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Amplification of microsatellites in two haemulid species (Haemulon aurolineatum and Haemulon steindachneri) Boletín de Investigaciones
Pabón Quintero,Paula E.; Tavera,José Julián; Millán-Márquez,Ana María; Acero P,Arturo.
ABSTRACT Genetic-population studies in marine fish have allowed to study patterns of dispersal and connectivity between habitats. One important tool in population genetics is the use of microsatellite molecular markers. Cross-amplification of microsatellite is a method that consists in using primers designed for one species in a different one but phylogenetically related. Because of the importance of genetic studies of populations in artisanal fisheries species, primers were evaluated and designed for the species Haemulon aurolineatum and Haemulon steindachneri. Samples were collected from the artisanal fisheries in Baru-Colombia. Amplification was standardized for 12 microsatellites which ten were polymorphic for H. aurolineatum and nine for H....
Tipo: Journal article Palavras-chave: Haemulidae; Grunts; Primers; Polymorphism; Population genetics.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0122-97612018000100151
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Análises genéticas aplicadas à seleção de búfalos (Bubalus bubalis) para carne de qualidade. Repositório Alice
SILVA, R. P. da; BRITO, L. G.; BAGON, A..
A carne de búfalo é considerada um alimento nobre, tanto pelo seu valor nutricional, como pelos aspectos sensoriais extremamente desejáveis. A utilização de técnicas de biologia molecular nos estudos de genoma bubalino permite identificar indivíduos com genótipos favoráveis para a produção de carne. Dentre os genes de interesse para programas de melhoramento genético de bubalinos podemos citar o gene da leptina, associado a características de interesse pecuário como a deposição de gordura na carcaça, produção de leite, capacidade de consumo, conversão alimentar, bem como características reprodutivas. O objetivo do presente trabalho foi caracterizar e selecionar pares de primers para PCR-RFLP provenientes de estudos do genoma bubalino para o gene da...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bubalino; Primers; Leptina.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/917762
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Caracterização fenotípica e molecular de esporos de fungos micorrízicos arbusculares mantidos em banco de germoplasma. Repositório Alice
NOVAIS, C. B. de; SOUZA, F. A. de; SIQUEIRA, J. O..
Resumo ? O objetivo deste trabalho foi caracterizar fenotípica e genotipicamente isolados de espécies de fungos micorrízicos arbusculares (FMA) mantidos em cultura pura e avaliar a aplicabilidade da técnica PCR-DGGE desenvolvida para Gigaspora, na identificação molecular de espécies de FMA pertencentes a outros gêneros. A caracterização fenotípica das espécies foi realizada de acordo com critérios morfológicos, descritos pela taxonomia, e com uso de descrições originais das espécies presentes na literatura especializada. A análise genotípica foi feita com base na discriminação específica da região V9 do 18S rDNA, que permitiu a diferenciação das espécies e não revelou qualquer diferença entre os isolados geográficos de Glomus clarum, e entre os de Glomus...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Morphological characterization; Molecular identification; Primers; Glomeromycota; Taxonomy.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/876025
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Cross-species microsatellite amplification in South American Caimans (Caiman spp and Paleosuchus palpebrosus) Genet. Mol. Biol.
Zucoloto,Rodrigo Barban; Villela,Priscilla Marqui Schimidt; Verdade,Luciano Martins; Coutinho,Luiz Lehmann.
Microsatellite DNA markers have been used to assess genetic diversity and to study ecological behavioral characteristics in animals. Although these markers are powerful tools, their development is labor intensive and costly. Thus, before new markers are developed it is important to prospect the use of markers from related species. In the present study we investigated the possibility of using microsatellite markers developed for Alligator mississipiensis and Caiman latirostris in South American crocodilians. Our results demonstrate the use of microsatellite markers for Paleosuchus palpebrosus, Caiman crocodilus and Caiman yacare.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: SSR; STR; Primers; Crocodilians; Alligatorinae.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572006000100015
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Desenho de primers degenerados através de bioinformática. Infoteca-e
OLIVEIRA, E. M. M.; OLIVEIRA, T. C. de; SOUZA, A. M. de; SANTOS, T. F. DOS.; LIMA, I. S. DE.
2015
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Primers; Bioinformática.
Ano: 2015 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1028552
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Diagnóstico de la presencia de roya naranja (Puccinia kuehnii (Krüger) Butler) en clones comerciales de caña de azúcar (Saccharum spp. Híbridos) en el sureste de México. Colegio de Postgraduados
Pérez Hernández, Set.
La roya naranja (Puccinia kuehnii) es una enfermedad fungosa que afecta al cultivo de la caña de azúcar (Saccharum spp. Híbridos). La enfermedad afecta la capacidad fotosintética de la planta y reduce su crecimiento y desarrollo. El objetivo de la presente investigación fue determinar la presencia de la enfermedad de la roya naranja en clones comerciales de caña de azúcar en el sureste de México e identificar molecularmente el agente causal. En áreas de abastecimiento de los ingenios Santa Rosalía, Presidente Benito Juárez, Azuremex, Tabasco; Huixtla, Chiapas; La Joya, Campeche y San Rafael de Pucté, Quintana Roo, se colectaron hojas con síntomas y lesiones características de la roya naranja. Las hojas se cortaron en pequeñas porciones y se colocaron en...
Palavras-chave: Puccinia kuehnii; DNA; Saccharum spp.; Iniciadores; Agente causal; Primers; Causal agent; Producción Agroalimentaria en el Trópico; Maestría.
Ano: 2014 URL: http://hdl.handle.net/10521/2363
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Diversidade do gene codificador da "sintase do fator de lacrimejação" em seis espécies do gênero Allium. Repositório Alice
FONSECA, M. E. N.; SANTOS, C. A. F.; OLIVEIRA, V. R.; BOITEUX, L. S..
bitstream/item/208974/1/digitalizar0242.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Isolado; PCR; Primers; Polinorfisno; Allium Cepa; Allium Fistulosum; Cebola; Enzima.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/780334
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Diversidade do gene codificador da "sintase do fator de lacrimejação" em seis espécies do gênero Allium. Repositório Alice
FONSECA, M. E. N.; SANTOS, C. A. F.; OLIVEIRA, V. R.; BOITEUX, L. S..
bitstream/item/208977/1/A662-T1220-Comp.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Isolado; PCR; Primers; Polimorfisno; Allium Cepa; Allium Fistulosum; Cebola; Enzima.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/781561
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Especificidade dos primers PAS-R/PAS3-D e PAS-R/PAS-D na detecção de isolados de Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae do estado do Pará. Repositório Alice
OLIVEIRA, L. C. de; ISHIDA, A. K. N.; BONFIM, K.; BOARI, A. de J..
A mancha bacteriana (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae) destaca-se entre as doenças da cultura do maracujazeiro. Ocorre sob condições de umidade e temperaturas altas e se encontra disseminada no Estado do Pará. O objetivo deste trabalho foi avaliar a especificidade dos pares de primers Pas-R/Pas3-D e Pas-R/Pas-D na detecção de 29 isolados de X. axonopodis pv. passiflorae provenientes de diferentes regiões produtoras de maracujá do Estado. Verificou-se que os primers Pas-R e Pas3-D amplificaram 2 fragmentos de aproximadamente 750pb e 250pb nos isolados de X. axonopodis pv. passiflorae. Enquanto que os primers Pas-R e Pas-D amplificaram 1 fragmento de aproximadamente 1000pb.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mancha bacteriana do maracujazeiro; Variabilidade genética; Primers.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/950381
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Isolamento e caracterização molecular de Bacillus thuringiensis extraídos em solo da Amazônia brasileira. Repositório Alice
MOURÃO, A. H. C.; TORRES, A. A. G.; SILVA, R. B.; LANZA, F. M.; NASCIMENTO, P. T.; SOUZA, C. S. F.; MANIGAT, D.; FERNANDES, F. O.; PINHEIRO, D. H.; BAUM, J. L. O.; VALICENTE, F. H..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: PCR; Primers; Ocupação do solo.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/967663
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Molecular detection of nifH gene-containing Paenibacillus in the rhizosphere of sorghum (Sorghum bicolor) sown in Cerrado soil. Repositório Alice
COELHO, M. R. R.; CARNEIRO, N. P.; MARRIEL, I. E.; SELDIN, L..
Aims: To develop a polymerase chain reaction (PCR)-based approach for the detection of nifH gene-containing Paenibacillus in environmental samples. Methods and Results: The primers, nitHPAENf and nitHPAENr, were designed and tested with DNA from: (i) strains of different nitrogen-fixing Paenibacillus species, (ii) strains of other nitrogen-fixing genera and (iii) rhizosphere of sorghum sown in Cerrado soi! amended with either 12 or 120 kg ha-1 of nitrogen fertilizer. All nitrogen-fixing Paenibacillus strains tested and the DNA samples from rhizosphere soil were amplified when these primers were used, generating a 280 bp fragment. When the PCR products obtained from both sorghum rhizospheres were cloned and sequenced, the majority of the clones analysed...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Sorghum; NifH; Paenibacillus; PCR; Primers.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/491946
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Seleção de primers para amplificação por PCR de regiões do gene da leptina bubalina. Repositório Alice
SILVA, R. P. da; BRITO, L. G.; BAGON, A..
Buscou o presente estudo identificar e selecionar pares de primers para amplificação por PCR da região promotora e exon 1 do gene da leptina bubalina depositada no Genbank (AY495586).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bubalino; Primers; Leptina.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/940349
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Selection of primers for the molecular characterization in the Etlingera elatior. Repositório Alice
FORTES, A. C. R.; SILVA, C. S.; TEIXEIRA, A. C. S.; COSTA, M. R.; POLTRONIERI, M. C..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caracterização molecular; Primers.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/958242
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Sequenciamento de nova geração no desenvolvimento de Marcadores Microssatélites Dinucleotideos para abelhas-sem-ferrão. Repositório Alice
SILVA, G. R. da; SOUZA, I. G. de B.; PEREIRA, F. de M.; LOPES, M. T. do R.; SOUZA, B. de A.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M..
De importância econômica e ecológica, a abelha-sem-ferrão Meliponafasciculata Smith 1858 (tiuba) vem sofrendo uma redução populacional significativa provocada pelo desmatamento e uso indiscriminado de agrotóxicos. O uso de marcadores moleculares microssatélites é uma ferramenta importante na caracterização genética populacional, etapa crucial para a conservação da espécie.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Primers; Tiuba; Biodiversidade.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1106024
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Sintomalogia e desenvolvimento de metodologia molecular de caracterização de Begomovirus em algodão. Repositório Alice
LUCENA, M. G.; HOFFMANN, L. V.; JAIN, S.; BARROSO, P. A. V.; OLIVEIRA, T. S.; INQUE-NEGATA, A. K..
2009
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Doença do algodão; Primers; Vírus.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/661722
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SSRs derivados de ESTs relacionadas a proteínas kinases dependentes de cálcio, potencialmente envolvidas na tolerância do algodoeiro ao estresse hídrico. Repositório Alice
FRAGOSO, M. F.; SILVA, G. E. L.; LIMA, L. H. G. M.; CARVALHO, L. P. de; LIMA, M. M. de A.; LIMA, L. M. de; BRITO, G. G. de..
2008
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gossypium hirsutum; Pesquisa in silico; Primers.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/278058
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Transferibilidade de marcadores microssatélites de coco (Cocos nucifera) para butiá (Butia odorata) Repositório Alice
MISTURA, C. C.; BARBIERI, R. L.; CASTRO, C. M.; PRIORI, D.; VILLELA, J. C. B..
2012
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Arecaceae; Recursos genéticos; SSR; Variabilidade genética; Primers.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/966416
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Transferibilidade de primers microssatélites de Cucumis melo para Luffa cylindrica. Repositório Alice
PEIXOTO, A. A. P.; VILLELA, J. L.; FERREIRA, M. A. J. F.; FERREIRA, M. A.; AMARAL, Z. P. de S.; VIEIRA, R. R. T.; LIRA, M. T. R.; BUSO, G. S. C..
2009
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melão; Bucha vegetal; Cucurbitaceae; Genetica vegetal; Primers; DNA.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/662357
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Transferibilidade de primers microssatélites de Cucumis melo para Luffa cylindrica. Repositório Alice
PEIXOTO, A. A. P.; VILLELA, J. L.; FERREIRA, M. A. J. F.; FERREIRA, M. A.; AMARAL, Z. P. de S.; VIEIRA, R. R. T.; LIRA, M. T. R.; BUSO, G. S. C..
2009
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melão; Bucha vegetal; Cucurbitaceae; Genetica vegetal; Primers; DNA..
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/748689
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Using ancient DNA to unravel taxonomic puzzles: the identity of Deuterodon pedri (Ostariophysi: Characidae) Neotropical Ichthyology
Silva,Priscilla C.; Malabarba,Maria C.; Malabarba,Luiz R..
ABSTRACT Accurate identification is essential for any study exploring biodiversity. Unfortunately, museum type specimens preserved for more than a hundred years are often not informative enough for precise identification of the species represented by the name-bearing type. The use of ancient DNA can help solve taxonomic problems when name-bearing types no longer have diagnostic morphological features that allow for an accurate identification of the species involved. That is the case for Deuterodon pedri, an endemic species from a small drainage in the rio Doce basin in Minas Gerais, Brazil, for which the type material is in poor condition. Specimens of D. pedri were collected in 1865 by the Thayer Expedition to Brazil and fixed in spirits, enabling them to...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Lectogenetype; Mini-Barcode; Primers; Rio Doce; Thayer Expedition.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1679-62252017000100224
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