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Associação genômica com maciez de carne na raça Nelore. Repositório Alice
REGITANO, L. C. de A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MUDADU, M. de A.; MOURÃO, G. B.; REDE BIFEQUALI.
As análises do genoma bovino, incluindo mapeamento de QTL (Quantitative Trait Loci), SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) e, mais recentemente, a genotipagem em larga escala, poderão contribuir para a seleção precoce de bovinos. A análise de associação genômica, utilizando dados da genotipagem de 470 animais no Illumina BovineHD BeadChip, identificou regiões associadas com força de cisalhamento medida 24 horas após o abate (P≤ 0,001) nos cromossomos 2, 10, 13, 16 e 21, em famílias de referência da raça Nelore. A análise dos genes localizados nessas regiões associadas com maciez de carne poderá permitir a identificação de genes de efeito maior, que poderão ser usados na seleção assistida por marcadores.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: SNP chip; Carne; Maciez; Raça Nelore; Cisalhamento.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/943050
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Genomic analysis for managing small and endangered populations: a case study in Tyrol Grey cattle. Repositório Alice
MÉSZÁROS, G.; BOISON, S. A.; O'BRIEN, A. M. P.; FERENCAKOVIC, M.; CURIK, I.; SILVA, M. V. G. B.; UTSONOMIYA, Y. T.; GARCIA, J. F.; SÖLKNER, J..
Analysis of genomic data is increasingly becoming part of the livestock industry. Therefore, the routine collection of genomic information would be an invaluable resource for effective management of breeding programs in small, endangered populations. The objective of the paper was to demonstrate how genomic data could be used to analyse (1) linkage disequlibrium (LD), LD decay and the effective population size (NeLD); (2) Inbreeding level and effective population size (NeROH) based on runs of homozygosity (ROH); (3) Prediction of genomic breeding values (GEBV) using small within-breed and genomic information from other breeds. The Tyrol Grey population was used as an example, with the goal to highlight the potential of genomic analyses for small breeds. In...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: SNP chip; Breed management; Endangered breeds; Genomic selection; Linkage disequilibrium; Runs of homozygosity.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1037600
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Population genomics and gene introgression in goat herds naturally adapted to Brazil Rev. Ciênc. Agron.
Moura,Jeane de Oliveira; Campelo,José Elivalto Guimarães; Bajay,Miklos Maximiliano; Sarmento,José Lindenberg Rocha; Araújo,Adriana Mello de.
ABSTRACT The aim of this study was to apply the Illumina 50 K goat SNP Chip to analyse population genomic structure in two herds of Marota goats in the State of Piauí, one private and the other an official conservation herd, and to investigate evidence of genetic erosion in these herds caused by the Anglo-Nubian goat. To that end, 86 Marota and 10 Anglo-Nubian animals were genotyped. Genetic diversity was analysed by comparing minor allele frequency (MAF) in the herds. Population structure and genetic differentiation were evaluated using a Bayesian approach, principal component analysis (PCA) and the fixation index (FST). High genetic differentiation (FST = 0.16) was seen in the Marota population in relation to the Anglo-Nubian. The private herd shared a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: SNP chip; Population structure; Genetic resources.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1806-66902019000300476
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Refinamento de uma região de qtl associada à maciez de carne em bovinos da raça nelore Repositório Alice
DINIZ, W. J. da S.; TIZIOTO, P.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A..
2014
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Shear force; Meat quality; SNP chip.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/998539
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