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AFLP mappings of quantitative trait loci (QTLs) for elongation ability in rice, Oryza sativa L. International Rice Research Institute
Posa, Grace Belinda T..
xvi, 91 leaves : ill. Thesis (M.S.) -- University of the Philippines at Los Baños,
Tipo: Thesis Palavras-chave: Amplified fragment length polymorphism; Rice; Chromosome mapping; Quantitative trait loci; Stem elongation; Plant growth.
Ano: 1998 URL: http://hdl.handle.net/123456789/545
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Analysis of environmental effects on expression of root penetration QTLs in upland rice International Rice Research Institute
Cairns, Jill Elizabeth.
xxv, 220 p. : ill. Thesis (Ph.D.) -- University of Aberdeen
Tipo: Thesis Palavras-chave: Rice; Environment; Root systems; Quantitative trait loci; Genotype-environment interaction; Drought tolerance; Highlands; Upland rice.
Ano: 2003 URL: http://hdl.handle.net/123456789/411
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Candidate genes for male and female reproductive traits in Canchim beef cattle. Repositório Alice
BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. do A.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; CHUD, T. C. S.; STAFUZZA, N. B.; ROLA, L. D.; MEIRELLES, S. L. C.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; HIGA, R. H.; SILVA, M. V. G. B.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P..
Background: Beef cattle breeding programs in Brazil have placed greater emphasis on the genomic study of reproductive traits of males and females due to their economic importance. In this study, genome-wide associations were assessed for scrotal circumference at 210 d of age, scrotal circumference at 420 d of age, age at first calving, and age at second calving, in Canchim beef cattle. Data quality control was conducted resulting in 672,778 SNPs and 392 animals. Results: Associated SNPs were observed for scrotal circumference at 420 d of age (435 SNPs), followed by scrotal circumference at 210 d of age (12 SNPs), age at first calving (six SNPs), and age at second calving (four SNPs). We investigated whether significant SNPs were within genic or surrounding...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Gado de corte; Gado Canchim; Beef cattle; Genome-wide association study; Single nucleotide polymorphism; Quantitative trait loci.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074373
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Caracterização genotípica de linhagem de corte e postura empregando chip de 60 k em região pleiotrópica do cromossomo 1. Repositório Alice
ROSÁRIO, M. F. do; ATTILIO, D. B.; BRASSALOTI, R. A.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L..
2013
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: QTL; SNPs; Genética; Linhagem; Frango de corte; Galinha para postura; Single nucleotide; Polymorphism; Quantitative trait loci; Laying Hens; Chicken breeds.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/968936
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Co-localization of QTL for root traits under low phosphorus availability with candidate genes homologues to PSTOL1 in maize. Repositório Alice
AZEVEDO, G. C.; CHEAVEGATTI-GIANOTTO, A.; NEGRI, B. F.; HUFNAGEL, B.; LANA, U. G. P.; SILVA, L. C.; MAGALHAES, J. V.; GARCIA, A. A. F.; SOUSA, S. M. de; GUIMARAES, C. T..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Milho; Gene; Fósforo; Quantitative trait loci.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/977225
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Detection of quantitative trait loci for leaf chlorophyll content at maximum tillering International Rice Research Institute
Dong, Y. J.; Ogawa, T.; Lin, D. Z.; Kamiunten, H.; Terao, H.; Matsuo, H..
p.16-17
Palavras-chave: Quantitative trait loci; Leaves; Chlorophyll; Tillering; Inbred rice; Alleles; Segregation; Gene mapping; Genetic markers.
Ano: 2005 URL: http://hdl.handle.net/123456789/1095
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Gene mapping and quantitative trait loci analysis of flood tolerance in rice (Oryza sativa L.) International Rice Research Institute
Sripongpankul, Krishnapong.
xxi, 137 l. : ill. Thesis (Ph.D.) -- University of the Philippines at Los Baños
Tipo: Thesis Palavras-chave: Chromosome mapping; Rice; Plant genetics; Flooding tolerance; Quantitative trait loci.
Ano: 1998 URL: http://hdl.handle.net/123456789/542
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Genome-wide association study for femur-related traits in broilers. Repositório Alice
ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; SOLLERO, B. P.; SUREK, D.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..
Abstract: Due to the intense selection for heavier and faster growing broilers, metabolic disorders such as skeletal problems became a worldwide concern. Advances in genome-wide association study (GWAS) methodologies increased the possibility of elucidating the genetic architecture controlling bone integrity traits. Therefore, the aim of this study was to perform a GWAS to identify potential genetic markers and candidate genes associated with femur traits in a paternal broiler line developed by Embrapa. To this, three femur bone-related traits were evaluated in 1,433 chickens: dry matter (FDM), ash content (FAC) and breaking strength (FBS). Chickens were genotyped using the 600K Affymetrix® Axiom® HD panel. A total of 16 regions associated to FAC, being a...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Integridade óssea; Características do fêmur; Associação genômica; QTLs; Melhoramento Genético Animal; Frango de Corte; Formação Óssea; Fêmur; Animal genetic resources; Broiler chickens; Bone metabolism; Quantitative trait loci.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1093205
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Identification of mutations in a QTL region on chromosome 3 associated with fatness in chickens. Repositório Alice
MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; GASPARIN, G.; ANDRADE, S. C. da S.; PADUAN, M.; COUTINHO, L. L..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mutations segregating; QTL; Galinha; Melhoramento genético animal; Chickens; Quantitative trait loci.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/971381
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Identification of polymorphisms associated with production traits on chicken (Gallus gallus) chromosome 4. Repositório Alice
PÉRTILLE, F.; ZANELLA, R.; FELÍCIO, A. M.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L..
Genetic selection for production traits has resulted in a rapid improvement in animal performance and development. Previous studies have mapped quantitative trait loci for body weight at 35 and 41 days, and drum and thigh yield, onto chicken chromosome 4. We investigated this region for single nucleotide polymorphisms and their associations with important economic traits. Three positional candidate genes were studied: KLF3 (Krüeppel-like factor 3), SLIT2 (Slit homolog 2), and PPARGC1A (peroxisome proliferator-activated receptor gamma, coactivator 1 alpha). Fragment sequencing of these genes was conducted in 11 F1 animals, and one polymorphism in each gene was selected and genotyped in an F2 population (N = 276) and a paternal broiler line TT (N = 840)....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genetica animal; Genoma; Polimorfismo genético; Ave doméstica; Polymorphism; Gallus gallus; Genetic polymorphism; Quantitative trait loci; Broiler.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1025835
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Identification of polymorphisms in a QTL region on chicken chromosome 2 associated with muscle deposition. Repositório Alice
GODOY, T. F.; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; GASPARIN, G.; ANDRADE, S. C. da S.; PADUAN, M.; COUTINHO, L. L..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Galinha; Polimorfismo genético; Chickens; Genetic polymorphism; Quantitative trait loci.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/971356
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Identification of QTLS associated with percentage of dry matter and midrib color in sorghum. Repositório Alice
PINTO, M. de O.; ROCHA, D. D. D.; SILVA, L. F.; BERNARDINO, K. C.; PASTINA, M. M.; MAGALHAES, J. V. de; SCHAFFERT, R. E..
bitstream/item/176612/1/Identification-QTLS.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sorghum Bicolor; Gene; Quantitative trait loci.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1091327
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Identification of QTLs controlling yield traits in sweet sorghum using genotyping by sequencing. Repositório Alice
PEREIRA, G. S.; SOUZA, V. F.; PARRELLA, R. A. da C.; DAMASCENO, C. M. B.; SIMEONE, M. L. F.; SCHAFFERT, R. E.; BRACONNIER, S.; PASTINA, M. M.; GARCIA, A. A. F.; MAGALHAES, J. V..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genética; Sorgo; Quantitative trait loci; Sorghum bicolor.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/974195
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Identification of quantitative trait loci (QTL) and genetic networks underlying drought tolerance using introgression and pyramiding lines of rice (Oryza sativa L.) International Rice Research Institute
Yunzhu, Jiang.
xii, 145 l. : ill. Thesis (Ph.D.) -- University of the Philippines
Tipo: Thesis Palavras-chave: Rice; Plant genetics; Quantitative trait loci; Drought tolerance.
Ano: 2006 URL: http://hdl.handle.net/10269/128
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Inbreeding effect and genotyping strategies for genomic selection in simulated data. Repositório Alice
NASCIMENTO, G. B.; VENTURA, R. V.; LEDUR, M. C.; SAVEGNAGO, R. P.; SENO, L. de O.; MUNARI, D. P..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: SNPs; Genética; Seleção genotipa; Endogamia; Melhoramento genético animal; Inbreeding; Genetics markers; Quantitative trait loci; Genomic analysis.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/971202
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Informativeness of SNPs on the genome of the Brazilian chicken broiler and layer lines using 60k Illumina BeadChip. Repositório Alice
ATTÍLIO, D. B.; BRASSALOTI, R. A.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; ROSÁRIO, M. F. do.
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: SNPs; Ave; Melhoramento genético animal; Marcador molecular; Poultry; Gene sequences; Genetics markers; Quantitative trait loci.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/971189
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Inheritance study and linkage mapping of resistance loci to Hemileia vastatrix in Híbrido de Timor UFV 443-03. Repositório Alice
PESTANA, K. N.; CAPUCHO, A. S.; CAIXETA, E. T.; ALMEIDA, D. P. de; ZAMBOLIM, E. M.; CRUZ, C. D.; ZAMBOLIM, L.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; SAKIYAMA, N. S..
Coffee leaf rust (CLR) caused by Hemileia vastatrix Berk. et Br. is one of the major Coffea arabica diseases world-wide. CLR resistance has been attributed to at least nine dominant genes, as single or in combination. We present an inheritance study and mapping loci involved in the Híbrido de Timor (HDT) UFV 443-03 resistance to race I, race II, and pathotype 001 of H. vastatrix . Molecular markers were used to ascertain the phenotypic results and to map the putative resistance loci. For all tree isolates, the inheritance study indicated that the resistance of HDT UFV 443-03 is conditioned by two independent dominant loci or by three independent loci (two dominant and one recessive). Molecular marker analyses ascertained that the resistance of HDT UFV...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Leaf rust; Breeding; Chromosome mapping; Quantitative trait loci.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039824
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Investigação de regiões cromossômicas candidatas para associação com a deposição de gordura em bovinos da raça Canchim. Repositório Alice
MEIRELLES, S. L.; VENERONI, G. B.; NUNES, H. de O.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
Este trabalho teve o objetivo de investigar a associação entre os marcadores BMS490, ETH10 do cromossomo 5; INRA133, ILSTS090 do cromossomo 6 e RM222, BMS2142 do cromossomo 19 de bovinos e a característica espessura de gordura subcutânea (EGS) na raça Canchim. Foi estudada uma amostra de 392 animais, composto por dois grupos genéticos: Canchim (5/8 Charolês + 3/8 Zebu) e MA, criados em regime de pasto na Embrapa Pecuária Sudeste, em São Carlos -SP, e na Fazenda Ipameri, em Jussara -GO. O DNA foi extraído de amostras de sangue pelo método de precipitação das proteínas com sal como descrito por Regitano (2001). Os microssatélites foram amplificados por reação em cadeia da polimerase (PCR) e analisados no equipamento ABI 3100 Avant (Applied Biosystems). As...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Espessura de gordura; Marcador molecular; Quantitative trait loci.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/47485
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Mapping a QTL conferring resistance to Fusarium head blight on chromosome 1B in winter wheat (Triticum aestivum L.) OAK
Nishio, Zenta; Orme, Chihiro; Ito, Miwako; Tabiki, Tadashi; Nagasawa, Koichi; Miura, Hideho.
Fusarium head blight (FHB) is one of the most devastating diseases of wheat (Triticum aestivum L.), and the development of cultivars with FHB resistance is the most effective way to control the disease. Yumechikara is a Japanese hard red winter wheat cultivar that shows moderate resistance to FHB with superior bread-making quality. To identify quantitative trait loci (QTLs) for FHB resistance in Yumechikara, we evaluated doubled haploid lines derived from a cross between Yumechikara and a moderate susceptible cultivar, Kitahonami, for FHB resistance in a 5-year field trial, and we analyzed polymorphic molecular markers between the parents. Our analysis of these markers identified two FHB-resistance QTLs, one from Yumechikara and one from Kitahonami. The...
Palavras-chave: Fusarium head blight; Wheat; Resistance; Quantitative trait loci.
Ano: 2016 URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/4454
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Mapping and identifying quantitative trait loci associated with drought resistance in rice (Oryza sativa L.) under different water stress conditions International Rice Research Institute
Zhao, Mingfu.
xiv, 101 l. : col. ill. Thesis (Ph.D.) -- University of the Philippines at Los Baños
Tipo: Thesis Palavras-chave: Rice; Plant genetics; Chromosome mapping; Quantitative trait loci; Drought tolerance; Water stress.
Ano: 2003 URL: http://hdl.handle.net/123456789/398
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