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A novel cloning strategy for isolating, genotyping and phenotyping genetic variants of geminiviruses Inra
Urbino, C.; Thébaud, G.; Granier, M.; Blanc, S.; Peterschmitt, M..
Viruses of the genus Begomovirus (Geminiviridae) are emerging economically importantplant viruses with a circular, single-stranded DNA genome. Previous studies have shown thatgeminiviruses and RNA viruses exhibit similar mutation frequencies, although geminivirusesare replicated by host DNA polymerases and RNA viruses by their own virus-encoded error-prone RNA-dependent RNA-polymerase. However, the phenotypic effects of naturallyoccurring mutations have never been extensively investigated in geminiviruses, particularlybecause, to be infectious, cloned viral genomes usually require sub-cloning as complete orpartial tandem repeats into a binary vector from Agrobacterium tumefaciens.Using Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV), we show here that infectivity...
Tipo: Conference Paper Palavras-chave: GEMINIVIRUS; TOMATO YELLOW LEAF CURL VIRUS; TYLCV.
Ano: 2009 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2009b88c5e4&uri=/notices/prodinra1/2010/05/
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Busca por Tomato yellow leaf curl virus e Tomato yellow leaf curl Sardinia virus em tomateiros Horticultura Brasileira
Inoue-Nagata,Alice K.; Navas-Castillo,Jesús; Melo,Paulo C.T. de; Ávila,Antônio C. de.
A doença causada pelo complexo de vírus do tomato yellow leaf curl (TYLC) é muito séria em tomateiro, principalmente na América Central e Europa, e é causada por um complexo de begomovírus monopartidos. A doença torna-se predominante, mesmo em áreas com a presença de outros begomovírus. No Brasil, os problemas advindos da infecção por begomovírus uram entre os principais fatores de perdas e oneração de custos. A introdução do complexo TYLC representa uma grande ameaça para os produtores. Este estudo visou a realização de testes de detecção baseados em reação de polimerase em cadeia (PCR) e hibridização específicos em amostras suspeitas coletadas no estado de São Paulo. Um total de 46 amostras com sintomas lembrando aqueles causados pelo complexo TYLC foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Lycopersicon esculentum; Geminivírus; TYLCV; TYLCSV.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362004000400027
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CARACTERIZACIÓN BIOQUÍMICA DE SEIS GENOTIPOS PROMISORIOS DE TOMATE OBTENIDOS EN PROGRAMAS DE MEJORAMIENTO GENÉTICO PARA LA RESISTENCIA AL TYLCV Rev. Protección Veg.
Arias,Yailen; González,Ivonne; Pino,Oriela; Sánchez,Yaima; Miranda,Ileana.
El tomate es uno de los cultivos hortícolas más importante a nivel mundial. El virus del encrespamiento amarillo de la hoja del tomate (TYLCV) es uno de los patógenos más agresivos para esta hortaliza. La obtención de variedades resistentes para su manejo, depende de la disponibilidad de materiales promisorios para ser empleados como parentales. Aspectos relacionados con la resistencia de los hospedantes y el efecto de los patógenos sobre el metabolismo de los mismos, han sido estudiados a nivel bioquímico, a través del empleo de las isoenzimas. El objetivo de este trabajo fue caracterizar seis genotipos de tomate obtenidos en programas de mejoramiento a partir de la determinación de las actividades específicas de tres sistemas enzimáticos y el contenido...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Peroxidasa; Polifenoloxidasa; Fenilalanina amonio-liasa; Compuestos fenólicos; Solanum lycopersicum; TYLCV.
Ano: 2011 URL: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1010-27522011000100006
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CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE AISLADOS DE CAMPO DEL VIRUS DEL ENCRESPAMIENTO AMARILLO DE LA HOJA DEL TOMATE (TYLCV) Rev. Protección Veg.
Quiñones,Madelaine; Fonseca,D; Martínez,Yamila.
Los begomovirus constituyen «virus emergentes» de plantas. Debido a las infecciones persistentes en los campos de tomate, las pérdidas ocasionadas por estos virus a la agricultura mundial y a la gran variabilidad informada para muchos de sus miembros, por lo que el objetivo de este trabajo fue caracterizar la variabilidad genética de la población natural del TYLCV predominante en Cuba. Para esto, se secuenciaron 21 aislados de campo del TYLCV, obtenidos de diferentes años y regiones del país. Se utilizaron cebadores específicos para la amplificación y secuenciación de la región intergénica (RI) y del extremo 5` terminal del gen c1 o proteína de la replicación (rep). Las secuencias obtenidas se analizaron mediante programas bioinformáticos para determinar...
Tipo: Journal article Palavras-chave: TYLCV; Begomovirus; Tomate; Variabilidad genética; PCR; Secuenciación; Estructura secundaria.
Ano: 2007 URL: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1010-27522007000100007
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Coexistencia de potyvirus y begomovirus en el cultivo del pimiento (Capsicum annuum L.) en Cuba Rev. Protección Veg.
Quiñones,Madelaine; Martínez,Yamila; Arana,F; Martínez,María de los A; Zamora,Loidy; Miranda,Ileana; Zerbini,F.M.
El objetivo del trabajo fue determinar la distribución de potyvirus y begomovirus en áreas productoras de pimiento (Capsicum annuum L.) en Cuba. Se colectaron 600 muestras con síntomas virales durante el periodo 2006-2010. Las muestras se evaluaron mediante el método UMELISA-DAS utilizando un anticuerpo policlonal a PVY para detectar su presencia y de estas se evaluaron 50 plantas positivas con los cebadores universales (PolyT/Poty 4) en una RT-PCR para confirmar el resultado. También se extrajo el ADN total de las plantas y se analizó mediante la técnica de HAN no radiactiva con una sonda de la región intergénica del TYLCV, cuyos resultados se confirmaron en 50 muestras positivas utilizando una PCR con cebadores genéricos (Palv1978/PARc496). La evaluación...
Tipo: Journal article Palavras-chave: PVY; TYLCV; UMELISA-DAS; PCR; HAN.
Ano: 2013 URL: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1010-27522013000100005
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EMERGENCIA DE BEGOMOVIRUS EN CUBA Rev. Protección Veg.
Martínez,Yamila.
Los begomovirus son patógenos de plantas que en las últimas décadas han causado importantes pérdidas a cultivos de interés económico, en regiones tropicales y subtropicales. En Cuba se han identificado nueve begomovirus afectando cultivos de importancia económica como tomate, fríjol, tabaco, pimiento, calabaza, papa, y malezas de diferentes familias botánicas. En este trabajo se analizaron las secuencias de la región intergénica (RI) y la región N- Terminal de la proteína asociada a la replicación (Rep) de los diferentes begomovirus identificados en Cuba, referidas en el banco de datos de genes (Genebank), utilizando programas estadísticos para los alineamientos, análisis filogenéticos y búsqueda de recombinaciones. La detección de posibles eventos de...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Begomovirus; Recombinaciones; Diversidad genética; TYLCV; Evolución.
Ano: 2008 URL: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1010-27522008000100002
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ESTUDIO DE FACTORES QUE INFLUYEN EN LA EPIFITOLOGÍA DEL COMPLEJO MOSCA BLANCA-GEMINIVIRUS EN LA REGIÓN ORIENTAL DE CUBA Rev. Protección Veg.
Martínez,Yamila; de los A. Martínez,María; Quiñones,Madelaine; Miranda,Ileana; Holt,J; Chancellor,T.
Desde inicios de la década del 90 se estableció en Cuba un programa de manejo integrado del complejo mosca blanca geminivirus en el cultivo del tomate. Sin embargo, aún existe regiones que presentan elevados índices de distribución de begomovirus y en particular del TYLCV-IL(CU). Con el objetivo de evaluar los principales factores que aún provocan severas pérdidas en esta hortaliza en la región oriental se visitaron 28 campos de producción. Los resultados fueron analizados estadísticamente, a través de un análisis de componentes principales, lo que permitió determinar que la elevada severidad de la infección está directamente asociada a la siembra continua de tomate u otros cultivos hospedantes de mosca blanca o de begomovirus y a elevadas densidades de...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Epifitología; Mosca blanca-geminivirus; TYLCV.
Ano: 2009 URL: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1010-27522009000100007
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Impact de la recombinaison dans l'évolution de la pathogénie du Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) Inra
Vuillaume, F.; Urbino, C.; Granier, M.; Blanc, S.; Peterschmitt, M..
L’émergence des virus à ADN est une préoccupation majeure dans les secteurs cliniques, vétérinaires ou agricoles. L’étude des forces évolutives donnant lieu à l’adaptation extrêmement rapide de ces virus (ie. la mutation et l’amphimixie) peut nous aider à mieux comprendre ces phénomènes d’émergence virale. Par la technique du L-Shuffling (Protéus, Nîmes), nous avons à notre disposition une banque de recombinants artificiels obtenue à partir de deux virus parentaux à ADNsb : le Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV, Begomovirus, Geminviridae) et le Tomato leaf curl Mayotte virus (ToLCYTV, Begomovirus, Geminviridae.). L’objectif de cette thèse est d’évaluer l’impact de ces recombinaisons sur l’évolution du pouvoir pathogène du TYLCV. Cette évaluation s’est...
Tipo: Conference Paper Palavras-chave: POUVOIR PATHOGENE; L-SHUFFLING; TYLCV.
Ano: 2009 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2009d2d9f230&uri=/notices/prodinra1/2010/05/
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Mosca-branca e as geminiviroses do tomateiro. Infoteca-e
EMBRAPA. Centro Nacional de Pesquisa de Hortalicas (Brasilia, DF)..
Mosca-branca. Geminiviroses. Controle.
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) Palavras-chave: Geminivirose; Transmissao; Controle; Tomato; Pest; Insect; Whitefly; Disease; Vector; Transmission; Geminiviruse; TLCV; TYLCV; Control.; Bemisia Tabaci; Doença; Inseto; Lycopersicon Esculentum; Mosca Branca; Praga; Tomate; Vetor; Vírus.; Bemisia argentifolii..
Ano: 1996 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/756352
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Pyramiding TYLCV and TSWV resistance genes in tomato genotypes Rev. Protección Veg.
Gómez Consuegra,Olimpia; Piñón Gómez,Mayte; Martínez Zubiaur,Yamila.
The Cuban tomato line LD3 , in which the Ty-1 gene from Solanum chilense LA 1969 was detected, was crossed with an F1 hybrid carrying the genes Ty-3 from S. chilense LA 2779 and Sw-5 from S. peruvianum. A hundred F2 plants were transplanted to a ferralitic soil in the field and the F2 plants individually evaluated in the field with high natural TYLCV-IL (Cu) incidence by using a scale from 0 (no symptom) to 4 (severe stunting). The total DNA extracted from the F2 plants were analyzed per individual plant by using PCR markers linked to the genes Ty-3 (resistance to TYLCV) and Sw-5 (resistance to TSWV) so that both genes could be detected in a same genotype. Eighty two F2 plants showed no symptoms under natural TYLCV incidence (0 symptoms) with a...
Tipo: Journal article Palavras-chave: TYLCV; TSWV; Pyrimiding; Resistance genes; Tomato; Genotypes.
Ano: 2015 URL: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1010-27522015000200011
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VARIABILIDAD GENÉTICA ENTRE GENOTIPOS PROMISORIOSDE TOMATE (Solanum lycopersicum) OBTENIDOS EN PROGRAMASDE MEJORAMIENTO FRENTE AL TYLCV Rev. Protección Veg.
Arias,Yailen; Peteira,Belkis; González,Ivonne; Martínez,Yamila; Miranda,Ileana.
Una de las alternativas más usadas en la actualidad, para el manejo de fitopatógenos, es el empleo de variedades resistentes. La disponibilidad de una amplia variabilidad genética resulta de vital importancia para el éxito de un programa de mejoramiento. Los marcadores moleculares constituyen poderosas herramientas para la caracterización de la diversidad genética. El objetivo del trabajo fue conocer la variabilidad genética entre seis genotipos promisorios de tomate obtenidos en el programa de mejoramiento genético para la resistencia al TYLCV mediante el empleo de los RAPDs. Los resultados obtenidos mostraron, de forma general, una escasa variabilidad entre los genotipos estudiados.
Tipo: Journal article Palavras-chave: TYLCV; Variabilidad genética; RAPD; Solanum lycopersicum.
Ano: 2010 URL: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1010-27522010000300007
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