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A host specialized form of Ceratocystis fimbriata causes seed and seedling blight on native Carapa guianensis (andiroba) in Amazonian rainforests. Repositório Alice
VALDETARO, D. C. O. F.; HARRINGTON, T. C.; OLIVEIRA, L. S. S.; GUIMARÃES, L. M. S.; MCNEW, D. L.; PIMENTA, L. V. A.; GONCALVES, R. C.; SCHURT, D. A.; ALFENAS, A. C..
Ceratocystis fimbriata Ellis & Halsted recently was recorded causing seed and seedling blight on Carapa guianensis Aubl. (andiroba), a tree species native to the Amazon Rainforest and prized for its valuable timber and medicinal seed oil. C. fimbriata more commonly causes wilt type diseases in woody hosts, especially on non-native host trees. However, on andiroba the disease occurs on seedlings and seeds, affecting the species regeneration. We studied 73 isolates of C. fimbriata on andiroba from three regions of the Amazon Basin to see if they represented natural or introduced populations. Analysis of ITS rDNA sequences and phylogenetic analysis of mating type genes revealed new haplotypes of C. fimbriata from the Latin American Clade that were closely...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Produto florestal não madeireiro (PFNM); Enfermedades fungales de las plantas; Plantas de semilleros; Semillas; Variación genética; Repeticiones de microsatélite; Marcador microssatélite; Stem blight; Tizón del tallo; Andiroba; Carapa Guianensis; Doença Fúngica; Fungo; Ceratocystis Fimbriata; Plântula; Semente; Variação Genética; Marcador Genético; Nontimber forest products; Fungal diseases of plants; Seedlings; Seeds; Genetic variation; Genetic markers; Microsatellite repeats.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107239
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Avaliação da transferibilidade para Euterpe precatoria de marcadores microssatélites desenvolvidos para Euterpe edulis. Repositório Alice
AZEVEDO, H. S. F. da S.; RUFINO, P. B.; CAVALCANTE, L. do N.; AZEVEDO, J. M. A. de; WADT, L. H. de O.; CAMPOS, T. de.
Euterpe precatoria, conhecido popularmente como açaí-solteiro apresenta potencial agronômico, tecnológico e econômico e vem ganhando destaque pela comercialização de seus frutos. A produção desse açaizeiro está baseada no extrativismo e por isso práticas de manejo têm sido recomendadas para uma coleta sustentável. Para se recomendar taxas sustentáveis de coleta dos frutos, é fundamental se ter informações sobre a variabilidade genética das populações naturais O açaizeiro apresenta grande importância, devido à crescente demanda por seus frutos nos mercados consumidores: local, regional e nacional. Esta crescente procura, faz com que seja incentivado estudos de diversidade e estrutura genética de populações de açaizeiros nativos, visando a conservação, uma...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Manejo sustentável; Agricultura sustentable; Variación genética; Repeticiones de microsatélite; Novo Segredo; Formoso; Terra Indígena Kaxinawá de Nova Olinda (TIKNO); Feijó (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental; Melhoramento Genético Vegetal; Açaí; Euterpe Edulis; Variação Genética; Fruto; Marcador Genético; Sustainable agriculture; Plant breeding; Euterpe precatoria; Arecaceae; Genetic variation; Genetic markers; Microsatellite repeats.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107227
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Caracterização agronômica e molecular de acessos de Citrus sunki do banco de germoplasma de citros do Centro APTA Citros Sylvio Moreira. Repositório Alice
SCHINOR, E. H.; SIVIERO, A.; CRISTOFANI-YALY, M.; MARENGO, S.; POMPEU JUNIOR, J.; MACHADO, M. A..
Este trabalho objetivou caracterizar e avaliar acessos de tangerina Sunki (Citrus sunki Hort. ex Tan.) e assemelhados, pertencentes ao Banco Ativo de Germoplasma de Citros do Centro APTA Citros Sylvio Moreira/IAC, Cordeirópolis, SP. Foram avaliadas características agronômicas: altura (A), diâmetro (D), relação A/D, massa e número de gomos dos frutos, número de sementes viáveis e abortadas, comprimento e diâmetro das sementes, número de embriões e características de suco dos frutos: rendimento de suco, sólidos solúveis, acidez total, ratio e sólidos solúveis por caixa (40,8 kg de frutos). Para as análises moleculares foram utilizados DNA genômico total extraído de folhas frescas, acessando-se polimorfismo genético mediante emprego de 11 pares de iniciadores...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Tangerina sunki; Citrus sunki; Marcador microssatélite; Tangerina; Características agronômicas; Marcador genético; Tangerines; Agronomic traits; Genetic markers; Microsatellite repeats; Tangerinos; Características agronómicas; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/912077
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Caracterização agronômica e molecular de genótipos diplóides melhorados de bananeira. Repositório Alice
AMORIM, E. P.; LESSA, L. S.; LEDO, C. A. da S.; AMORIM, V. B. de O.; REIS, R. V. dos; SEREJO, J. A. dos S.; SILVA, S. de O. e.
Uma investigação sobre a diversidade genética entre 11 diplóides melhorados de bananeira, por meio de nove características agronômicas e 16 marcadores microssatélites, foi implementada na Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, Cruz das Almas (BA), Brasil. A distância generalizada de Mahalanobis indicou alto grau de divergência genética. Os genótipos foram agrupados em três grupos. As características altura de planta, número de pencas, número de frutos e diâmetro do pseudocaule contribuíram com grande parte da divergência genética observada. O número de alelos obtidos foi 120, com média de 7,51 alelos por primer. A similaridade genética média foi de 0,44, variando de 0,29 a 0,60. Novas combinações parentais podem ser identificadas com base na divergência...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Marcador microssatélite; Melhoramento genético vegetal; Banana; Musa sp; Híbrido; Características agronômicas; Variação genética; Marcador molecular; Plant breeding; Agronomic traits; Genetic variation; Genetic markers; Microsatellite repeats; Bananos; Fitomejoramiento; Características agronómicas; Variación genética; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/631702
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Caracterização da diversidade genética de acessos do banco de germoplasma de seringueira. Repositório Alice
SOUZA, C. S. de.
A seringueira (Hevea brasiliensis) é uma planta popularmente conhecida por ser a principal fonte de borracha natural. Assim, é fundamental que este recurso genético esteja devidamente avaliado e caracterizado. O objetivo desse trabalho foi caracterizar por meio de marcadores microssatélites a diversidade genética de acessos do banco de germoplasma de seringueira da Embrapa Amazônia Ocidental, Embrapa Amazônia Oriental e Embrapa Cerrados. Foram amostrados 318 acessos, pertencentes às espécies Hevea brasiliensis, Hevea pauciflora, Hevea rigidifolia e híbridos interespecíficos. Foram testados 10 marcadores microssatélites. Os produtos amplificados foram genotipados em sequenciador automático. As estimativas genéticas estimadas foram: heterozigosidade esperada...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Marcador microssatélite; Ruber tree; Árbol de goma; Hevea pauciflora; Hevea rigidifolia; Fitomejoramiento; Variación genética; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; Seringueira; Hevea Brasiliensis; Melhoramento Genético Vegetal; Variação Genética; Marcador Genético; Genótipo; Polimorfismo Genético; Plant breeding; Genetic variation; Genetic markers; Genotype; Genetic polymorphism; Microsatellite repeats.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1091127
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Development of expressed sequence tag and expressed sequence tag-simple sequence repeat marker resources for Musa acuminata. Repositório Alice
PASSOS, M. A. N.; CRUZ, V. de O.; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. de C.; SOUZA JUNIOR, M. T.; MATSUMOTO, T.; AZEVEDO, V. C. R.; FERREIRA, C. F.; AMORIM, E. P.; FIGUEIREDO, L. F. de A.; MARTINS, N. F.; CAVALCANTE, M. de J. B.; BAURENS, F. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PIGNOLET, L.; ABADIE, C.; CIAMPI, A. Y.; PIFFANELLI, P.; MILLER, R. N. G..
Banana (Musa acuminata) is a crop contributing to global food security. Many varieties lack resistance to biotic stresses, due to sterility and narrow genetic background. The objective of this study was to develop an expressed sequence tag (EST) database of transcripts expressed during compatible and incompatible banana-Mycosphaerella fijiensis (Mf) interactions. Black leaf streak disease (BLSD), caused by Mf, is a destructive disease of banana. Microsatellite markers were developed as a resource for crop improvement.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Plátano; Marcador microssatélite; Melhoramento genético vegetal; Banana; Musa acuminata; Marcador genético; Variedade resistente; Doença de planta; Melhoramento vegetal; Fungo; Sigatoka negra; Mycosphaerella fijiensis; Plant breedind; Bananas; Genetic markers; Microsatellite repeats; Plant diseases and disorders; Firomejoramiento; Fungi; Black sigatoka; Bananos; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; Enfermedades y desórdenes de las plantas.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/953929
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Development of microsatellite markers in Guineagrass (Panicum maximum Jacq.) and their transferability to other tropical forage grass species. Repositório Alice
SOUSA, A. C. B.; JUNGMANN, L.; CAMPOS, T. de; SFORÇA, D. A.; BOAVENTURA, L. R.; SILVA, G. M. B.; ZUCCHI, M. I.; JANK, L.; SOUZA, A. P..
The Guineagrass (Panicum maximum Jacq.) is one of the most important tropical forage grasses, but genetic knowledge and tools regarding this species are still limited. Therefore, 20 novel polymorphic microsatellite markers were developed, validated, and employed in estimating genetic relationships among 25 P. maximum genotypes selected from a Brazilian germplasm collection. In addition, they were tested for cross-species amplification in four other forage grass species. The number of alleles observed for each locus ranged from 4 to 12 (average 6.7). The values of polymorphism information content (PIC) varied from 0.41 to 0.83 (average 0.61) and the discriminating power (D) ranged from 0.53 to 0.98 (average 0.72). Cross-amplification demonstrated the...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Capim Tanzânia; Guineagrass; Marcador microssatélite; Amplificação cruzada; Melhoramento genético vegetal; Gramínea forrageira; Capim Colonião; Panicum maximum; Seleção genótipa; Variação genética; Marcador genético; Polimorfismo genético; Plant breeding; Forage grasses; Megathyrsus maximus; Genotype; Genetic variation; Genetic markers; Microsatellite repeats; Genetic polymorphism; Fitomejoramiento; Pastos forrajeros; Variación genética; Genotipo; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/901385
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Diversidade e estrutura genética de Swietenia macrophylla King em floresta manejada na Amazônia sul-ocidental. Repositório Alice
OLIVEIRA, S. S. de.
Swietenia macrophylla King é uma espécie monoica, alógama, e ameaçada de extinção com alto valor econômico para a indústria madeireira. O objetivo desse estudo foi conhecer a diversidade e estrutura genética de Swietenia macrophylla King em floresta manejada na Amazônia Sul-Ocidental. Foram coletados material vegetal de 83 indivíduos adultos e 187 juvenis. Foram testatos 12 marcadores microssatélites para a caracterização da diversidade e estruturação genética espacial. Foi realizada a análise de parentesco pela determinação dos padrões de fluxo de pólen e distância de dispersão. Foi estimada a taxa efetiva de autofecundação, a taxa de cruzamento de indivíduos aparentados e não aparentados. Foi avaliado o sistema reprodutivo da espécie com base no método...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Fitomejoramiento; Variación genética; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; Amazônia Sul-Ocidental; Melhoramento Genético Vegetal; Variação Genética; Endogamia; Mogno; Swietenia Macrophylla; Marcador Molecular; Plant breeding; Genetic variation; Inbreeding; Genetic markers; Microsatellite repeats.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110195
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Diversidade genética de açaizeiro (Euterpe precatoria) no município de Feijó, Acre. Repositório Alice
BENVINDO, F. D.; CAVALCANTE, L. do N.; AZÊVEDO, H. S. F. da S.; CAMPOS, T. de.
A espécie Euterpe precatoria, conhecida como açaí-solteiro, ocorre nos estados do norte do Brasil, onde possui grande potencial econômico e agronômico por produzir o "suco de açaí". O estudo teve como objetivo avaliar a diversidade genética de uma população natural de açaizeiro (E. precatoria), no município de Feijó, Acre.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Marcador microssatélite; Feijó (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental; Melhoramento genético vegetal; Açaí; Variação genética; Marcador genético; Euterpe precatoria; Plant breeding; Genetic variation; Genetic markers; Microsatellite repeats; Fitomejoramiento; Variación genética; Repeticiones de microsatélite.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1090146
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Diversidade genética de acessos do banco de germoplasma de amendoim forrageiro. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. de; RUFINO, P. B.; AZÊVEDO, H. S. da S.; SILVA, L. M. da; ASSIS, G. M. L. de; CAMPOS, T. de.
O amendoim forrageiro (Arachis pintoi) é uma leguminosa pertencente à família Fabaceae e tem sido utilizado em consorciação de pastagens, agregando as mesmas alto valor nutritivo e produção de forragem, além da fixação biológica de nitrogênio, reduzindo os custos do produtor. O objetivo do estudo foi analisar a diversidade genética de genótipos de amendoim forrageiro por meio de marcadores microssatélites (SSR).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Amendoim forrageiro; Forage peanuts; Cacauhetes forrajeros; Marcador microssatélite; Banco de germoplasma; Embrapa Acre; Rio Branco (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental; Melhoramento genético vegetal; Leguminosa forrageira; Variação genética; Marcador genético; Plant breeding; Forage legumes; Arachis pintoi; Genetic variation; Microsatellite repeats; Fitomejoramiento; Leguminosas forrajeras; Variación genética; Repeticiones de microsatélite.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075144
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Estudo da diversidade genética de populações naturais de açaizeiro (Euterpe precatoria Mart.). Repositório Alice
AZÊVEDO, H. S. F. da S..
Entre os recursos genéticos da Amazônia, o açaizeiro, Euterpe precatoria, destaca-se em função do valor agronômico, econômico, social e cultural associado principalmente a extração e comercialização da polpa do açaí. A caracterização genética de populações naturais poderá auxiliar no desenvolvimento e recomendação de práticas de manejo e estratégias adequadas de conservação da espécie. Os objetivos deste estudo foram avaliar métodos de preservação e maceração de folíolos de E. precatoria para a obtenção de DNA; testar a transferibilidade de microssatélites de E. edulis para E. precatoria e avaliar a diversidade e estrutura genética espacial (EGE) de populações de E. precatoria em floresta de terra firme e baixio. Foram testados 12 tratamentos de...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Variación genética; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; Marcador microssatélite; Fitomejoramiento; Açaí; Variação Genética; Marcador Molecular; Melhoramento Genético Vegetal; Euterpe precatoria; Genetic variation; Genetic markers; Microsatellite repeats; Plant breeding.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1109695
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Extração e amplificação de DNA e diversidade genética de açaí-solteiro. Repositório Alice
CAVALCANTE, L. do N.; BENVINDO, F. D.; AZÊVEDO, H. S. F. da S.; SILVA, S. M. M.; SILVA, L. M. da; CAMPOS, T. de.
Euterpe precatoria é uma espécie de grande importância econômica e muito utilizada como alimento pelos povos da região Amazônica. O objetivo do estudo foi avaliar extração e amplificação de DNA e a diversidade genética de E. precatoria. O estudo foi realizado em 25 indivíduos. O DNA extraído foi quantificado em gel de agarose 1% e realizado teste de temperaturas de anelamento para amplificação em oito locos. A diversidade genética foi estimada pelos parâmetros: Heterozigosidade Observada (Ho), Esperada (He), Número de Alelos (N) e o conteúdo de Polimorfismo (PIC). As distâncias genéticas de Rogers foram calculadas e usadas na construção do dendrograma. As quantidades de DNA variaram de 20ng/ul a 300ng/ul. Os valores de (He) variaram de 0,129 a 0,682 e os...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Marcador microssatélite; Açaí; Variação genética; Marcador molecular; Euterpe precatoria; Genetic variation; Genetic markers; Microsatellite repeats; Variación genética; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1088202
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Genetic diversity in cultivated carioca common beans based on molecular marker analysis. Repositório Alice
PERSEGUINI, J. M. C. K.; CHIORATTO, A. F.; ZUCCHI, M. I.; COLOMBO, C. A.; CARBONELL, S. A. M.; MONDEGO, J. M. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; CAMPOS, T. de; SOUZA, A. P. de; RUBIANO, L. B..
A wide array of molecular markers has been used to investigate the genetic diversity among common bean species. However, the best combination of markers for studying such diversity among common bean cultivars has yet to be determined. Few reports have examined the genetic diversity of the carioca bean, commercially one of the most important common beans in Brazil. In this study, we examined the usefulness of two molecular marker systems (simple sequence repeats - SSRs and amplified fragment length polymorphisms - AFLPs) for assessing the genetic diversity of carioca beans. The amount of information provided by Roger?s modified genetic distance was used to analyze SSR data and Jaccards similarity coefficient was used for AFLP data. Seventy SSRs were...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Marcador microssatélite; Feijão carioca; Melhoramento genético vegetal; Feijão; Phaseolus vulgaris; Variação genética; Marcador genético; Polimorfismo genético; Plant breeding; Beans; Genetic variation; Genetic markers; Microsatellite repeats; Genetic polymorphism; Fitomejoramiento; Frijoles; Variación genética; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/902577
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Genetic diversity of the forage peanut in the Jequitinhonha, São Francisco, and Paranã River valleys of Brazil. Repositório Alice
AZÊVEDO, H. S. F. S.; SOUSA, A. C. B.; MARTINS, K.; OLIVEIRA, J. C.; TEIXEIRA, R. B.; SILVA, L. M. da; VALLS, J. F. M.; ASSIS, G. M. L. de; CAMPOS, T. de.
Arachis pintoi and A. repens are legumes with a high forage value that are used to feed ruminants in consortium systems. Not only do they increase the persistence and quality of pastures, they are also used for ornamental and green cover. The objective of this study was to analyze microsatellite markers in order to access the genetic diversity of 65 forage peanut germplasm accessions in the section Caulorrhizae of the genus Arachis in the Jequitinhonha, São Francisco and Paranã River valleys of Brazil. Fifty-seven accessions of A. pintoi and eight of A. repens were analyzed using 17 microsatellites, and the observed heterozygosity (HO), expected heterozygosity (HE), number of alleles per locus, discriminatory power, and polymorphism information content...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Amendoim forrageiro; Forage peanut; Arachis repens; Marcador microssatélite; Vale do Jequitinhonha; Vale do Rio São Francisco; Vale do Rio Paraná; Pastagem; Leguminosa forrageira; Variação genética; Marcador genético; Pastures; Forage legumes; Arachis pintoi; Genetic variation; Genetic markers; Microsatellite repeats; Pastizales; Leguminosas forrajeras; Variación genética; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1052708
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Genetic structure of Bertholletia excelsa populations from the Amazon at different spatial scales. Repositório Alice
SUJII, P. S.; MARTINS, K.; WADT, L. H. de O.; AZEVEDO, V. C. R.; SOLFERINI, V. N..
Population genetic structure and genetic diversity levels are important issues to understand population dynamics and to guide forest management plans. The Brazil nut tree (Bertholletia excelsa Bonpl.) is an endemic species, widely distributed through Amazonian upland forests and also an important species for the local extractive economy. Our aim was to analyze the genetic structure of Brazil nut trees at both fine and large scales throughout the Amazon Basin, contributing to the knowledge base on this species and to generate information to support plans for its conservation. We genotyped individuals from nine sites distributed in five regions of the Brazilian Amazon using 11 microsatellite loci. We found an excess of heterozygotes in most populations, with...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Marcador microssatélite; Melhoramento genético vegetal; Essência florestal; Castanha do pará; Bertholletia excelsa; Variação genética; Dinâmica populacional; Marcador genético; Plant breeding; Tropical wood; Brazil nuts; Genetic variation; Population dynamics; Genetic markers; Microsatellite repeats; Fitomejoramiento; Madera tropical; Nuez del Brasil; Variación genética; Dinámica poblacional; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1015836
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Inheritance of growth habit detected by genetic linkage analysis using microsatellites in the common bean (Phaseolus vulgaris L.). Repositório Alice
CAMPOS, T. de; OBLESSUC, P. R.; SFORÇA, D. A.; CARDOSO, J. M. K.; BARONI, R. M.; SOUSA, A. C. B. de; CARBONELL, S. A. M.; CHIORATTO, A. F.; GARCIA, A. A. F.; RUBIANO, L. B.; SOUZA, A. P. de.
The genetic linkage map for the common bean (Phaseolus vulgaris L.) is a valuable tool for breeding programs. Breeders provide new cultivars that meet the requirements of farmers and consumers, such as seed color, seed size, maturity, and growth habit. A genetic study was conducted to examine the genetics behind certain qualitative traits. Growth habit is usually described as a recessive trait inherited by a single gene, and there is no consensus about the position of the locus. The aim of this study was to develop a new genetic linkage map using genic and genomic microsatellite markers and three morphological traits: growth habit, flower color, and pod tip shape. A mapping population consisting of 380 recombinant F10 lines was generated from IAC-UNA ×...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Marcador microssatélite; Melhoramento genético vegetal; Feijão; Phaseolus vulgaris; Características agronômicas; Crescimento; Interação genética; Mapa; Marcador genético; Plant breeding; Beans; Agronomic traits; Growth habit; Chromosome mapping; Microsatellite repeats; Fitomejoramiento; Frijoles; Características agronómicas; Hábito de crecimiento; Mapeo de cromosomas; Repeticiones de microsatélite.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/902568
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Isolation of microsatellite loci in the Amazon sailfin catfish Pterygoplichlhys pardalis (Castelneau, 1855) (Teleostei: Loricariidae). Repositório Alice
PEREIRA, R. P.; SANTOS, C. H. dos A. dos; NASCIMENTO, P. R. M.; CLÍMACO, G. T.; SOUSA, A. C. B.; CAMPOS, T. de; VERGUEIRO-JÚNIOR, A. M. K.; PAULA-SILVA, M. N.; ALMEIDA-VAL, V. M. F..
Pterygoplichlhys pardalis is an important freshwater ornamental fish in the Amazon Basin. Studies involving populations of P. pardalis are of great importance for the conservation and management of this species. We developed nine microsatellite loci and applied them to investigate the genetic variation of 20 wild individuals from floodplain lakes of the Solimões river. The number of alleles per locus ranged from 2 to 12, with an average of 6.6. The observed and expected heterozygosity values ranged from 0.400 to 0.923 (average 0.706) and from 0.358 to 0.895 (average 0.692), respectively. The value of f ranged from -0.532 to 0.467 (average 0.032). One locus (Pp07) significantly deviated from Hardy-Weinberg equilibrium after Bonferroni correction (P: (5...
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Peixe ornamental; Peixe gato da índia; Pterygoplichlhys pardalis; Marcador microssatélite; Bacia Amazônica; Melhorameno genético animal; Peixe ornamental; Variação genética; Marcador genético; Animal genetics; Ornamental fish; Microsatellite repeats; Genetic variation; Genética animal; Peces ornamentales; Variación genética; Repeticiones de microsatélite.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/941411
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Isolation of novel microsatellite markers for tambaqui (Colossoma macropomum, Cuvier 1818), an important freshwater fish of the Amazon. Repositório Alice
SANTANA, G. X.; SANTOS, C. H. A.; SOUSA, C. F. S.; NASCIMENTO, P. R. M.; PAULA-SILVA, M. N.; SOUSA, A. C. B.; CAMPOS, T. de; ALMEIDA-VAL, V. M. F..
Colossoma macropomum is an endemic species from Amazon basin. It is widely commercialized as food, becoming one of the main items in Amazonian fisheries. Despite its economic importance, genetic information of small captivity populations is not currently available. The present contribution describes 14 new microsatellite loci used to analyze 30 individuals of C. macropomum. The number of alleles for each locus ranged from 4 to 24. The observed (Ho) and expected (HE) heterozygosity values ranged from 0.318 to 1.000 and 0.729 to 0.949, respectively. Out of 14 polymorphic loci, nine did not deviate from Hardy-Weinberg Equilibrium after Bonferroni correction. These new microsatellite loci will contribute towards the genetic of small artificial populations, as...
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Marcador microssatélite; Peixe de água doce; Tambaqui; Colossoma macropomum; Variação genética; Marcador genético; Colossoma; Freshwater fish; Genetic variation; Microsatellite repeats; Pez de agua dulce; Variación genética; Repeticiones de microsatélite.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/930387
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Leaf-, panel- and latex-expressed sequenced tags from the rubber tree (Hevea brasiliensis) under cold-stressed and suboptimal growing conditions: the development of gene-targeted Functional markers for stress response. Repositório Alice
SILVA, C. C.; MANTELLO, C. C.; CAMPOS, T. de; SOUZA, L. M.; GONÇALVES, P. S.; SOUZA, A. P..
Hevea brasiliensis is a native species of the Amazon Basin of South America and the primary source of natural rubber worldwide. Due to the occurrence of South American Leaf Blight disease in this area, rubber plantations have been extended to suboptimal regions. Rubber tree breeding is time-consuming and expensive, but molecular markers can serve as a tool for early valuation, thus reducing time and costs. In this work, we constructed six different cDNA libraries with the aim of developing gene-targeted molecular markers for the rubber tree. A total of 8,263 reads were assembled, generating 5,025 unigenes that were analyzed; 912 expressed sequence tags (ESTs) represented new transcripts, and two sequences were highly up-regulated by cold stress. These...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Marcador SNP; Rubber tree; Caucho; Marcador microssatélite; Biblioteca cDNA; CDNA library; Melhoramento genético vegetal; Seringueira; Hevea brasiliensis; Marcador genético; DNA; Plant breeding; Genetic markers; Microsatellite repeats; Fitomejoramiento; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/988256
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Mating system parameters in a high density population of andirobas in the Amazon forest. Repositório Alice
CAMPOS, T. de; CUNHA, M. O. da; SOUSA, A. C. B. de; TEIXEIRA, R. B.; RAPOSO, A.; SEBBENN, A. M.; WADT, L. H. de O..
The objective of this work was to estimate the mating system parameters of a andiroba (Carapa guianensis) population using microsatellite markers and the mixed and correlated mating models. Twelve open-pollinated progeny arrays of 15 individuals were sampled in an area with C. guianensis estimated density of 25.7 trees per hectare. Overall, the species has a mixed reproductive system, with a predominance of outcrossing. The multilocus outcrossing rate (tm = 0.862) was significantly lower than the unity, indicating that self-pollination occurred. The rate of biparental inbreeding was substantial (tm - ts = 0.134) and significantly different from zero. The correlation of selfing within progenies was high (rs = 0.635), indicating variation in the individual...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Marcador microssatélite; Allogamy; Melhoramento genético vegetal; Essência florestal; Andiroba; Carapa guianensis; Reprodução vegetal; Cruzamento; Alogamia; Marcador genético; Plant breeding; Tropical wood; Crossing; Genetic markers; Microsatellite repeats; Fitomejoramiento; Madera tropical; Cruce; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/966022
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