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A biotecnologia nos programas de melhoramento de forrageiras tropicais da Embrapa Gado de Corte. Infoteca-e
CHIARI, L.; RESENDE, R. M. S.; JANK, L.; VALLE, C. B. do; JUNGMANN, L..
Neste trabalho procurou-se apresentar e discutir, de forma ampla, o uso da biotecnologia e seu potencial para os programas de melhoramento de forrageiras tropicais realizados na Embrapa Gado de Corte. O uso da biotecnologia nesses programas é uma atividade recente, mas importantes resultados vêm sendo gerados a fim de auxiliar o processo de obtenção de novas cultivares forrageiras. A maioria dos trabalhos apresentados utiliza marcadores Random Amplification of Polymorphic DNA (RAPD) para aplicações em curto prazo: estudos de diversidade em acessos de bancos de germoplasma, identificação de híbridos e estimação da taxa de cruzamento. Aplicações em médio e longo prazos do uso de marcadores, como mapeamento genético e seleção auxiliada por marcadores...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Pastagem; Melhoramento genético vegetal; Biotecnologia; Forrageira tropcial; Gramínea; Leguminosa; Híbrido; Marcador molecular; RAPD.
Ano: 2007 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/326872
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A multi-approach analysis of the genetic diversity in populations of Astyanax aff. bimaculatus Linnaeus, 1758 (Teleostei: Characidae) from Northeastern Brazil Neotropical Ichthyology
Pamponet,Vanessa de Carvalho Cayres; Carneiro,Paulo Luiz Souza; Affonso,Paulo Roberto Antunes de Mello; Miranda,Viviam Souto; Silva Júnior,Juvenal Cordeiro; Oliveira,Claudine Gonçalves de; Gaiotto,Fernanda Amato.
Few reports are available about the ichthyofauna of typical semi-arid rivers, although the regional diversity has been constantly threatened by human activities, mainly related to impoundment and construction of dams. The goal of the present work was to evaluate using different methods, the population genetic structure of a characin fish, Astyanax aff. bimaculatus, widespread throughout hydrographic basins of Bahia, Northeastern Brazil. Morphological (meristic and morphometric data), cytogenetic (karyotype and Ag-NOR), and molecular (RAPD and SPAR) analyses were carried out in specimens collected upstream and downstream of Pedra Dam, in the main channel of Contas River (Contas River Basin), and in the Mineiro stream, which belongs to the adjacent Recôncavo...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Morphometry; Cytogenetics; RAPD; Population structure; Contas River.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1679-62252008000400010
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A simple method for DNA isolation from Xanthomonas spp. Scientia Agricola
Gomes,Luiz Humberto; Duarte,Keila Maria Roncato; Andrino,Felipe Gabriel; Tavares,Flavio Cesar Almeida.
A simple DNA isolation method was developed with routine chemicals that yields high quality and integrity preparations when compared to some of the most well known protocols. The method described does not require the use of lysing enzymes, water bath and the DNA was obtained within 40 minutes The amount of nucleic acid extracted (measured in terms of absorbancy at 260 nm) from strains of Xanthomonas spp., Pseudomonas spp. and Erwinia spp. was two to five times higher than that of the most commonly used method.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report Palavras-chave: DNA; Xanthomonas; RAPD.
Ano: 2000 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162000000300028
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Análise cromossômica e molecular do javali europeu Sus scrofa scrofa e do suíno doméstico Sus scrofa domesticus Braz. J. Vet. Res. Anim. Sci.
Gimenez,Danilo Lucano; Mota,Lígia Souza Lima Silveira da; Curi,Rogério Abdallah; Rosa,Guilherme Jordão de Magalhães; Gimenes,Marcos Aparecido; Lopes,Catalina Romero; Lucca,Edmundo José de.
A presente investigação teve como objetivos: analisar animais presentes em diferentes criações de javalis no estado de São Paulo, com o intuito de auxiliar a identificação de javalis "puros" assim como javalis híbridos provenientes do cruzamento com o suíno doméstico, para tanto foram utilizadas avaliação do fenótipo dos animais, análises citogenéticas e da técnica molecular de RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA).O estudo do número de cromossomos nas células diplóides em 104 animais destinados a análise citogenética e fenotípica, revelou polimorfismo de 2n=36, 37 e 38 cromossomos. Por meio da técnica de bandamento GTG foi possível identificação da translocação Robertsoniana entre os cromossomos 15 e 17 como responsável por esse polimorfismo. Todavia,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Javali; Híbrido; Citogenética; RAPD; Fenótipos.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-95962003000200009
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Análise da diversidade genética em Stylosanthes guianensis utilizando marcadores RAPD. Infoteca-e
CHIARI, L.; VALLE, J. V. R. do; RESENDE, R. M. S.; CANÇADO, L. J.; SALGADO, L. R.; LEGUIZÁMON, G. O. de C..
O conhecimento da variabilidade genética e da relação entre diferentes acessos de Stylosanthes guianensis é importante para maximizar o uso dos recursos genéticos disponíveis. Este trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade genética em 20 acessos dessa espécie, pertencentes ao banco de germoplasma da Embrapa Gado de Corte, usando marcadores RAPD (DNA Polimórfico Amplificado ao Acaso). Foram selecionados 40 primers randômicos, que produziram um total de 210 bandas; destas, 82 polimórficas (39,05%). Os dados obtidos foram utilizados para gerar uma matriz de similaridade genética usando o coeficiente de Jaccard. A similaridade genética variou de 0,747 a 0,945, o que indicou uma variabilidade genética pouco acentuada entre os acessos estudados. Os...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Pastagem; Melhoramento genético vegetal; Leguminosa forrageira; Stylosanthes guianensis; Marcador molecular; RAPD; Campo Grande; Mato Grosso do Sul; Brasil.
Ano: 2006 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/326900
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Análise da variabilidade genética de Plutella xylostella (Lepidoptera : Noctuidae) utilizando marcadores moleculares RAPD. Infoteca-e
MARTINS, E. S.; QUEIROZ, P. R.; LIMA, L. H. C.; MONNERAT, R. G..
Neste trabalho indivíduos de uma mesma população de P. xylostella foram caracterizados geneticamente por meio de RAPD-PCR. Para isso, foi utilizada uma metodologia já estabelecida para a extração de DNA a partir de lepidópteros e selecionados primers OPA-03, OPA-04, OPA-10, OPA-11 e OPA-13. Foi encontrada alta variabilidade genética, apontada por um coeficiente de similaridade que variou de 35 a 90%.
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Plutella xylostella; Insecta; RAPD; Caracterização molecular.
Ano: 2005 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/187146
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Análise da variabilidade genética de populações de Spodoptera frugiperda em culturas de milho e algodão por meio de marcadores moleculares. Repositório Alice
RAMIRO DA SILVA, C. A..
A lagarta Spodopterafrugiperda (J. E. Smith) é uma praga de grande importância econômica em vários países do mundo. Por ser uma espécie polífaga que ataca severamente diferentes cultivos, ter uma grande capacidade de dispersão do adulto e apresentar uma ação voraz, esse lepidóptero ocasiona perdas na produção agrícola que variam de 15 a 34%. Uma importante ferramenta para melhorar as práticas de gerenciamento da praga e seu controle é a caracterização de diferenças genéticas entre populações. O objetivo desse trabalho foi analisar a variabilidade genética entre populações de S. frugiperda de ocorrência em diferentes regiões do Brasil nas culturas de milho e algodão utilizando-se marcadores RAPD e diferenciar essas populações por meio de um marcador do DNA...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Spodoptera frugiperda; Zea mays; Grossypium; RAPD; Variabilidade genética; Planta hospedeira; Praga; Lagarta-do-cartucho.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/188711
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Análise da variabilidade genética de uma população de Anticarsia gemmatalis (Lepidoptera: Noctuidae) por meio de marcadores moleculares RAPD. Infoteca-e
MARTINS, E. S.; QUEIROZ, P. R.; LIMA, L. H. C.; MONNERAT, R. G..
2005
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Anticarsia gemmatalis; Insecta; RAPD; Caracterização molecular.
Ano: 2005 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/186381
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Análise da variabilidade genética dos isolados de Thielaviopsis paradoxa e detecção no solo por PCR em tempo real. Repositório Alice
SANTOS, A. L. P.; DINIZ, L. E. C..
2013
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coco; RAPD; Resinose.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/975964
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Análise de RAPD em calos, plantas regeneradas e "seedlings" de milho (Zea mays L.). Repositório Alice
VASCONCELOS, M. J. V.; CARVALHO, C.H.S. de; PAIVA, E.; GUIMARAES, C.T.; MACHADO, M.A.; BARROS, E.G..
1993
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Milho; Biotecnologia; RAPD; Zea mays; Maize; Biotechnology; Seedlings.
Ano: 1993 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/482779
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Análise genética em populações de Butia eriospatha (Mart. ex Drude) Becc utilizando marcadores moleculares RAPD. Infoteca-e
GAVIÃO, C. F. C.; SUJII, P. S.; INGLIS, P. W.; CIAMPI, A. Y..
2007
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Butia eriospatha; Marcadores moleculares; RAPD; Análise genética.
Ano: 2007 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188806
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Análise genética populacional de Tabebuia impetiginosa utilizando marcadores moleculares RAPD. Infoteca-e
CIAMPI, A. Y.; AZEVEDO, V. C. R.; SILVA, V. P. da..
2003
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Tabebuia impetiginosa; Ipê roxo; Marcadores moleculares; RAPD; Conservação.
Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/185292
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Análise preliminar a diversidade entre plantas de crajiru mantidas na coleção de plantas medicinais aromáticas e condimentares da Embrapa Amazônia Ocidental. Repositório Alice
CARVALHO, N. D. M.; ANGELO, P. C. da S.; CHAVES, F. C. M..
2009
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Plantas medicinais; Diversidade genética; Polimorfismo; RAPD; Crajiru.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/748710
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ANALYSES OF GENETIC VARIABILITY IN LENTINULA EDODES THROUGH MYCELIA RESPONSES TO DIFFERENT ABIOTIC CONDITIONS AND RAPD MOLECULAR MARKERS BJM
Maki,Cristina Sayuri; Teixeira,Flavia França; Paiva,Edilson; Paccola-Meirelles,Luzia Doretto.
The growth of thirty-four Lentinula edodes strains submitted to different mycelial cultivation conditions (pH and temperature) was evaluated and strain variability was assessed by RAPD molecular markers. The growth at three pH values (5, 6 and 7) and four different temperatures (16, 25, 28 and 37ºC) was measured using the in vitro mycelial development rate and water retention as parameters. Mycelial cultivation was successful at all pH tested, while the ideal temperature for mycelial cultivation ranged between 25 and 28ºC. The water content was lower in strains grown at 37ºC. Among 20 OPA primers (Operon Technologies, Inc.) used for the RAPD analyses, seventeen presented good polymorphism (OPA01 to OPA05, OPA07 to OPA14, OPA17 to OPA20). The clustering...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Edible mushroom; RAPD; Mycelial growth.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822001000300002
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Analysis by RAPD of the genetic structure of Astyanax altiparanae (Pisces, Characiformes) in reservoirs on the Paranapanema River, Brazil Genet. Mol. Biol.
Leuzzi,Maria Sueli Papa; Almeida,Fernanda Simões de; Orsi,Mário Luís; Sodré,Leda Maria Koelblinger.
In this study, the RAPD technique was used to analyze the genetic structure of populations of the fish Astyanax altiparanae (Characidae, Tetragonopterinae) living in the lower, middle and upper Paranapanema River, Brazil. The aim was to assess this structure regarding fish handling and conservation programs. The genetic variability (P) was found to be 42.64%, 75% and 75% in the low, middle and upper reaches, respectively. The dendrogram of genetic similarity, obtained by comparative analysis of the sets of samples from the three sites, showed the formation of three clusters. All of the genetic parameters used indicate that the population in the lower Paranapanema is genetically different from those in the middle and upper sections. The theta P test shows...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Astyanax altiparanae; RAPD; Genetic structure; Genetic conservation; Fish.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572004000300009
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Analysis of genetic diversity among Indian niger [Guizotia abyssinica (L. f.) Cass.] cultivars based on randomly amplified polymorphic DNA markers Electron. J. Biotechnol.
Nagella,Praveen; Hosakatte,Niranjana Murthy; Ravishankar,K.V.; Hahn,Eun-Joo; Paek,Kee-Yoeup.
Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used to estimate genetic diversity among 18 cultivars of niger from India. Total genomic DNA was extracted and subjected to RAPD analysis using 80 arbitrary 10-mer primers; 17 primers were selected, which yielded a total of 124 bands, 41.20% of them polymorphic. None of the primers produced unique banding pattern for each cultivar. RAPD data were used to calculate a Squared-Euclidean Distance matrix which revealed a minimum genetic distance between cultivars JNC-6 and N-48 and a maximum distance between IGP-76 and JN-30. Based on the distance matrix, a cluster analysis was done using a minimum variance algorithm. The dendrogram generated, based on Ward’s method, grouped 18 niger cultivars...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Genetic diversity; Guizotia abyssinica; Molecular markers; RAPD.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582008000100014
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Analysis of in vitro rooting capacity of Calophyllum brasiliense through RAPD markers. Repositório Alice
SILVEIRA, S. S.; SCHUHLI, G. S. e; DEGENHARDT-GOLDBACH, J.; QUOIRIN, M. G. G..
Marcadores RAPD (Random amplified polymorphic DNA) são simples, eficientes, baratos e não requerem conhecimento prévio do genoma do organismo estudado, o que é particularmente importante para espécies nativas. O objetivo deste estudo é identificar marcadores moleculares que possam ser usados para caracterizar genótipos responsivos às auxinas usadas para induzir o enraizamento in vitro de explantes de guanandi (Calophyllum brasiliense). Amostras de DNA foram extraídas de folhas de plantas mantidas em casa de vegetação e plantas micropropagadas após a fase de enraizamento. Quatro primers foram usados e 26 loci encontrados, dois quais 21 são polimórficos (87.5%), com um número de alelos observado de 1.87 e efetivo de 1.39. A diversidade genética de Nei foi...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Calophyllum brasiliense; Guanandi; Cultura in vitro; Polivinilpirrolidona; Marcador molecular; RAPD.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1059482
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Analysis of molecular and morphological diversity of Arbutus unedo in the interior North and Center of Portugal. IPB - Escola Superior Agrária
Lopes, Lucas; Sá, Olga; Baltasar, José Luís; Pereira, J.A.; Baptista, Paula.
In the Mediterranean Basin, the strawberry tree (Arbutus unedo L.) has medicinal, ornamental, economical, and environmental importance. During the last decades, several occurrences have caused the decline of the strawberry tree in Portugal being replaced by other species. In this context, the knowledge of genetic variability in the wild populations is essential for a proper conservation. This work aimed to characterize genetically and morphological 38 A. unedo genotypes, 30 of which located in Trás-os-Montes e Alto Douro region, and the remaining 8 genotypes in Beira Interior region, to assess their biodiversity. The genetic diversity was assessing by RAPD (Random Amplification of Polymorphic DNA) markers. The dendrogram was obtained from the matrix of...
Tipo: ConferenceObject Palavras-chave: Arbutus unedo; Genetic diversity; RAPD.
Ano: 2010 URL: http://hdl.handle.net/10198/4580
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Aplicabilidade da técnica PCR-RAPD para a determinação do perfil genotipico de variedades de romã (Punica granatum). Repositório Alice
OLIVEIRA, E. M. M.; LIMA, I. S. de.; CARNEIRO, B. T.; NOGUEIRA, R. I.; FREITAS-SILVA, O..
2012
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Romã; Genotipagem; RAPD.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/935878
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Aspectos fenotípicos, genotípicos e de diagnóstico da bactéria A. pleuropneumoniae Ciência Rural
Costa,Mateus Matiuzzi da; Klein,Cátia Silene; Collares,Roberta Mattos; Vaz,Clarissa Silveira Luiz; Balestrim,Raquel; Schrank,Augusto; Silva,Sergio Ceroni da; Piffer,Itamar Antônio; Shrank,Irene Silveira.
A pleuropneumonia suína (PPS) provoca prejuízos significativos na suinocultura no mundo. O agente etiológico é a bactéria Actinobacillus pleuropneumoniae (App), que apresenta 15 sorotipos descritos, os quais variam consideravelmente em relação a sua patogenicidade. Nesse sentido, a precisa caracterização patotípica desta bactéria é de grande importância para a adoção de medidas de controle e profilaxia. O diagnóstico e a sorotipificação deste patógeno são realizados pelas técnicas microbiológicas convencionais. Entretanto, problemas nestes esquemas podem ser observados, especialmente em isolados de rebanhos sem histórico de PPS. No Brasil, diversos esforços vêm sendo aplicados no sentido de desenvolver técnicas moleculares que auxiliem no diagnóstico da...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: A. pleuropneumoniae; Diagnóstico; PCR; RDNA 16S; RAPD.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782004000400057
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