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Agronomic and molecular analyses for the characterisation of accessions in Tunisian olive germplasm collections Electron. J. Biotechnol.
Taamalli,Wael; Geuna,Filippo; Banfi,Riccardo; Bassi,Daniele; Daoud,Douja; Zarrouk,Mokhtar.
In this study, a total of 14 agronomic traits, five AFLP primer combinations and ten SSR loci were used to describe and to classify a group of Tunisian olive genotypes into groups based on molecular profiles and agronomic traits. The analysis of variance of the agronomical data revealed significant differences among accessions for all measured traits. The mean phenotypic dissimilarity (0.34 with a range of 0.08-0.6) was low in comparison to dissimilarity calculated using AFLP (0.50 with a range of 0.16-0.70) and SSR markers (0.76 with a range 0.35-0.94). The correlation between the agronomical dissimilarity matrix and the matrices of genetic dissimilarity based on SSR and AFLP markers was very weak: 0.156 (p = 0.05) and 0.185 (p = 0.05), respectively. The...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Agronomic traits; AFLP; Olea europaea; SSR.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582006000500002
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Análise da variabilidade genética de linhagens de melão utilizando marcadores moleculares ISSR e SSR. Repositório Alice
CARVALHO, N.; CANELA, F. M.; FERREIRA, M. A.; OLIVEIRA, V. R.; SANTOS, M. F.; BUSO, G. S. C..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pele de sapo; Cucumis melo; Variabilidade genética; ISSR; SSR.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1026269
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Análises de microssatélites em bulk e perfis genéticos para híbridos de milho. Repositório Alice
PADILHA, L.; LOPES, M.M.; VIEIRA, M.G.G.C.; GUIMARAES, C. T..
2004
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Milho; Zea mays; SSR; Bulk de DNA.
Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/488070
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Análises de polimorfismo de marcadores microssatélites em cultivares-elite de Gossypium hirsutum L. Repositório Alice
LUCENA, M. G.; HOFFMANN, L. V.; SILVA, M. G.; PEREIRA, G. S.; BARROSO, P. A. V..
2008
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Marcadores moleculares; SSR; Algodão.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/277924
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Análisis de la diversidad genética de variedades nativas de chile "Poblano" por medio de microsatélites. Colegio de Postgraduados
Contreras Toledo, Aremi Rebeca.
A partir de la domesticación de chile (Capsicum annuum L.) en México, se ha generado una gran diversidad dentro de esta especie en nuestro país, derivada de la selección de los agricultores para diferentes usos, siendo el chile Poblano uno de los más importantes y el más representativo del Estado de Puebla; sin embargo, el rendimiento de chile poblano en esta región ha presentado una reducción en los últimos años, debido, en parte, a la falta de semilla mejorada que debe ser seleccionada con base en las necesidades de los propios productores, existiendo la potencial pérdida de este germoplasma. Los objetivos de este estudio fueron estimar la diversidad genética y determinar sus posibles patrones de distribución, diferenciar grupos genéticos de variedades y...
Palavras-chave: Capsicum annuum; SSR; Polimorfismo; Diferenciación genética; Polymorphism; Genetic differentiation; Maestría; Genética.
Ano: 2011 URL: http://hdl.handle.net/10521/400
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Análisis de la diversidad genética de variedades nativas de chile "Poblano" por medio de microsatélites. Colegio de Postgraduados
Contreras Toledo, Aremi Rebeca.
A partir de la domesticación de chile (Capsicum annuum L.) en México, se ha generado una gran diversidad dentro de esta especie en nuestro país, derivada de la selección de los agricultores para diferentes usos, siendo el chile Poblano uno de los más importantes y el más representativo del Estado de Puebla; sin embargo, el rendimiento de chile poblano en esta región ha presentado una reducción en los últimos años, debido, en parte, a la falta de semilla mejorada que debe ser seleccionada con base en las necesidades de los propios productores, existiendo la potencial pérdida de este germoplasma. Los objetivos de este estudio fueron estimar la diversidad genética y determinar sus posibles patrones de distribución, diferenciar grupos genéticos de variedades y...
Palavras-chave: Capsicum annuum; SSR; Polimorfismo; Diferenciación genética; Polymorphism; Genetic differentiation; Maestría; Genética.
Ano: 2011 URL: http://hdl.handle.net/10521/400
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Analysis of genetic variability of commercial melon cultivars using SSR molecular markers. Repositório Alice
CARVALHO, N.; CANELA, F. M.; LEITE, P. H. S.; FERREIRA, M. A.; OLIVEIRA, V. R.; SANTOS, M. F.; SOUZA, N. O. S.; BUSO, G. S. C..
bitstream/item/166721/1/Genetics-and-Molecular-Research-v.-16-n.-3-2017-CARVALHO-et-al.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Commercial cultivars; SSR; Melão; Marcador molecular; Cucumis melo; Genetic variability; Molecular markers.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1079736
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Assessment of genetic diversity in Venezuelan rice cultivars using simple sequence repeats markers Electron. J. Biotechnol.
Ghneim Herrera,Thaura; Posso Duque,Duina; Pérez Almeida,Iris; Torrealba Núñez,Gelis; Pieters,Alejandro J; Martinez,César P; Tohme,Joe M.
In Venezuela, pedigree analyses indicate that the rice varieties currently under cultivation are closely related. Effective breeding programs, based on knowledge of the genetic diversity of cultivars, are needed to broaden the genetic bases of rice germplasm in the country. In this study, we used a set of 48 simple-sequence-repeat (SSR) markers to assess the genetic diversity of 11 Venezuelan rice cultivars, released by the National Rice Breeding Program between 1978 and 2007. A total of 203 alleles were detected, the number of alleles (NA) per marker ranged from 2 to 9, with an average of 4.23. The average genic diversity (H) over all SSR loci for the 18 genotypes was 0.524, ranging from 0.105 to 0.815. Positive correlations were found between H at each...
Tipo: Journal article Palavras-chave: DNA fingerprinting; Genetic diversity; Rice; SSR.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582008000500003
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Associação genômica ampla na seleção para resistência a Notozulia entreriana em híbridos de brachiaria. Repositório Alice
RAGALZI, C. de M.; JUNGMANN, L.; RESENDE, R. M. S.; TORRES, F. Z. V.; VILELA, M. de M..
A pecuária brasileira é baseada na produção de bovinos em pastos, sendo a cigarrinha-das-pastagens(Notozulia entreriana) uma das pragas de maior impacto econômico, por reduzir a produtividade forrageira. A seleção de gramíneas do gênero Brachiaria resistentes é a forma mais adequada de equacionar esse problema, entretanto, a avaliação fenotípica de inúmeros genótipos, durante a seleção genética em Brachiaria, é laboriosa em um caráter de expressão tardia. Baseados nesses antecedentes, esse estudo teve como objetivos identificar e validar marcadores moleculares do tipo microssatélite (SSR) associados à resistência a N. entreriana em B. brizantha e em híbridos interespecíficos.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Efeitos de marcadores; Poliploidia; SSR; Transferibilidade.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1029877
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Avaliação genotípica de linhagens e cultivares brasileiras e introduzidas da coleção nuclear de arroz da Embrapa por meio da caracterização agronômica e molecular. Repositório Alice
BUENO, L. G.; BRONDANI, C.; COELHO, A. S. G.; BORBA, T. C. O.; OLIVEIRA, J. P..
Avaliar a diversidade genética de linhagens e cultivares brasileira e do exterior da CNAE, por meio de caracteres agronômicos e marcadores moleculares SSR.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Diversidade genética; Caracterização agronômica; Caracterização molecular; SSR; Arroz; Oryza sativa; Germoplasma.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/866754
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Características morfológicas e variabilidade genética de araticum utilizando marcadores RAPD e microssatélites. Repositório Alice
PIRES, M. V. V.; FALEIRO, F. G.; SILVA, J. C. S.; MELO, J. T. de; PEIXOTO, J. R..
Neste trabalho, objetivou-se avaliar a variabilidade genética da coleção de trabalho de acessos de araticum da Embrapa Cerrados e outros materiais próximos ao Distrito Federal, utilizando marcadores moleculares RAPD, microssatélites e análise de características morfológicas. Folhas de 18 acessos de araticum foram coletadas e utilizadas para a extração das amostras de DNA genômico, as quais foram amplificadas para obtenção de marcadores moleculares RAPD e microssatélites. Na análise morfológica, foram avaliadas 23 características dos acessos de araticum. As dissimilaridades genéticas entre os 18 genótipos de araticum evidenciaram a variabilidade genética dos acessos e as análises de agrupamento levaram à formação de três grupos de similaridade....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Marcador molecular; SSR; Caracterização; Distrito Federal; RAPD; Recurso genético; Araticum.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1016554
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Caracterização da diversidade e estrutura genética de acessos do banco ativo de germoplasma e de um teste de progênies de meios-irmãos de polinização aberta de caju. Repositório Alice
LIRA, M.; BUSO, G. S. C.; AMARAL, Z. P. S.; GRATTAPAGLIA, D..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Análise molecular; Diversidade genética; SSR; Anacardium occidentale.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1002753
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Caracterização do Banco de Germoplasma de Videira da Embrapa Semiárido por meio de marcadores moleculares microssatélites. Repositório Alice
LEAO, P. C. de S.; RIAZ, S.; GRAZIANI, R.; DANGL, G. S.; MOTOIKE, S. Y.; WALKER, M. A..
2011
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Banco de Germoplasma da Embrapa Semiárido; Marcadores moleculares microsatélites; Perfis genético-moleculares; SSR; Uva.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/903855
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Caracterização molecular de cultivares de cebola com marcadores microssatélites. Repositório Alice
SANTOS, C. A. F.; OLIVEIRA, V. R.; RODRIGUES, M. A.; RIBEIRO, H. L. C..
Resumo ? O objetivo deste trabalho foi estabelecer padrões alélicos e estimar as distâncias genéticas baseadas em marcador SSR de 44 cultivares de cebola adaptadas às condições de cultivo tropicais e subtropicais do Brasil. Para visualização da similaridade genética, utilizou-se o dendrograma UPGMA gerado da matriz de distâncias do coeficiente de Jaccard, com base em 40 alelos de 13 locos SSR. O DNA total foi extraído pelo método CTAB 2x, e os produtos de PCR foram analisados em géis de poliacrilamida desnaturante 6% e corados com nitrato de prata. O número de pares de bases foi estimado pelo método da mobilidade inversa, com base em regressão de produtos de tamanho conhecido. A média da heterozigosidade dos locos SSR foi 0,58. Os 40 alelos dos 13 locos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Dendrograma; Similaridade; SSR; Allium cepa.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/783469
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Caracterização molecular de linhagens e cultivares da coleção nuclear brasileira do arroz por marcadores SSR. Repositório Alice
BORBA, T. C. O.; BRONDANI, C.; BRONDANI, R. P. V.; RANGEL, P. H. N..
2006
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Linhagem; Marcador; SSR.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/192769
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Caracterização molecular e determinação da diversidade genética entre linhagens de milho tropical. Repositório Alice
IANI, F. C. M.; PADILHA, L.; SOUZA, I. R. P. de; PARENTONI, S. N.; GAMA, E. E. G.; GUIMARAES, P. E. de O.; PACHECO, C. A. P.; MEIRELLES, W. F.; PAIVA, E.; GUIMARAES, C. T..
2006
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Zea mays; Fingerprinting; SSR; Marcadores microssatélites.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/490085
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Caracterização morfológica e molecular de 20 acessos de Paspalum notatum com potencial de uso como gramados. Repositório Alice
VIGNA, B. B. Z.; MATTA, F. de P.; OLIVEIRA, F. A. de; SOUZA, A. P. de; FAVERO, A. P.; GUSMAO, M. R.; SOUZA, F. H. D. de.
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Diversidade genética; SSR; Descritores morfológicos.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1065029
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Caracterização preliminar de acessos de coqueiro-gigante utilizando-se marcadores microssatélites. Repositório Alice
AMORIM, J. A. E.; DINIZ, L. E. C.; MUNIZ, A. V. C. da S.; RAMOS, S. R. R.; TAVARES, M. M. F.; LINS, P. M. P.; ARAGÃO, W. M..
2012
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Cocos nucifera; Diversidade genética; Regeneração de germoplasma; SSR.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/975310
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Certificação da obtenção de híbridos de Paspalum spp. da safra 2014/2015 com o uso de marcadores microssatélites. Repositório Alice
ARAKAKI, J. E.; MATTA, F. de P.; VIGNA, B. B. Z..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: SSR; Paspalum; Forrageira; Forage; Paspalum.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1054246
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Comparative linkage mapping in three guava mapping populations and construction of an integrated reference map in guava. Repositório Alice
RITTER, E.; HERRAN, A.; VALDÉS-INFANTE, J.; RODRÍGUEZ-MEDINA, M. N.; BRICEÑO, A.; FERMIN, G.; SANCHEZ-TEYER, F.; O?CONNOR-SANCHEZ, A.; MUTH, J.; BOIKE, J.; PRÜFER, D.; SANTOS, C. A. F.; SANTOS, I. C. N. dos; RODRIGUES, M. A.; RISTERUCCI, A. M.; BILLOTTE, N.; BECKER, D.; ROHDE, W..
2010
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Goiaba; AFLP; SSR; Psidium guajava; Myrtaceae.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/783602
Registros recuperados: 110
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