effects; Ecosystems; Marine fish.
Ano: 1992 URL: http://hdl.handle.net/1834/5158
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Aplicação das inferências clássica e bayestana na estimação dos parâmetros do modelo de densidade populacional de plantas daninhas. Repositório Alice
VISMARA, L. S.; KARAM, D.; MORITA, L. H. M..
A dinâmica da população de plantas daninhas pode ser representada por um sistema de equações que relaciona as densidades de sementes produzidas e de plântulas em áreas de cultivo, Os valores dos parâmetros dos modelos podem ser inferidos diretamente de experimentação e análise estatística ou extraídos da literatura, O presente trabalho teve por objetivo estimar os parâmetros do modelo de densidade populacional de plantas daninhas, a partír de um experimento conduzido na área experimental da Embrapa Milho e Sorgo, Sete Lagoas. MG, via os procedimentos de inferências clássica e Bayesiana,
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Banco de Sementes; Dinâmica populacional; Inferência bayesiana; Inferência clássica; Seed bank; Population dynamics; Bayesian inference; Classic inference.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/490291
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Applying search theory to determine the feasibility of eradicating an invasive population in natural environments AgEcon
Cacho, Oscar J.; Hester, Susan M.; Spring, Daniel.
The detectability of invasive organisms influences the feasibility of eradicating an infestation. Search theory offers a framework for defining and measuring detectability, taking account of searcher ability, biological factors and the search environment. In this paper, search theory concepts are incorporated into a population model, and the costs of search and control are calculated as functions of the amount of search effort (the decision variable). Simulations are performed on a set of weed scenarios in a natural environment, involving different combinations of plant longevity, seed longevity and plant fecundity. Results provide preliminary estimates of the cost and duration of eradication programs to assist in prioritising weeds for control. The...
Tipo: Article Palavras-chave: Bioeconomics; Invasive species; Operations research; Population dynamics; Weed control; Resource /Energy Economics and Policy.
Ano: 2007 URL: http://purl.umn.edu/118522
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Artrópodes edáficos: influência dos sistemas de preparo do solo e de rotação de culturas. Infoteca-e
OLIVEIRA, C. M. de; RESCK, D. V. S.; FRIZZAS, M. R..
RESUMO: Este trabalho objetivou avaliar a influência de sistemas de preparo de solo e de rotação de culturas e pastagem na abundância e dinâmica de artrópodes edáficos. O experimento, instalado em Planaltina, DF, foi composto por 17 tratamentos que corresponderam a sistemas de preparo de solo (convencional e direto) e a rotação de culturas, pastagem e vegetação nativa (Cerrado). Realizaram-se amostragens de solo em três profundidades (0-5 cm, 5-10 cm e 10-20 cm) e em quatro épocas do ano (fevereiro, maio, agosto/setembro e outubro/novembro) entre 2003 e 2006. Os artrópodes foram extraídos em funil de Berlese-Tüllgren e identificados com relação à ordem. Coletaram-se artrópodes pertencentes a três classes: Insecta, Arachnida e Collembolla. Observou-se que...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Entomologia; Inseto; Dinâmica populacional; Manejo do solo; Leguminosa; Gramínea; Entomology; Population dynamics; Soil management; Legumes; Grasses.
Ano: 2006 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/570260
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Aspectos biológicos y ecológicos de Mytilopsis sallei (Recluz, 1849) (Bivalvia: Dreissenidae) en bancos de ostra de la Ciénaga Grande de Santa Marta, Caribe colombiano OceanDocs
Puyana, Mónica.
Mytilopsis sallei es una especie que se encuentra ampliamente distribuida sobre sustratos duros en la Ciénaga Grande de Santa Marta, siendo particularmente abundante sobre bancos de ostra de mangle (Crassostrea rhizophorae), donde alcanza densidades de hasta 5000 indiv/m2. Aunque posee una amplia tolerancia a variaciones en la salinidad y temperatura, prefiere aquellos lugares donde la afluencia de aguas dulces es constante. Puede además tolerar aguas turbias con un alto contenido de sedimentos, como en la desembocadura de los ríos. M. sallei no parece aparentemente, competir con la ostra, incluso en aquellos bancos sometidos a intensa explotación. Esto se debe a las preferencias ambientales de cada especie y a la alta productividad de las aguas de la...
Tipo: Journal Contribution Palavras-chave: Ecology; Population structure; Salinity effects; Temperature effects; Density; Condition factor; Turbidity; Interspecific relationships; Population dynamics; Coastal lagoons; Estuaries; Ecology; Population structure; Turbidity; Estuaries; Density; Population dynamics; Coastal lagoons; Http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2467; Http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_6115; Http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15043; Http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2673; Http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2186; Http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_6111; Http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1697.
Ano: 1995 URL: http://hdl.handle.net/1834/3802
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Assessing the sensitivity of bivalve populations to global warming using an individual-based modelling approach ArchiMer
Thomas, Yoann; Bacher, Cedric.
Climate change exposes benthic species populations in coastal ecosystems to a combination of different stressors (e.g. warming, acidification and eutrophication), threatening the sustainability of the ecological functions they provide. Thermal stress appears to be one of the strongest drivers impacting marine ecosystems, acting across a wide range of scales, from individual metabolic performances to geographic distribution of populations. Accounting for and integrating the response of species functional traits to thermal stress is therefore a necessary step in predicting how populations will respond to the warming expected in coming decades. Here, we developed an individual‐based population model using a mechanistic formulation of metabolic processes...
Tipo: Text Palavras-chave: Benthic species; Biogeography; Climate scenario; Dynamic energy budget; Global warming; Phenology; Population dynamics; Temperature tolerance.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00450/56163/57710.pdf
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Atlantic bluefin tuna: population dynamics, ecology, fisheries and management ArchiMer
Fromentin, Jean-marc; Powers, Joseph.
Both old and new information on the biology and ecology of Atlantic bluefin tuna have confronted scientists with research challenges: research needs to be connected to current stock-assessment and management issues. We review recent studies on habitat, migrations and population structure, stressing the importance of electronic tagging results in the modification of our perception of bluefin tuna population dynamics and behaviour. Additionally, we question, from both scientific and management perspectives, the usefulness of the classical stock concept and suggest other approaches, such as Clark's contingent and metapopulation theories. Current biological information confirms that a substantial amount of uncertainty still exists in the understanding of...
Tipo: Text Palavras-chave: Tuna fisheries; Thunnus thynnus; Stock assessment and management; Population structure; Population dynamics; Atlantic bluefin tuna.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/publication-797.pdf
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Atlas demographique des populations de poissons d'eau douce d'Afrique AgEcon
Moreau, J.; Palomares, M.L.D.; Torres, F.S.B.; Pauly, Daniel.
Tipo: Report Palavras-chave: Freshwater fish; Population dynamics; Stock assessment; Growth curves; Catch/effort; Recruitment; Fishery biology; Africa; Resource /Energy Economics and Policy.
Ano: 1995 URL: http://purl.umn.edu/44838
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Bases ecológicas para o manejo de Bemisia tabaci (Genn.) biótipo B (Hemiptera: Aleyrodidae) em sistemas orgânicos de produção de tomate. Repositório Alice
TOGNI, P. H. B..
A mosca-branca Bemisia tabaci biótipo B é considerada uma das principais pragas do tomateiro por causar perdas de produtividade devido a danos diretos e pela transmissão de diversas viroses (Geminiviridae). As aplicações de inseticidas para seu controle têm se mostrado cada vez mais incipientes. Isso evidencia a necessidade de novas técnicas de manejo baseado nas interações ecológicas entre a mosca-branca e outros componentes bióticos e abióticos do agroecossistema do tomateiro. Em estudos anteriores o consórcio do tomateiro com coentro reduziu os níveis populacionais de B. tabaci, principalmente em sistemas orgânicos de produção. Porém, os mecanismos pelos quais o coentro pode afetar as populações de mosca-branca ainda não são evidentes. O objetivo deste...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Agroecologia; Interação inseto-planta; Controle biológico conservativo; Coriandrum sativum; Insect-plant interaction; Conservation biological control; Population dynamics; Dinâmica populacional; Agroecology.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/657043
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Bemisia tabaci, Brevicoryne brassicae and Thrips tabaci abundance on Brassica oleracea var. acephala. Repositório Alice
LEITE, G.L.D.; PICANÇO, M.; JHAM, G.N.; MOREIRA, M.D..
Kale Brassica oleracea var. acephala is attacked by whitefly Bemisia tabaci, aphid Brevicoryne brassicae and Thrips tabaci. One of the main reasons for extensive insecticide application is the lack of information about factors that control insect population. The objectives of this study were to investigate the relationships between predators and parasitoids, organic compound leaves, levels of leaf nitrogen and potassium, total rainfall, relative humidity, sunlight and median temperature on the abundance of whitefly, aphid, and thrips in kale genotype "Talo Roxo". The beating tray method, direct counting and magnifying lens were used to estimate the number of these pests, predators and parasitoids. Median temperature, sunlight and relative humidity...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Population dynamics; Nonacosane; Climatic factors; Dinâmica populacional; Nonacosano; Fatores climáticos; Braconidae.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/113870
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Beroe ovata Mayer, 1912 (ctenophora, atentaculata, beroida) в прибрежных водах северо-восточной части Черного моря IBSS Repository
Луппова, Н. Е..
Beroe ovata впервые отмечен у побережья Северного Кавказа в августе 1997 г. Численность его была значительна, в то время как популяция другого гребневика - Mnemiopsis leidyi -была заметно угнетена. В настоящей работе рассмотрены изменения плотности популяции и среднего размера тела В. ovata в связи с выеданием им пищи - мнемиопсиса - с 1997 по 2000 гг.
Tipo: Journal Contribution Palavras-chave: Population dynamics; Population dynamics; Http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_6111.
Ano: 2002 URL: http://repository.ibss.org.ua/dspace/handle/99011/498
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Biología, ecología y explotación de la raya platana Atlantoraja platana (Günther, 1880), (Chondrichthyes, Rajidae), del golfo San Matías OceanDocs
Coller, N.M..
La “raya platana” (Atlantoraja platana), es una especie endémica del Atlántico Sudoccidental, habita desde los 22º S (Uruguay y sur de Brasil) hasta los 42º S, región del Golfo San Matías (Argentina). El área de estudio del presente trabajo fue el Golfo San Matías (41º- 42º S y 64º- 65º O). El material analizado (778 hembras y 709 machos) fue colectado durante muestreos mensuales de las capturas desembarcadas por los barcos pesqueros de la flota local (muestreos de desembarque); muestras extraídas a bordo de las embarcaciones pesqueras por el programa de observadores a bordo, durante los años 2004 y 2005 y los meses de marzo, abril y mayo de 2006; y durante la realización de campañas de investigación pesquera (primavera de 2004, 2005 y 2006). Se describió...
Tipo: Theses and Dissertations Palavras-chave: Fishery biology; Ecology; Feeding behaviour; Age (biological); Growth; Coastal environment; Morphology (animal); Reproduction (biology); Spatial distribution; Population dynamics; Abundance.
Ano: 2012 URL: http://hdl.handle.net/1834/5235
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Biologie et dynamique des populations d’Anchois (Engraulis encrasicolus) des côtes mauritaniennes. OceanDocs
Ba, I.S..
Résumé: Cette étude traite de la biologie et de la dynamique des populations d’anchois (Engraulis encrasicolus) des côtes mauritaniennes. Après un bref rappel des conditions climatiques et hydrobiologiques de la région, une tentative de mise en évidence de race ou population locale a montré que cette espèce pourrait être rattachée à la population méridionale atlantique du Golfe de Gascogne. En Mauritanie, l’Anchois n’est pêché que de façon accessoire. Les captures les plus abondantes sont réalisées de mai à Septembre essentiellement dans la zone nord où l’on observe un upwelling permanent. Pour évaluer la taille du stock, des estimations de biomasse par échointégration ont été effectuées, mais celles-ci n’ont pas permis de donner un ordre de grandeur...
Tipo: Theses and Dissertations Palavras-chave: Anchovy fisheries; Upwelling; Population dynamics; Mortality.
Ano: 1988 URL: http://hdl.handle.net/1834/676
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Biologie et exploitation du poulpe Octopus vulgaris (Cuvier, 1797) des côtes mauritaniennes OceanDocs
Dia, M.A..
L’étude porte sur l’exploitation, la biologie et la dynamique du poulpe (Octopus vulgaris, Cuvier) des eaux mauritaniennes. La répartition spatio-temporelle dans la région du Cap Blanc ne semble être liée ni à la taille, ni au sexe, mais varie au cours de l’année. L’analyse de l’état actuel de la pêcherie basée sur les congélateurs céphalopodiers met en évidence une augmentation de l’effort de pêche et la poursuite de chute des p.u.e. La composition des captures révèle une progression du pourcentage des individus de poids inférieur à 200 grammes (« poulpo »). L’étude biologique montre qu’il existe deux saisons de reproduction par an (mai-juillet et septembre-novembre) qui engendrent deux recrutements, l’un en mai et l’autre à partir de septembre. La...
Tipo: Theses and Dissertations Palavras-chave: Reproduction; Common octopus; Population dynamics; Environnement; Dynamique de population; Exploitation; Environment; Poulpe; ZEE Mauritanienne; Distribution; Mauritanian EEZ; Biologie; Croissance; Growth; Octopus vulgaris; Biology; Octopus fisheries.
Ano: 1988 URL: http://hdl.handle.net/1834/675
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Biologie et pêche traditionnelle des crevettes pénéides dans l'embouchure d'un fleuve en milieur semi-aride (sud-ouest de Madagascar) ArchiMer
Laroche, Jean; Benoely,; Siaviri, A.
Traditional fishing using beach seines was studied over a period of one year at the mouth of the Onilahy river. The catches/efforts were recorded on a daily basis, biological sampling and the measurement of hydrological parameters being carried out twice a month. The moderate variations of salinity and temperature (14 < salinity < 35; 25 degrees C < temperature < 30 degrees C) which were observed in the estuary can be explained by the semiarid climate of the area. Four species of penaeid shrimps are to be found on the Onilahy: Metapenaeus monoceros, Panaeus indicus, Penaeus monodon and Penaeus japonicus, which were mainly caught at the subadult/adult stage with a Carapace length between 10 and 50 mm. The presence of these important sizes at the...
Tipo: Text Palavras-chave: Pêche; Estuaire; Dynamique population; Croissance; Taille corporelle; Cycle évolutif; Zone semi aride; Madagascar; Penaeus japonicus; Penaeus monodon; Penaeus indicus; Metapenaeus monoceros; Rivière Onilahy; Afrique; Milieu saumâtre; Macrura; Decapoda; Crustacea; Arthropoda; Invertebrata; Fishing; Estuaries; Population dynamics; Growth; Body size; Life history; Semi arid zone; Malagasy Republic; Penaeus japonicus; Penaeus monodon; Penaeus indicus; Africa; Brackish water environment; Macrura; Decapoda; Crustacea; Arthropoda; Invertebrata.
Ano: 1995 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00097/20828/42822.pdf
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Biostatistiques et Processus Spatiaux National Institute of Agronomic Research
Chadoeuf, Joël.
Tipo: Working Paper Palavras-chave: Ecology; Epidemiology; Population dynamics; Biostatistics; Ecologie; Epidémiologie; Dynamique des populations; Biostatistique.
Ano: 2008 URL: http://hdl.handle.net/2174/186
Registros recuperados: 159
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